定量方法

2025年01月 的作者和标题

[1] arXiv:2501.00013 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于关系感知的等变图网络用于表位未知的抗体设计和特异性优化 显示英文标题

标题： Relation-Aware Equivariant Graph Networks for Epitope-Unknown Antibody Design and Specificity Optimization

Lirong Wu, Haitao Lin, Yufei Huang, Zhangyang Gao, Cheng Tan, Yunfan Liu, Tailin Wu, Stan Z. Li

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[2] arXiv:2501.01198 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 晚期慢性肾脏病咨询中患者的生活质量和感知护理质量：一项横断面描述性研究 显示英文标题

标题： Quality of life and perceived care of patients in advanced chronic kidney disease consultations: a cross-sectional descriptive study

V Gimeno Hernan, I Duran-Muños, MR Del Pino- Jurado, A Faraldo-Cabana, M Oliva-Hernando, I Ortuño-Sorinao

评论： 21页，2图，7表

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[3] arXiv:2501.01283 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 一个系统化的计算框架用于生物领域数学模型的实际可辨识性分析 显示英文标题

标题： A Systematic Computational Framework for Practical Identifiability Analysis in Mathematical Models Arising from Biology

Shun Wang, Wenrui Hao

评论： 20页，9幅图，1个表格

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[4] arXiv:2501.02033 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 推断和预测弗里德身体虚弱表型缺陷 显示英文标题

标题： Inferring and predicting Fried physical frailty phenotype deficits

Glen Pridham, Kenneth Rockwood, Andrew Rutenberg

评论： 13页（包括参考文献），5幅图和3张表。 补充材料：19页

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[5] arXiv:2501.02154 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 预测设计的小生物分子的新功能角色：一种利用PubChem化合物和物质标识符的ML方法（CID-SID ML模型） 显示英文标题

标题： Predicting Novel Functional Roles of Designed Small Biomolecules: An ML Approach Utilizing PubChem Compound and Substance Identifiers (CID-SID ML model)

Mariya L. Ivanova, Nicola Russo, Gueorgui Mihaylov, Konstantin Nikolic

评论： 30页，26幅图，20张表格

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[6] arXiv:2501.02176 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于分子动力学的衰老时钟和衰老路线图预测与日晷 显示英文标题

标题： Molecule-dynamic-based Aging Clock and Aging Roadmap Forecast with Sundial

Wei Wu, Zizhen Deng, Chi Zhang, Can Liao, Jinzhuo Wang

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[7] arXiv:2501.02275 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基因组和病理学分析一例雌性金毛寻回犬的不对称真两性畸形病例 显示英文标题

标题： Genomic and pathological analyses of an asymmetric true hermaphroditism case in a female labrador retriever

Yihang Zhou

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[8] arXiv:2501.02658 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 注意所谓的“良好”相关性：对个体mRNA-蛋白质预测的统计现实检查 显示英文标题

标题： Beware of so-called 'good' correlations: a statistical reality check on individual mRNA-protein predictions

Romain-Daniel Gosselin

评论： 待发表的文章，16页，2个图，1个表格，数据见https://doi.org/10.6084/m9.figshare.28138733.v1

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[9] arXiv:2501.02680 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 从热力学到蛋白质设计：面向自主蛋白质工程的生物分子生成扩散模型 显示英文标题

标题： From thermodynamics to protein design: Diffusion models for biomolecule generation towards autonomous protein engineering

Wen-ran Li, Xavier F. Cadet, David Medina-Ortiz, Mehdi D. Davari, Ramanathan Sowdhamini, Cedric Damour, Yu Li, Alain Miranville, Frederic Cadet

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[10] arXiv:2501.04147 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 一种在混合模型中构建环境矩阵的框架 显示英文标题

