标题： 使用ASTRAL进行物种树估计：实际考虑因素 显示英文标题

标题： Species Tree Estimation Using ASTRAL: Practical Considerations

摘要： ASTRAL是一种在推断一组基因树之后重建物种树的方法，在系统发育基因组学分析中被越来越多地使用。 在多物种共线模型下，它具有统计一致性，可扩展性强，并且在模拟和实证研究中表现出高准确性。 本章讨论了使用ASTRAL时的实际注意事项，首先回顾已发表的结果，并指出使用ASTRAL进行物种树估计的优势和劣势。 然后继续详细说明准备输入基因树的最佳方法、解释ASTRAL输出以及进行后续分析的方法。 显示英文摘要

摘要： ASTRAL is a method for reconstructing species trees after inferring a set of gene trees and is increasingly used in phylogenomic analyses. It is statistically consistent under the multi-species coalescent model, is scalable, and has shown high accuracy in simulated and empirical studies. This chapter discusses practical considerations in using ASTRAL, starting with a review of published results and pointing to the strengths and weaknesses of species tree estimation using ASTRAL. It then continues to detail the best ways to prepare input gene trees, interpret ASTRAL outputs, and perform follow-up analyses.