标题： MCPmed：呼吁开发MCP启用的生物信息学网络服务以推动LLM驱动的发现 显示英文标题

标题： MCPmed: A Call for MCP-Enabled Bioinformatics Web Services for LLM-Driven Discovery

摘要： 生物信息学网络服务器是现代生物医学研究中的关键资源，通过定制的界面和丰富的可视化功能，促进数据集的交互式探索。 然而，这种以人类为中心的设计限制了大型语言模型（LLMs）和深度研究代理的机器可读性。 我们通过将模型上下文协议（MCP）适配到生物信息学网络服务器后端来解决这一问题——一种标准化的、可由机器操作的层，它明确地将网络服务端点与科学概念和详细元数据相关联。 我们在广泛使用的数据库（GEO、STRING、UCSC Cell Browser）中的实现展示了通过MCP启用的LLMs增强的探索能力。 为了加速采用，我们提出了MCPmed，这是一个社区努力项目，通过轻量级的线索来补充尚未完全MCP启用的服务，并提供设置新服务器的模板。 这种结构化的过渡显著提高了自动化、可重复性和互操作性，使生物信息学网络服务为下一代研究代理做好准备。 显示英文摘要

摘要： Bioinformatics web servers are critical resources in modern biomedical research, facilitating interactive exploration of datasets through custom-built interfaces with rich visualization capabilities. However, this human-centric design limits machine readability for large language models (LLMs) and deep research agents. We address this gap by adapting the Model Context Protocol (MCP) to bioinformatics web server backends - a standardized, machine-actionable layer that explicitly associates webservice endpoints with scientific concepts and detailed metadata. Our implementations across widely-used databases (GEO, STRING, UCSC Cell Browser) demonstrate enhanced exploration capabilities through MCP-enabled LLMs. To accelerate adoption, we propose MCPmed, a community effort supplemented by lightweight breadcrumbs for services not yet fully MCP-enabled and templates for setting up new servers. This structured transition significantly enhances automation, reproducibility, and interoperability, preparing bioinformatics web services for next-generation research agents.