物理学 > 计算物理
[提交于 2018年10月18日
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标题: 大规模并行的解析本征耦合簇方法在分子系统数值原子中心轨道框架中的实现
标题: Massive-parallel Implementation of the Resolution-of-Identity Coupled-cluster Approaches in the Numeric Atom-centered Orbital Framework for Molecular Systems
摘要: 我们介绍了在FHI-aims包中实现的分辨能力(RI)耦合簇方法的大规模并行版本,该方法包括单重、双重和微扰三重激发,即RI-CCSD(T),用于分子系统。 设计了一种基于域的分布式内存算法,在MPI/OpenMP混合框架中,以有效利用内存带宽并显著减少互连通信,特别是粒子-粒子梯子项评估中的张量收缩。 我们的实现特点是没有实时磁盘存储,并且在10,000个以上核心上具有出色的强可扩展性。 通过一组不同大小的分子,我们证明了我们的CCSD(T)代码的并行性能与最先进的高性能计算(HPC)计算化学包中的CC实现相竞争。 我们还证明了在我们的RI-CCSD(T)中使用RI近似所产生的数值误差可以忽略不计。 结合相关一致的数值原子中心轨道(NAO)基组NAO-VCC-nZ,该方法被用于生成22种生物导向的弱相互作用(S22)、11种气态半胱氨酸构象体(CYCONF)的构象能量和32种异构化能量(ISO32)的准确理论参考数据。
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