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定量生物学 > 定量方法

arXiv:0906.4454 (q-bio)
[提交于 2009年6月24日 ]

标题: NP问题模拟可实现性:在生态学中的应用

标题: Activatability for simulation tractability of NP problems: Application to Ecology

Authors:Patrick Coquillard (IBSV), Alexandre Muzy (LISA), Eric Wajnberg (IBSV)
摘要: 生物-生态系统的动态强烈依赖于空间维度。 大多数生态学中强大的模拟器都考虑了系统的空间性,因此嵌入了随机过程。 由于研究特定轨迹的困难,生物学家和计算机科学家旨在预测系统在研究中的最可能轨迹。 这样做可以大大减少计算时间。 然而,由于空间的庞大,执行时间通常在时间上是多项式的。 为了减少执行时间,我们提出了一种基于可激活性的搜索循环,通过过程空间进行。 该循环基于统计方法(广义线性模型)消除冗余过程,并收敛到满足模拟目标所需的最少过程数。
摘要: Dynamics of biological-ecological systems is strongly depending on spatial dimensions. Most of powerful simulators in ecology take into account for system spatiality thus embedding stochastic processes. Due to the difficulty of researching particular trajectories, biologists and computer scientists aim at predicting the most probable trajectories of systems under study. Doing that, they considerably reduce computation times. However, because of the largeness of space, the execution time remains usually polynomial in time. In order to reduce execution times we propose an activatability-based search cycle through the process space. This cycle eliminates the redundant processes on a statistical basis (Generalized Linear Model), and converges to the minimal number of processes required to match simulation objectives.
评论: 复杂系统:基于活动的建模与仿真,卡热斯跨学科研讨会,科西嘉岛,法国,法国(2009)
主题: 定量方法 (q-bio.QM) ; 计算工程、金融与科学 (cs.CE)
引用方式: arXiv:0906.4454 [q-bio.QM]
  (或者 arXiv:0906.4454v1 [q-bio.QM] 对于此版本)
  https://doi.org/10.48550/arXiv.0906.4454
通过 DataCite 发表的 arXiv DOI

提交历史

来自: Patrick Coquillard [查看电子邮件]
[v1] 星期三, 2009 年 6 月 24 日 11:59:29 UTC (806 KB)
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