计算机科学 > 计算机视觉与模式识别
[提交于 2021年7月1日
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标题: 深度正交融合:整合影像学、病理学、基因组学和临床数据的多模态预后生物标志物发现
标题: Deep Orthogonal Fusion: Multimodal Prognostic Biomarker Discovery Integrating Radiology, Pathology, Genomic, and Clinical Data
摘要: 肿瘤学中的临床决策涉及多模态数据,如影像学扫描、分子谱分析、组织病理学切片和临床因素。 尽管这些模态各自都很重要,但到目前为止,还没有一种深度学习框架能够将它们全部结合起来预测患者预后。 在此,我们使用深度正交融合(DOF)模型从多种多模态数据中预测胶质瘤患者的总体生存期(OS)。 该模型学习将多参数MRI检查、基于活检的模态(如H&E切片图像和/或DNA测序)和临床变量的信息整合成一个全面的多模态风险评分。 每个模态的预后嵌入通过注意力门控张量融合进行学习和组合。 为了最大化从每个模态中获取的信息,我们引入了一个多模态正交化(MMO)损失项,通过鼓励组成部分嵌入更加互补来提高模型性能。 DOF在胶质瘤患者中预测OS的中位C指数为0.788 +/- 0.067,显著优于最佳单模态模型的中位C指数0.718 +/- 0.064(p=0.023)。 该预后模型能够显著地根据OS对胶质瘤患者进行分层,在临床子集中增加了预后临床分级和分子亚型的精细度。
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