定量生物学 > 基因组学
[提交于 2023年6月1日
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标题: pgMAP:一种用于从双靶向CRISPR筛选中实现引导RNA读段映射的流程
标题: pgMAP: a pipeline to enable guide RNA read mapping from dual-targeting CRISPR screens
摘要: 我们开发了pgMAP,一个分析流程,用于映射双靶点CRISPR筛选中的gRNA测序读数。 pgMAP输出包括一个双gRNA读数计数表和质量控制指标,包括正确配对读数的比例以及所有时间点和样本中CRISPR文库的测序覆盖度。 pgMAP使用Snakemake实现,并在https://github.com/fredhutch/pgmap_pipeline下以MIT许可证开源可用。
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