标题： A Framework for Building Enviromics Matrices in Mixed Models

B. A. Trevisan, V. S. Junqueira, B. M. Florencio, A. S. G. Coelho, G. E. Marcatti, R. T. Resende

评论： 17页，3图

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[11] arXiv:2501.04413 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 机器学习和统计分类的CRISPR-Cas12a诊断检测 显示英文标题

标题： Machine Learning and statistical classification of CRISPR-Cas12a diagnostic assays

Nathan Khosla, Jake M. Lesinski, Marcus Haywood-Alexander, Andrew J. deMello, Daniel A. Richards

评论： 25页，5图，研究论文。Nathan Khosla和Jake M. Lesinski贡献相同。附有电子支持信息作为附录

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[12] arXiv:2501.04596 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 快速有向$q$-分析脑图 显示英文标题

标题： Fast Directed $q$-Analysis for Brain Graphs

Felix Windisch, Florian Unger

评论： v2的修改：增加了一个关于接近中心性的新实验。讨论了与网络科学和社区检测的关系。已被《脑类器官与系统神经科学期刊》接受：https://www.bosnj.org/braingraphs，2025年4月。目前正在进行中

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 代数拓扑 (math.AT)

[13] arXiv:2501.04983 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 从群体概率判断中推断命题的真理性的集体推理 显示英文标题

标题： Collective inference of the truth of propositions from crowd probability judgments

Patrick Stinson, Jasper van den Bosch, Trenton Jerde, Nikolaus Kriegeskorte

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[14] arXiv:2501.05789 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 通过自维护性实现全实验室自动化的护理自动化 显示英文标题

标题： Automating Care by Self-maintainability for Full Laboratory Automation

Koji Ochiai, Yuya Tahara-Arai, Akari Kato, Kazunari Kaizu, Hirokazu Kariyazaki, Makoto Umeno, Koichi Takahashi, Genki N. Kanda, Haruka Ozaki

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[15] arXiv:2501.06039 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于空间蛋白质组学的AI驱动虚拟组织用于临床诊断和生物医学发现 显示英文标题

标题： AI-powered virtual tissues from spatial proteomics for clinical diagnostics and biomedical discovery

Johann Wenckstern, Eeshaan Jain, Kiril Vasilev, Matteo Pariset, Andreas Wicki, Gabriele Gut, Charlotte Bunne

评论： 23页，5图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 计算机视觉与模式识别 (cs.CV) ; 机器学习 (cs.LG)

[16] arXiv:2501.06271 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 生物信息学中的大型语言模型 显示英文标题

标题： Large Language Models for Bioinformatics

Wei Ruan, Yanjun Lyu, Jing Zhang, Jiazhang Cai, Peng Shu, Yang Ge, Yao Lu, Shang Gao, Yue Wang, Peilong Wang, Lin Zhao, Tao Wang, Yufang Liu, Luyang Fang, Ziyu Liu, Zhengliang Liu, Yiwei Li, Zihao Wu, Junhao Chen, Hanqi Jiang, Yi Pan, Zhenyuan Yang, Jingyuan Chen, Shizhe Liang, Wei Zhang, Terry Ma, Yuan Dou, Jianli Zhang, Xinyu Gong, Qi Gan, Yusong Zou, Zebang Chen, Yuanxin Qian, Shuo Yu, Jin Lu, Kenan Song, Xianqiao Wang, Andrea Sikora, Gang Li, Xiang Li, Quanzheng Li, Yingfeng Wang, Lu Zhang, Yohannes Abate, Lifang He, Wenxuan Zhong, Rongjie Liu, Chao Huang, Wei Liu, Ye Shen, Ping Ma, Hongtu Zhu, Yajun Yan, Dajiang Zhu, Tianming Liu

评论： 64页，1图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 计算工程、金融与科学 (cs.CE)

[17] arXiv:2501.06548 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 无监督检测和新兴SARS-CoV-2变种的适应性估计。 应用于污水样本（ANRS0160） 显示英文标题

