Skip to main content
CenXiv.org
此网站处于试运行阶段,支持我们!
我们衷心感谢所有贡献者的支持。
贡献
赞助
cenxiv logo > cs > arXiv:2506.01478

帮助 | 高级搜索

计算机科学 > 机器学习

arXiv:2506.01478 (cs)
[提交于 2025年6月2日 ]

标题: MUDI:理解药效药物-药物相互作用的多模态生物医学数据集

标题: MUDI: A Multimodal Biomedical Dataset for Understanding Pharmacodynamic Drug-Drug Interactions

Authors:Tung-Lam Ngo, Ba-Hoang Tran, Duy-Cat Can, Trung-Hieu Do, Oliver Y. Chén, Hoang-Quynh Le
摘要: 理解不同药物之间的相互作用(药物-药物相互作用或DDI)对于确保患者安全和优化治疗效果至关重要。现有的DDI数据集主要关注文本信息,忽视了反映复杂药物机制的多模态数据。本文(1)介绍了MUDI,这是一个大规模的多模态生物医学数据集,用于理解药效学药物-药物相互作用,并(2)评估学习方法来研究它。简而言之,MUDI通过结合310,532个标注的药物对(标记为协同作用、拮抗作用或新效应)的药理学文本、化学公式、分子结构图和图像,提供了药物的全面多模态表示。关键的是,为了有效评估基于机器学习的泛化能力,MUDI测试集中包含未见过的药物对。我们使用晚期融合投票和中间融合策略评估基准模型。所有数据、注释、评估脚本和基线都以开放研究许可的形式发布。
摘要: Understanding the interaction between different drugs (drug-drug interaction or DDI) is critical for ensuring patient safety and optimizing therapeutic outcomes. Existing DDI datasets primarily focus on textual information, overlooking multimodal data that reflect complex drug mechanisms. In this paper, we (1) introduce MUDI, a large-scale Multimodal biomedical dataset for Understanding pharmacodynamic Drug-drug Interactions, and (2) benchmark learning methods to study it. In brief, MUDI provides a comprehensive multimodal representation of drugs by combining pharmacological text, chemical formulas, molecular structure graphs, and images across 310,532 annotated drug pairs labeled as Synergism, Antagonism, or New Effect. Crucially, to effectively evaluate machine-learning based generalization, MUDI consists of unseen drug pairs in the test set. We evaluate benchmark models using both late fusion voting and intermediate fusion strategies. All data, annotations, evaluation scripts, and baselines are released under an open research license.
主题: 机器学习 (cs.LG) ; 计算与语言 (cs.CL); 多媒体 (cs.MM); 定量方法 (q-bio.QM)
引用方式: arXiv:2506.01478 [cs.LG]
  (或者 arXiv:2506.01478v1 [cs.LG] 对于此版本)
  https://doi.org/10.48550/arXiv.2506.01478
通过 DataCite 发表的 arXiv DOI

提交历史

来自: Duy-Cat Can [查看电子邮件]
[v1] 星期一, 2025 年 6 月 2 日 09:36:08 UTC (855 KB)
全文链接:

获取论文:

    查看标题为《》的 PDF
  • 查看中文 PDF
  • 查看 PDF
  • HTML(实验性)
  • TeX 源代码
  • 其他格式
许可图标 查看许可
当前浏览上下文:
cs
< 上一篇   |   下一篇 >
新的 | 最近的 | 2025-06
切换浏览方式为:
cs.CL
cs.LG
cs.MM
q-bio
q-bio.QM

参考文献与引用

  • NASA ADS
  • 谷歌学术搜索
  • 语义学者
a 导出 BibTeX 引用 加载中...

BibTeX 格式的引用

×
数据由提供:

收藏

BibSonomy logo Reddit logo

文献和引用工具

文献资源探索 (什么是资源探索?)
连接的论文 (什么是连接的论文?)
Litmaps (什么是 Litmaps?)
scite 智能引用 (什么是智能引用?)

与本文相关的代码,数据和媒体

alphaXiv (什么是 alphaXiv?)
CatalyzeX 代码查找器 (什么是 CatalyzeX?)
DagsHub (什么是 DagsHub?)
Gotit.pub (什么是 GotitPub?)
Hugging Face (什么是 Huggingface?)
带有代码的论文 (什么是带有代码的论文?)
ScienceCast (什么是 ScienceCast?)

演示

复制 (什么是复制?)
Hugging Face Spaces (什么是 Spaces?)
TXYZ.AI (什么是 TXYZ.AI?)

推荐器和搜索工具

影响之花 (什么是影响之花?)
核心推荐器 (什么是核心?)
IArxiv 推荐器 (什么是 IArxiv?)
  • 作者
  • 地点
  • 机构
  • 主题

arXivLabs:与社区合作伙伴的实验项目

arXivLabs 是一个框架,允许合作伙伴直接在我们的网站上开发和分享新的 arXiv 特性。

与 arXivLabs 合作的个人和组织都接受了我们的价值观,即开放、社区、卓越和用户数据隐私。arXiv 承诺这些价值观,并且只与遵守这些价值观的合作伙伴合作。

有一个为 arXiv 社区增加价值的项目想法吗? 了解更多关于 arXivLabs 的信息.

这篇论文的哪些作者是支持者? | 禁用 MathJax (什么是 MathJax?)
  • 关于
  • 帮助
  • contact arXivClick here to contact arXiv 联系
  • 订阅 arXiv 邮件列表点击这里订阅 订阅
  • 版权
  • 隐私政策
  • 网络无障碍帮助
  • arXiv 运营状态
    通过...获取状态通知 email 或者 slack

京ICP备2025123034号