Skip to main content
CenXiv.org
此网站处于试运行阶段,支持我们!
我们衷心感谢所有贡献者的支持。
贡献
赞助
cenxiv logo > q-bio > arXiv:2501.04822v1

帮助 | 高级搜索

定量生物学 > 基因组学

arXiv:2501.04822v1 (q-bio)
[提交于 2025年1月8日 ]

标题: 经过整理的位点原位编辑(cliPE)用于可访问的多重变异效应分析(MAVEs)

标题: Curated loci prime editing (cliPE) for accessible multiplexed assays of variant effect (MAVEs)

Authors:Carina G Biar, Nicholas Bodkin, Gemma L Carvill, Jeffrey D Calhoun
摘要: 多重变体效应检测(MAVEs)能够同时表征许多变体。 最近,引导编辑已被用于在其天然基因组环境中引入许多变体。 然而,稳健的协议和标准有限,阻碍了广泛应用。 在此,我们描述了经过筛选的位点引导编辑(cliPE),这是一种可访问且低成本的实验流程,用于使用目标基因的引导编辑进行MAVEs,以及一个配套的Shiny应用程序(pegRNA设计器),以快速简便地设计用户特定的MAVE文库。
摘要: Multiplexed assays of variant effect (MAVEs) perform simultaneous characterization of many variants. Prime editing has been recently adopted for introducing many variants in their native genomic contexts. However, robust protocols and standards are limited, preventing widespread uptake. Herein, we describe curated loci prime editing (cliPE) which is an accessible, low-cost experimental pipeline to perform MAVEs using prime editing of a target gene, as well as a companion Shiny app (pegRNA Designer) to rapidly and easily design user-specific MAVE libraries.
评论: 28页,2图
主题: 基因组学 (q-bio.GN)
引用方式: arXiv:2501.04822 [q-bio.GN]
  (或者 arXiv:2501.04822v1 [q-bio.GN] 对于此版本)
  https://doi.org/10.48550/arXiv.2501.04822
通过 DataCite 发表的 arXiv DOI

提交历史

来自: Jeffrey Calhoun [查看电子邮件]
[v1] 星期三, 2025 年 1 月 8 日 20:21:40 UTC (6,500 KB)
全文链接:

获取论文:

    查看标题为《》的 PDF
  • 查看中文 PDF
  • 查看 PDF
  • 其他格式
许可图标 查看许可
当前浏览上下文:
q-bio.GN
< 上一篇   |   下一篇 >
新的 | 最近的 | 2025-01
切换浏览方式为:
q-bio

参考文献与引用

  • NASA ADS
  • 谷歌学术搜索
  • 语义学者
a 导出 BibTeX 引用 加载中...

BibTeX 格式的引用

×
数据由提供:

收藏

BibSonomy logo Reddit logo

文献和引用工具

文献资源探索 (什么是资源探索?)
连接的论文 (什么是连接的论文?)
Litmaps (什么是 Litmaps?)
scite 智能引用 (什么是智能引用?)

与本文相关的代码,数据和媒体

alphaXiv (什么是 alphaXiv?)
CatalyzeX 代码查找器 (什么是 CatalyzeX?)
DagsHub (什么是 DagsHub?)
Gotit.pub (什么是 GotitPub?)
Hugging Face (什么是 Huggingface?)
带有代码的论文 (什么是带有代码的论文?)
ScienceCast (什么是 ScienceCast?)

演示

复制 (什么是复制?)
Hugging Face Spaces (什么是 Spaces?)
TXYZ.AI (什么是 TXYZ.AI?)

推荐器和搜索工具

影响之花 (什么是影响之花?)
核心推荐器 (什么是核心?)
IArxiv 推荐器 (什么是 IArxiv?)
  • 作者
  • 地点
  • 机构
  • 主题

arXivLabs:与社区合作伙伴的实验项目

arXivLabs 是一个框架,允许合作伙伴直接在我们的网站上开发和分享新的 arXiv 特性。

与 arXivLabs 合作的个人和组织都接受了我们的价值观,即开放、社区、卓越和用户数据隐私。arXiv 承诺这些价值观,并且只与遵守这些价值观的合作伙伴合作。

有一个为 arXiv 社区增加价值的项目想法吗? 了解更多关于 arXivLabs 的信息.

这篇论文的哪些作者是支持者? | 禁用 MathJax (什么是 MathJax?)
  • 关于
  • 帮助
  • contact arXivClick here to contact arXiv 联系
  • 订阅 arXiv 邮件列表点击这里订阅 订阅
  • 版权
  • 隐私政策
  • 网络无障碍帮助
  • arXiv 运营状态
    通过...获取状态通知 email 或者 slack

京ICP备2025123034号