Skip to main content
CenXiv.org
此网站处于试运行阶段,支持我们!
我们衷心感谢所有贡献者的支持。
贡献
赞助
cenxiv logo > cond-mat > arXiv:2311.05917v1

帮助 | 高级搜索

凝聚态物理 > 软凝聚态物理

arXiv:2311.05917v1 (cond-mat)
[提交于 2023年11月10日 ]

标题: 溶剂化甘氨酸的分子内和水介导的互变异构性

标题: Intramolecular and water mediated tautomerism of solvated glycine

Authors:Pengchao Zhang, Axel Tosello Gardini, Xuefei Xu, Michele Parrinello
摘要: 质子转移互变异构在水中的理解以及溶剂效应对质子平衡的表征面临重大挑战。 利用基于最新深度学习势能的分子动力学模拟和增强采样方法,我们提供了在水中溶剂化的甘氨酸的所有构型转变的全面描述,并确定了这些过程的准确自由能曲线。 我们观察到,溶剂化甘氨酸的中性和两性离子形式之间的互变异构可以通过甘氨酸内的分子内质子转移以及接触离子对(阴离子甘氨酸和水合氢离子)或分离离子对(阳离子甘氨酸和氢氧根离子)中的分子间质子转移发生。
摘要: The understanding of prototropic tautomerism in water and the characterization of solvent effects on protomeric equilibrium pose significant challenges. Using molecular dynamics simulations based on state-of-the-art deep learning potential and enhanced sampling methods, we provide a comprehensive description of all configurational transformations in glycine solvated in water and determine accurate free energy profiles of these processes. We observe that the tautomerism between the neutral and zwitterionic forms of solvated glycine can occur by both intramolecular proton transfer in glycine and intermolecular proton transfer in the contact ion pair (anionic glycine and hydronium ion) or the separated ion pair (cationic glycine and hydroxide ion).
主题: 软凝聚态物理 (cond-mat.soft) ; 化学物理 (physics.chem-ph)
引用方式: arXiv:2311.05917 [cond-mat.soft]
  (或者 arXiv:2311.05917v1 [cond-mat.soft] 对于此版本)
  https://doi.org/10.48550/arXiv.2311.05917
通过 DataCite 发表的 arXiv DOI
相关 DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.4c00273
链接到相关资源的 DOI

提交历史

来自: Pengchao Zhang [查看电子邮件]
[v1] 星期五, 2023 年 11 月 10 日 08:04:54 UTC (18,562 KB)
全文链接:

获取论文:

    查看标题为《》的 PDF
  • 查看中文 PDF
  • 查看 PDF
  • TeX 源代码
  • 其他格式
许可图标 查看许可
当前浏览上下文:
cond-mat.soft
< 上一篇   |   下一篇 >
新的 | 最近的 | 2023-11
切换浏览方式为:
cond-mat
physics
physics.chem-ph

参考文献与引用

  • NASA ADS
  • 谷歌学术搜索
  • 语义学者
a 导出 BibTeX 引用 加载中...

BibTeX 格式的引用

×
数据由提供:

收藏

BibSonomy logo Reddit logo

文献和引用工具

文献资源探索 (什么是资源探索?)
连接的论文 (什么是连接的论文?)
Litmaps (什么是 Litmaps?)
scite 智能引用 (什么是智能引用?)

与本文相关的代码,数据和媒体

alphaXiv (什么是 alphaXiv?)
CatalyzeX 代码查找器 (什么是 CatalyzeX?)
DagsHub (什么是 DagsHub?)
Gotit.pub (什么是 GotitPub?)
Hugging Face (什么是 Huggingface?)
带有代码的论文 (什么是带有代码的论文?)
ScienceCast (什么是 ScienceCast?)

演示

复制 (什么是复制?)
Hugging Face Spaces (什么是 Spaces?)
TXYZ.AI (什么是 TXYZ.AI?)

推荐器和搜索工具

影响之花 (什么是影响之花?)
核心推荐器 (什么是核心?)
IArxiv 推荐器 (什么是 IArxiv?)
  • 作者
  • 地点
  • 机构
  • 主题

arXivLabs:与社区合作伙伴的实验项目

arXivLabs 是一个框架,允许合作伙伴直接在我们的网站上开发和分享新的 arXiv 特性。

与 arXivLabs 合作的个人和组织都接受了我们的价值观,即开放、社区、卓越和用户数据隐私。arXiv 承诺这些价值观,并且只与遵守这些价值观的合作伙伴合作。

有一个为 arXiv 社区增加价值的项目想法吗? 了解更多关于 arXivLabs 的信息.

这篇论文的哪些作者是支持者? | 禁用 MathJax (什么是 MathJax?)
  • 关于
  • 帮助
  • contact arXivClick here to contact arXiv 联系
  • 订阅 arXiv 邮件列表点击这里订阅 订阅
  • 版权
  • 隐私政策
  • 网络无障碍帮助
  • arXiv 运营状态
    通过...获取状态通知 email 或者 slack

京ICP备2025123034号