凝聚态物理 > 软凝聚态物理
[提交于 2012年6月1日
]
标题: 不同模型的水结构形成能力随温度发生变化
标题: Water structure-forming capabilities are temperature shifted for different models
摘要: 存在大量用于分子模拟的水模型。 它们在再现真实水的特定特征方面各有不同,而不是其他特征,例如密度最大值的正确温度或扩散系数。 过去的分析主要集中在系综量上,而关于不同微观行为的数据很少。 在这里,我们通过引入一组考虑第二溶剂化壳构型的序参数,比较了七种广泛使用的经典水模型(SPC、SPC/E、TIP3P、TIP4P、TIP4P-Ew、TIP4P/2005 和 TIP5P)在210 K至350 K温度范围内通过氢键形成局部结构的能力。 我们发现,所有模型在温度偏移后共享相同的结构模式。 当应用此偏移时,所有模型都重叠到一条主曲线。 有趣的是,能够再现密度最大值正确位置的模型中,发现完全配位结构的稳定化程度增加,这种结构扩展至少两个溶剂化壳层。 我们的结果提供了一种自洽的原子级结构比较协议,这有助于阐明不同水模型对蛋白质结构和动力学的影响。
当前浏览上下文:
cond-mat.soft
切换浏览方式为:
文献和引用工具
与本文相关的代码,数据和媒体
alphaXiv (什么是 alphaXiv?)
CatalyzeX 代码查找器 (什么是 CatalyzeX?)
DagsHub (什么是 DagsHub?)
Gotit.pub (什么是 GotitPub?)
Hugging Face (什么是 Huggingface?)
带有代码的论文 (什么是带有代码的论文?)
ScienceCast (什么是 ScienceCast?)
演示
推荐器和搜索工具
arXivLabs:与社区合作伙伴的实验项目
arXivLabs 是一个框架,允许合作伙伴直接在我们的网站上开发和分享新的 arXiv 特性。
与 arXivLabs 合作的个人和组织都接受了我们的价值观,即开放、社区、卓越和用户数据隐私。arXiv 承诺这些价值观,并且只与遵守这些价值观的合作伙伴合作。
有一个为 arXiv 社区增加价值的项目想法吗? 了解更多关于 arXivLabs 的信息.