凝聚态物理 > 软凝聚态物理
[提交于 2024年11月5日
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标题: 更热并不意味着更快的熔化RNA发夹结构
标题: Hotter isn't faster for a melting RNA hairpin
摘要: 我们通过粗粒度RNA发夹模型的大量分子动力学模拟,研究了核酸的变性动力学。 显然与阿伦尼乌斯定律相矛盾,我们的研究结果表明,对于长度超过几个持久长度的分子,RNA发夹的变性时间是温度的非单调函数,在熔点以上的一个最优温度 $T_m$时,变性发生得最快。 这种异常现象源于两种不同的路径:从一端到另一端的“单向”解链,在接近 $T_m$时占优,以及在较高温度下从两端同时开始的“双向”变性。 这两种模式在熔化时间 \textit{vs.}与长度 $L$之间表现出不同的标度规律,并由一个交叉温度 $T_\times$分隔,其中 $(T_\times-T_m) \sim L^{-1}$。 这些结果突显了螺旋结构在RNA/DNA变性非平衡动力学中的重要作用,并揭示了一个几十年老问题中的多个意外发现。
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