定量生物学 > 种群与进化
[提交于 2025年1月16日
(v1)
,最后修订 2025年1月20日 (此版本, v2)]
标题: 预测随机样本中$k$个物种最近共同祖先的深度:系统发生树形状的影响
标题: Predicting the depth of the most recent common ancestor of a random sample of $k$ species: the impact of phylogenetic tree shape
摘要: 我们考虑以下问题:在系统发育树中,从树的末端随机抽取的$k$个物种的最近共同祖先,离祖先根有多近? 对于由 Yule-Harding 模型预测形状的树,已知最近共同祖先很可能接近(或等于)整个树的根,即使$n$变得很大(对于$k$固定)。 然而,这一结果并不适用于更贴近进化生物学中遇到的系统发育的树形模型。 我们研究了树形(通过 Aldous$\beta-$分裂模型)对预测随机抽取的$k$个末端物种的最近共同祖先和它们所来自的父树根之间分离的边数的影响。 给出了精确和渐近的结果。 我们还简要地考虑了抽样末端物种数量为随机数的过程。
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