Skip to main content
CenXiv.org
此网站处于试运行阶段,支持我们!
我们衷心感谢所有贡献者的支持。
贡献
赞助
cenxiv logo > q-bio > arXiv:1405.7856

帮助 | 高级搜索

定量生物学 > 定量方法

arXiv:1405.7856 (q-bio)
[提交于 2014年5月30日 ]

标题: 白血病在多维形态和分子景观中的熵

标题: Entropy of leukemia on multidimensional morphological and molecular landscapes

Authors:Jose M. G. Vilar
摘要: 白血病代表了新技术旨在通过使用大量单细胞水平信息来解决的高度复杂疾病类别。 实现这一目标关键不仅在于实验技术,还在于解释数据的方法。 一个最紧迫的问题是从产生的大量信息中识别出疾病的显著定量特征。 在这里,我展示了在特定多维分子和形态学景观上细胞群体分布的熵值提供了一组用于精确表征正常和病理状态的度量,例如对应于健康个体和急性髓系白血病(AML)患者的状况。 我提供了一个系统的过程来识别特定的景观,并说明如何将这种方法应用于外周血和骨髓穿刺液的细胞样本,从而仅通过流式细胞术数据准确诊断AML。 该方法可以普遍应用于其他类型的细胞群体,并建立了传统统计热力学方法与生物医学应用之间的直接联系。
摘要: Leukemia epitomizes the class of highly complex diseases that new technologies aim to tackle by using large sets of single-cell level information. Achieving such goal depends critically not only on experimental techniques but also on approaches to interpret the data. A most pressing issue is to identify the salient quantitative features of the disease from the resulting massive amounts of information. Here, I show that the entropies of cell-population distributions on specific multidimensional molecular and morphological landscapes provide a set of measures for the precise characterization of normal and pathological states, such as those corresponding to healthy individuals and acute myeloid leukemia (AML) patients. I provide a systematic procedure to identify the specific landscapes and illustrate how, applied to cell samples from peripheral blood and bone marrow aspirates, this characterization accurately diagnoses AML from just flow cytometry data. The methodology can generally be applied to other types of cell-populations and establishes a straightforward link between the traditional statistical thermodynamics methodology and biomedical applications.
评论: 15页,4张图和补充信息
主题: 定量方法 (q-bio.QM) ; 统计力学 (cond-mat.stat-mech); 医学物理 (physics.med-ph)
引用方式: arXiv:1405.7856 [q-bio.QM]
  (或者 arXiv:1405.7856v1 [q-bio.QM] 对于此版本)
  https://doi.org/10.48550/arXiv.1405.7856
通过 DataCite 发表的 arXiv DOI
期刊参考: Phys. Rev. X 4, 021038 (2014)
相关 DOI: https://doi.org/10.1103/PhysRevX.4.021038
链接到相关资源的 DOI

提交历史

来自: Jose Vilar [查看电子邮件]
[v1] 星期五, 2014 年 5 月 30 日 13:26:11 UTC (1,838 KB)
全文链接:

获取论文:

    查看标题为《》的 PDF
  • 查看中文 PDF
  • 查看 PDF
  • 其他格式
查看许可
当前浏览上下文:
cond-mat.stat-mech
< 上一篇   |   下一篇 >
新的 | 最近的 | 2014-05
切换浏览方式为:
cond-mat
physics
physics.med-ph
q-bio
q-bio.QM

参考文献与引用

  • NASA ADS
  • 谷歌学术搜索
  • 语义学者
a 导出 BibTeX 引用 加载中...

BibTeX 格式的引用

×
数据由提供:

收藏

BibSonomy logo Reddit logo

文献和引用工具

文献资源探索 (什么是资源探索?)
连接的论文 (什么是连接的论文?)
Litmaps (什么是 Litmaps?)
scite 智能引用 (什么是智能引用?)

与本文相关的代码,数据和媒体

alphaXiv (什么是 alphaXiv?)
CatalyzeX 代码查找器 (什么是 CatalyzeX?)
DagsHub (什么是 DagsHub?)
Gotit.pub (什么是 GotitPub?)
Hugging Face (什么是 Huggingface?)
带有代码的论文 (什么是带有代码的论文?)
ScienceCast (什么是 ScienceCast?)

演示

复制 (什么是复制?)
Hugging Face Spaces (什么是 Spaces?)
TXYZ.AI (什么是 TXYZ.AI?)

推荐器和搜索工具

影响之花 (什么是影响之花?)
核心推荐器 (什么是核心?)
IArxiv 推荐器 (什么是 IArxiv?)
  • 作者
  • 地点
  • 机构
  • 主题

arXivLabs:与社区合作伙伴的实验项目

arXivLabs 是一个框架,允许合作伙伴直接在我们的网站上开发和分享新的 arXiv 特性。

与 arXivLabs 合作的个人和组织都接受了我们的价值观,即开放、社区、卓越和用户数据隐私。arXiv 承诺这些价值观,并且只与遵守这些价值观的合作伙伴合作。

有一个为 arXiv 社区增加价值的项目想法吗? 了解更多关于 arXivLabs 的信息.

这篇论文的哪些作者是支持者? | 禁用 MathJax (什么是 MathJax?)
  • 关于
  • 帮助
  • contact arXivClick here to contact arXiv 联系
  • 订阅 arXiv 邮件列表点击这里订阅 订阅
  • 版权
  • 隐私政策
  • 网络无障碍帮助
  • arXiv 运营状态
    通过...获取状态通知 email 或者 slack

京ICP备2025123034号