标题： Unsupervised detection and fitness estimation of emerging SARS-CoV-2 variants. Application to wastewater samples (ANRS0160)

Alexandra Lefebvre, Vincent Maréchal, Arnaud Gloaguen, Obépine Consortium, Amaury Lambert, Yvon Maday

评论： 45页，19图和表

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[18] arXiv:2501.06800 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 厌氧消化中微生物群落的时间动态：温度和进料成分对反应器性能和稳定性的影响 显示英文标题

标题： Temporal Dynamics of Microbial Communities in Anaerobic Digestion: Influence of Temperature and Feedstock Composition on Reactor Performance and Stability

Ellen Piercy, Xinyang Sun, Peter R Ellis, Mark Taylor, Miao Guo

评论： 原创研究文章，36页，5198字，八幅图表，一份补充材料与方法，一份补充数据库

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[19] arXiv:2501.07230 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 用于以较低数据吞吐量跟踪被动和主动物质的类脑相机 显示英文标题

标题： A neuromorphic camera for tracking passive and active matter with lower data throughput

Gabriel Britto Monteiro, Megan Lim, Tiffany Cheow Yuen Tan, Avinash Upadhya, Zhuo Liang, Benjamin Agnew, Tomonori Hu, Benjamin J. Eggleton, Christopher Perrella, Kylie Dunning, Kishan Dholakia

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 光学 (physics.optics)

[20] arXiv:2501.07606 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于邻接图打包的启发式方法用于考虑基因间区的DCJ距离 显示英文标题

标题： Heuristics based on Adjacency Graph Packing for DCJ Distance Considering Intergenic Regions

Gabriel Siqueira, Alexsandro Oliveira Alexandrino, Andre Rodrigues Oliveira, Zanoni Dias

评论： 这项工作是在第十七届巴西生物信息学研讨会（BSB'2024）上提出的

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[21] arXiv:2501.07620 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 太阳辐射和大气CO$_2$预测湿润常绿热带森林中幼叶的产生：23年的见解 显示英文标题

标题： Solar radiation and atmospheric CO$_2$ predict young leaf production in a moist evergreen tropical forest: Insights from 23 years

Laura Lüthy, Colin A. Chapman, Patrick Lauer, Patrick Omeja, Urs Kalbitzer

评论： 21页，6图

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[22] arXiv:2501.08355 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 连续方法作为电生理学建模中参数推理的工具 显示英文标题

标题： Continuation methods as a tool for parameter inference in electrophysiology modeling

Matt J Owen, Gary R Mirams

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 动力系统 (math.DS) ; 计算 (stat.CO)

[23] arXiv:2501.08356 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 大量细胞特异性动作电位模型，用于复制兔心室肌细胞电压的荧光记录 显示英文标题

标题： A large population of cell-specific action potential models replicating fluorescence recordings of voltage in rabbit ventricular myocytes

Radostin D. Simitev, Rebecca J. Gilchrist, Zhechao Yang, Rachel Myles, Francis Burton, Godfrey L. Smith

评论： 已被皇家学会开放科学期刊（ISSN：2054-5703）于2025年1月13日接受发表。补充材料可从皇家学会开放科学获取开源版本。

期刊参考： 皇家学会开放科学（2025）12：241539

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 数据分析、统计与概率 (physics.data-an) ; 细胞行为 (q-bio.CB)

[24] arXiv:2501.08359 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 动态全视野OCT的滚动相位调制模式 显示英文标题

标题： Rolling phase modulation regime for dynamic full field OCT

Tual Monfort (CHNO, CIC QUINZE-VINGTS, INSERM), Kate Grieve (SU), Olivier Thouvenin (IL)

期刊参考： 通信生物学，2024，6

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 光学 (physics.optics)

[25] arXiv:2501.08367 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 垂直根的形态动力学、演化和生态学 显示英文标题

