定量生物学 > 分子网络
[提交于 2011年7月18日
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标题: 翻译结果:在具有质量作用动力学的翻译后修饰反应网络中的变量消去
标题: Variable elimination in post-translational modification reaction networks with mass-action kinetics
摘要: 我们定义了一类称为翻译后修饰系统的化学反应网络子类。 这种系统的重要生物学例子包括MAPK级联和双组分系统,它们在实验和理论上都得到了广泛研究。 此类系统的稳态是具有与方程数量相同变量的多项式方程组的解。 即使对于小系统,寻找这些解的任务也令人望而生畏。 我们开发了一个基于切割概念的数学框架,该框架提供了一种线性消去过程,以减少系统中的变量数量。 稳态通过一组“核心”变量进行代数参数化,非负稳态对应于核心变量的非负值。 此外,最小切割是物种图中的连通组件,并提供了守恒定律。 给出了何时可以从切割中推导出一组独立的守恒定律的标准。
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