分子网络

2025年08月 的作者和标题

[1] arXiv:2508.01618 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 将内皮源性超极化信号整合到微血管疾病的多靶点治疗策略中 显示英文标题

标题： Integrating Endothelial-Derived Hyperpolarizing Signaling into a Multitarget Therapeutic Strategy for Microvascular Disease

Paolo Madeddu, Styliani Goulopoulou, David Wambeke

评论： 25页和1图

主题： 分子网络 (q-bio.MN)

[2] arXiv:2508.04743 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： Alz-QNet：用于研究阿尔茨海默病基因相互作用的量子回归网络 显示英文标题

标题： Alz-QNet: A Quantum Regression Network for Studying Alzheimer's Gene Interactions

Debanjan Konar, Neerav Sreekumar, Richard Jiang, Vaneet Aggarwal

期刊参考： 生物学与医学中的计算机，第196卷，第C部分，2025年9月，110837

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 机器学习 (cs.LG) ; 基因组学 (q-bio.GN) ; 量子物理 (quant-ph)

[3] arXiv:2508.05136 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： GCnet：使用格兰杰因果关系探索与人类大脑中智力障碍相关基因之间的动态因果关系 显示英文标题

标题： GCnet: Using Granger causality to explore the dynamic causality relations among genes as-sociated with intellectual disability in human brain

Lukas Madsen Brandt, Katja Nowick, Jing Qin

主题： 分子网络 (q-bio.MN)

[4] arXiv:2508.09038 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于控制理论的基因调控方法为随机基因表达中的动态稳态提出了定量约束条件 显示英文标题

标题： A control theoretical approach to gene regulation raises quantitative constraints for dynamic homeostasis in stochastic gene expression

Guilherme Giovanini, Cyro von Zuben de Valega Negr√£o, Ammar Alsinai, Alexandre Ferreira Ramos

评论： 13页，5张图表，提交至《生物化学与生物物理 Acta》（BBA）- 疾病分子基础

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 生物物理 (physics.bio-ph) ; 定量方法 (q-bio.QM)

[5] arXiv:2508.10117 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于图深度学习、网络药理学和分子对接的姜黄素类生物活性化合物对HeLa癌细胞细胞毒性的计算机研究 显示英文标题

标题： In silico study on the cytotoxicity against Hela cancer cells of xanthones bioactive compounds from Garcinia cowa: QSAR based on Graph Deep Learning, Network Pharmacology, and Molecular Docking

Nguyen Manh Son, Pham Huu Vang, Nguyen Thi Dung, Nguyen Manh Ha. Ta Thi Thao, Tran Thi Thu Thuy, Phan Minh Giang

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 机器学习 (cs.LG)

[6] arXiv:2508.11039 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 信息传输与处理在G蛋白偶联受体复合物中 显示英文标题

标题： Information Transmission and Processing in G-Protein-Coupled-Receptor Complexes

Roger D. Jones, Achille Giacometti, Alan M. Jones

评论： 提交至BioSystems

主题： 分子网络 (q-bio.MN)

[7] arXiv:2508.11783 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 多细胞基因网络的控制 显示英文标题

标题： Multicellular control of gene networks

Kyle R. Allison

评论： 17页，5图

主题： 分子网络 (q-bio.MN)

[8] arXiv:2508.12731 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 槲皮素通过调节T细胞相关靶点抑制三阴性乳腺癌的机制：基于单细胞测序和网络药理学的分析 显示英文标题

标题： Mechanism of Quercetin in Inhibiting Triple-Negative Breast Cancer by Regulating T Cell-Related Targets: An Analysis Based on Single-Cell Sequencing and Network Pharmacology

Ruiqi Chen, Liang Hang, Fengyun Wang

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 基因组学 (q-bio.GN)

[9] arXiv:2508.13208 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 用概率分类框架建模基因调控网络 显示英文标题

标题： Modeling GRNs with a Probabilistic Categorical Framework

Yiyang Jia, Zheng Wei, Zheng Yang, Guohong Peng

评论： 21页，5图

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 机器学习 (cs.LG) ; 范畴论 (math.CT)

[10] arXiv:2508.15273 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 反应网络中周期振荡的化学计量配方 显示英文标题

标题： Stoichiometric recipes for periodic oscillations in reaction networks

Alexander Blokhuis, Peter F. Stadler, Nicola Vassena

评论： 20页（主文）+ 63页（补充信息）

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 动力系统 (math.DS)

[11] arXiv:2508.16128 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 从癌症驱动因素到癌症维持者：范式转变与临床意义 显示英文标题

标题： From Cancer Drivers to Cancer Keepers: Paradigm Shift and Clinical Implications

Xizhe Zhang, Weixiong Zhang

主题： 分子网络 (q-bio.MN)

[12] arXiv:2508.18096 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 从动力学中实现简化和稀疏的生化反应网络 显示英文标题

标题： Realizing Reduced and Sparse Biochemical Reaction Networks from Dynamics

Maurice Filo, Mustafa Khammash

评论： 被IEEE CDC 2025接收。作者接受版本；补充材料在附加文件中（在此版本中，补充PDF移至附加文件；主文章内容无变化）

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 系统与控制 (eess.SY) ; 优化与控制 (math.OC)

[13] arXiv:2508.21006 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基因调控网络推断问题中的实际不可区分性，案例研究 显示英文标题

标题： Practical indistinguishability in a gene regulatory network inference problem, a case study

Cody E. FitzGerald, Shelley Reich, Victor Agaba, Arjun Mathur, Michael S. Werner, Niall M. Mangan

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 定量方法 (q-bio.QM)

[14] arXiv:2508.21220 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 互信息率 -- 线性噪声近似与精确计算 显示英文标题

标题： Mutual Information Rate -- Linear Noise Approximation and Exact Computation

Manuel Reinhardt, Age J. Tjalma, Anne-Lena Moor, Christoph Zechner, Pieter Rein ten Wolde

评论： 12页，5图

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 信息论 (cs.IT) ; 生物物理 (physics.bio-ph)

[15] arXiv:2508.03584 (交叉列表自 eess.SP) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 解码和工程化植物生物群通信以实现智能农业 显示英文标题

标题： Decoding and Engineering the Phytobiome Communication for Smart Agriculture

Fatih Gulec, Hamdan Awan, Nigel Wallbridge, Andrew W. Eckford

评论： 正在修订中，供IEEE通信杂志使用

主题： 信号处理 (eess.SP) ; 人工智能 (cs.AI) ; 新兴技术 (cs.ET) ; 网络与互联网架构 (cs.NI) ; 分子网络 (q-bio.MN)

[16] arXiv:2508.06576 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： GFlowNets用于学习更好的药物-药物相互作用表示 显示英文标题

标题： GFlowNets for Learning Better Drug-Drug Interaction Representations

Azmine Toushik Wasi

评论： 被接受为ICANN 2025：AIDD

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 生物大分子 (q-bio.BM) ; 分子网络 (q-bio.MN)

[17] arXiv:2508.21736 (交叉列表自 cs.HC) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： MicroLabVR：虚拟现实中的模拟时空微生物组数据交互式三维可视化 显示英文标题

标题： MicroLabVR: Interactive 3D Visualization of Simulated Spatiotemporal Microbiome Data in Virtual Reality

Simon Burbach, Maria Maleshkova, Florian Centler, Tanja Joan Schmidt

主题： 人机交互 (cs.HC) ; 计算工程、金融与科学 (cs.CE) ; 图形学 (cs.GR) ; 细胞行为 (q-bio.CB) ; 分子网络 (q-bio.MN)