标题： Geomorphodynamics, evolution, and ecology of vertical roots

Martin Heidelman, Dervis Can Vural

期刊参考： 植物科学前沿 14 (2023): 1102491

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 流体动力学 (physics.flu-dyn)

[26] arXiv:2501.09218 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 可解释的液滴数字PCR检测方法用于可信的分子诊断 显示英文标题

标题： Interpretable Droplet Digital PCR Assay for Trustworthy Molecular Diagnostics

Yuanyuan Wei, Yucheng Wu, Fuyang Qu, Yao Mu, Yi-Ping Ho, Ho-Pui Ho, Wu Yuan, Mingkun Xu

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI)

[27] arXiv:2501.10620 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于人工智能的混合生态模型用于预测溶瘤病毒治疗动力学 显示英文标题

标题： AI-Driven Hybrid Ecological Model for Predicting Oncolytic Viral Therapy Dynamics

Abicumaran Uthamacumaran, Juri Kiyokawa, Hiroaki Wakimoto

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[28] arXiv:2501.10882 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： EMICSS：EMDB条目中的增值注释 显示英文标题

标题： EMICSS: Added-value annotations for EMDB entries

Amudha K. Duraisamy, Neli Fonseca, Gerard J. Kleywegt, Ardan Patwardhan, Kyle L. Morris

评论： 16页，6图

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[29] arXiv:2501.11105 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于固定预算的生长细胞群体模拟方法 显示英文标题

标题： Fixed-budget simulation method for growing cell populations

Shaoqing Chen, Zhou Fang, Zheng Hu, Da Zhou

评论： 30页，2图

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[30] arXiv:2501.11760 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于随机游走的scRNA-seq数据超图表示用于改进聚类 显示英文标题

标题： Hypergraph Representations of scRNA-seq Data for Improved Clustering with Random Walks

Wan He, Daniel I. Bolnick, Samuel V. Scarpino, Tina Eliassi-Rad

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 基因组学 (q-bio.GN) ; 应用 (stat.AP) ; 机器学习 (stat.ML)

[31] arXiv:2501.12081 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： SPM 25：开源神经影像分析软件 显示英文标题

标题： SPM 25: open source neuroimaging analysis software

Tim M. Tierney, Nicholas A. Alexander, Nicole Labra Avila, Yael Balbastre, Gareth Barnes, Yulia Bezsudnova, Mikael Brudfors, Korbinian Eckstein, Guillaume Flandin, Karl Friston, Amirhossein Jafarian, Olivia S. Kowalczyk, Vladimir Litvak, Johan Medrano, Stephanie Mellor, George O'Neill, Thomas Parr, Adeel Razi, Ryan Timms, Peter Zeidman

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 神经与认知 (q-bio.NC)

[32] arXiv:2501.12395 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 使用路径签名预测巴西市镇的高登革热发病率 显示英文标题

标题： Predicting high dengue incidence in municipalities of Brazil using path signatures

Daniel A.M. Villela

评论： 12页，5图，1表

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 种群与进化 (q-bio.PE)

[33] arXiv:2501.12400 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 数据插值用于数据增强：应用于留尼汪甘蔗田间杂草管理 显示英文标题

标题： Interpolation pour l'augmentation de donnees : Application à la gestion des adventices de la canne a sucre a la Reunion

Frederick Fabre Ferber, Dominique Gay, Jean-Christophe Soulie, Jean Diatta, Odalric-Ambrym Maillard

评论： 预印本。用法语书写。

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 应用 (stat.AP) ; 方法论 (stat.ME) ; 机器学习 (stat.ML)

[34] arXiv:2501.12768 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 具有模型比较的流行病超级传播贝叶斯建模框架 显示英文标题

标题： A Bayesian Modelling Framework with Model Comparison for Epidemics with Super-Spreading

Hannah Craddock, Simon EF Spencer, Xavier Didelot

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[35] arXiv:2501.13119 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 从动力学理论和二维模式分析推导多发性硬化症的趋化模型 显示英文标题

