计算机科学 > 机器学习
[提交于 2025年5月1日
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标题: OmicsCL:无监督对比学习在癌症亚型发现和生存分层中的应用
标题: OmicsCL: Unsupervised Contrastive Learning for Cancer Subtype Discovery and Survival Stratification
摘要: 无监督学习从多组学数据中识别疾病亚型为推进个性化医学提供了显著机会。 我们介绍了OmicsCL,一个模块化的对比学习框架,该框架联合嵌入了不同类型的组学模态(如基因表达、DNA甲基化和miRNA表达)到一个统一的潜在空间。 我们的方法结合了一个生存感知对比损失,鼓励模型学习与生存相关模式对齐的表示,而无需依赖标记的结果。 在TCGA BRCA数据集上评估时,OmicsCL揭示了临床上有意义的聚类,并在患者生存方面实现了强大的无监督一致性。 该框架在超参数配置中表现出鲁棒性,并且可以调整以优先考虑亚型一致性或生存分层。 消融研究确认,整合生存感知损失显著增强了学习表示的预测能力。 这些结果强调了对比目标在高维异质组学数据中发现生物学洞见的前景。
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