标题： Derivation from kinetic theory and 2-D pattern analysis of chemotaxis models for Multiple Sclerosis

Marzia Bisi, Maria Groppi, Giorgio Martalò, Romina Travaglini

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[36] arXiv:2501.13142 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 生物系统的计算建模现在与过去：重温本世纪初的工具和愿景 显示英文标题

标题： Computational modelling of biological systems now and then: revisiting tools and visions from the beginning of the century

Axel Loewe, Peter J. Hunter, Peter Kohl

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[37] arXiv:2501.13688 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 探索新热带小型哺乳动物中小尺度和大尺度运动之间的相互作用 显示英文标题

标题： Exploring the interplay between small and large scales movements in a neotropical small mammal

E. Brigatti, B. Ríos-Uzeda, M. V. Vieira

评论： 22页，5图

期刊参考： 运动生态学（2024） 12:23

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 统计力学 (cond-mat.stat-mech) ; 数据分析、统计与概率 (physics.data-an)

[38] arXiv:2501.13723 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于LLMOps的社会健康智能锻炼与反馈系统 显示英文标题

标题： Intelligent Exercise and Feedback System for Social Healthcare using LLMOps

Yeongrak Choi, Taeyoung Kim, Hyung Soo Han

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[39] arXiv:2501.13821 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 使用新的季节性指数重新定义流感传播季节性 显示英文标题

标题： Redefining Influenza Transmission Seasonality Using the Novel Seasonality Index

Branislava Lalic, Vladimir Koci, Ana Firanj Sremac, Zorana Jovanovic Andersen

评论： 16页，7图，包含附录中的8图

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[40] arXiv:2501.13837 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 膜受体的反应动力学：一种空间建模方法 显示英文标题

标题： Reaction kinetics of membrane receptors: a spatial modeling approach

Anil Cengiz, Sean D Lawley

评论： 26页，4图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 生物物理 (physics.bio-ph)

[41] arXiv:2501.14248 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 归一化和选择非差异表达基因可改善跨平台转录组数据的机器学习建模 显示英文标题

标题： Normalization and selecting non-differentially expressed genes improve machine learning modelling of cross-platform transcriptomic data

Fei Deng (1), Catherine H Feng (1 and 2), Nan Gao (3 and 4), Lanjing Zhang (1, 4, 5 and 6) ((1) Department of Chemical Biology, Ernest Mario School of Pharmacy, Rutgers University, Piscataway, NJ, (2) Harvard University, Cambridge, MA, (3) Department of Biological Sciences, School of Arts & Sciences, Rutgers University, Newark, NJ, (4) Department of Pharmacology, Physiology, and Neuroscience, New Jersey Medical School, Rutgers University, Newark, NJ, (5) Department of Pathology, Princeton Medical Center, Plainsboro, NJ, (6) Rutgers Cancer Institute of New Jersey, New Brunswick, NJ.)

评论： 35页，5幅图，2张表格

期刊参考： 《人工智能译文》2025, 1(1), 5

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 基因组学 (q-bio.GN) ; 计算 (stat.CO) ; 方法论 (stat.ME)

[42] arXiv:2501.15396 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 骨关节炎和膝关节置换的qMRI生物标志物的膝关节数字孪生基础 显示英文标题

标题： Foundations of a Knee Joint Digital Twin from qMRI Biomarkers for Osteoarthritis and Knee Replacement

Gabrielle Hoyer, Kenneth T Gao, Felix G Gassert, Johanna Luitjens, Fei Jiang, Sharmila Majumdar, Valentina Pedoia

评论： 本手稿基于先前在Research Square上发布的预印本版本：https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-4317958/v1

期刊参考： npj 数字医学 8, 118 (2025)

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 计算机视觉与模式识别 (cs.CV) ; 机器学习 (cs.LG) ; 图像与视频处理 (eess.IV) ; 应用 (stat.AP)

[43] arXiv:2501.16382 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： GraPPI：一种用于大规模蛋白质-蛋白质相互作用探索的检索-分割-求解图RAG框架 显示英文标题

标题： GraPPI: A Retrieve-Divide-Solve GraphRAG Framework for Large-scale Protein-protein Interaction Exploration

Ziwen Li, Xiang 'Anthony' Chen, Youngseung Jeon

评论： 14页；5张图。发表于NAACL 2025的成果

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[44] arXiv:2501.16386 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： ILETIA：一种用于孕激素预处理卵巢刺激方案的个体化触发-取卵间隔估计的AI增强方法 显示英文标题

标题： ILETIA: An AI-enhanced method for individualized trigger-oocyte pickup interval estimation of progestin-primed ovarian stimulation protocol

Binjian Wu, Qian Li, Zhe Kuang, Hongyuan Gao, Xinyi Liu, Haiyan Guo, Qiuju Chen, Xinyi Liu, Yangruizhe Jiang, Yuqi Zhang, Jinyin Zha, Mingyu Li, Qiuhan Ren, Sishuo Feng, Haicang Zhang, Xuefeng Lu, Jian Zhang

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[45] arXiv:2501.17158 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 定量磁化率成像在临床脑研究中的敏感性 显示英文标题

标题： Sensitivity of Quantitative Susceptibility Mapping in Clinical Brain Research

Fahad Salman, Abhisri Ramesh, Thomas Jochmann, Mirjam Prayer, Ademola Adegbemigun, Jack A. Reeves, Gregory E. Wilding, Junghun Cho, Dejan Jakimovski, Niels Bergsland, Michael G. Dwyer, Robert Zivadinov, Ferdinand Schweser

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 图像与视频处理 (eess.IV) ; 计算物理 (physics.comp-ph) ; 医学物理 (physics.med-ph)

[46] arXiv:2501.17589 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 通过多任务图结构学习提取蛋白质间相互作用 显示英文标题

标题： Extracting Inter-Protein Interactions Via Multitasking Graph Structure Learning

Jiang Li, Yuan-Ting Li

评论： 提交

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 新兴技术 (cs.ET) ; 机器学习 (cs.LG)

[47] arXiv:2501.17647 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 使用微毛细管阵列的表达构建体高通量筛选 显示英文标题

标题： High Throughput Screening of Expression Constructs using Microcapillary Arrays

Khushank Singhal, Harry Adamson, Thomas Baer, Howard Salis, Melik Demirel

评论： 30页，6图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[48] arXiv:2501.17729 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 多组学数据整合方法的技术综述：从经典统计方法到深度生成方法 显示英文标题

标题： A technical review of multi-omics data integration methods: from classical statistical to deep generative approaches

Ana R. Baião, Zhaoxiang Cai, Rebecca C Poulos, Phillip J. Robinson, Roger R Reddel, Qing Zhong, Susana Vinga, Emanuel Gonçalves

评论： 43页，4图

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[49] arXiv:2501.17838 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： IRONMAP：检测神经系统疾病中随时间变化的脑铁异常的铁网络映射和分析协议 显示英文标题

标题： IRONMAP: Iron Network Mapping and Analysis Protocol for Detecting Over-Time Brain Iron Abnormalities in Neurological Disease

Jack A. Reeves, Fahad Salman, Michael G. Dwyer, Niels Bergsland, Sarah Muldoon, Bianca Weinstock-Guttman, Robert Zivadinov, Ferdinand Schweser

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[50] arXiv:2501.17904 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 一种用于拉曼冠状病毒数据分类的鲁棒支持向量机方法 显示英文标题

标题： A Robust Support Vector Machine Approach for Raman COVID-19 Data Classification

Marco Piazza, Andrea Spinelli, Francesca Maggioni, Marzia Bedoni, Enza Messina

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)