定量方法

2025年03月 的作者和标题

[1] arXiv:2503.00089 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 蛋白质结构分词：基准测试与新方法 显示英文标题

标题： Protein Structure Tokenization: Benchmarking and New Recipe

Xinyu Yuan, Zichen Wang, Marcus Collins, Huzefa Rangwala

评论： 已被ICML 2025接收

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[2] arXiv:2503.00096 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： BixBench：计算生物学中基于大语言模型的智能体综合基准 显示英文标题

标题： BixBench: a Comprehensive Benchmark for LLM-based Agents in Computational Biology

Ludovico Mitchener, Jon M Laurent, Alex Andonian, Benjamin Tenmann, Siddharth Narayanan, Geemi P Wellawatte, Andrew White, Lorenzo Sani, Samuel G Rodriques

评论： 8页正文，5幅主要图表

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI)

[3] arXiv:2503.00143 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： RecCrysFormer：通过循环训练运行从三维帕特森图中精炼蛋白质结构预测 显示英文标题

标题： RecCrysFormer: Refined Protein Structural Prediction from 3D Patterson Maps via Recycling Training Runs

Tom Pan, Evan Dramko, Mitchell D. Miller, George N. Phillips Jr., Anastasios Kyrillidis

评论： 16页，9图。将发表于CPAL 2025会议论文集

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 优化与控制 (math.OC)

[4] arXiv:2503.00648 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 通过从头设计肽段揭示T细胞受体特异性图谱 显示英文标题

标题： T-cell receptor specificity landscape revealed through de novo peptide design

Gian Marco Visani, Michael N. Pun, Anastasia A. Minervina, Philip Bradley, Paul Thomas, Armita Nourmohammad

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[5] arXiv:2503.01179 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 代数方法用于反应网络的分解以及稳态的存在性和数量的确定 显示英文标题

标题： Algebraic approaches for the decomposition of reaction networks and the determination of existence and number of steady states

Joseph M. Sauder, Bruce P. Ayati, Ryan Kinser

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[6] arXiv:2503.01910 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： dyAb：基于AlphaFold驱动的预结合抗原的灵活抗体设计流匹配 显示英文标题

标题： dyAb: Flow Matching for Flexible Antibody Design with AlphaFold-driven Pre-binding Antigen

Cheng Tan, Yijie Zhang, Zhangyang Gao, Yufei Huang, Haitao Lin, Lirong Wu, Fandi Wu, Mathieu Blanchette, Stan. Z. Li

评论： AAAI 2025 口头报告

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI)

[7] arXiv:2503.02569 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 利用近红外光谱预测活体黑水虻幼虫中的氨基酸含量 显示英文标题

标题： Prediction of amino acid content in live black soldier fly larvae using near infrared spectroscopy

R.M. Zaalberg, L.B. Andersen, S.J. Noel, A.J. Buitenhuis, K. Jensen, G. Gebreyesus

评论： 28页，2图，3个补充文件

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[8] arXiv:2503.02726 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 细胞表示学习的测量噪声缩放定律 显示英文标题

标题： Measurement noise scaling laws for cellular representation learning

Gokul Gowri, Peng Yin, Allon M. Klein

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 信息论 (cs.IT)

[9] arXiv:2503.02781 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 多模态人工智能从临床前数据预测药物组合的临床结果 显示英文标题

标题： Multimodal AI predicts clinical outcomes of drug combinations from preclinical data

Yepeng Huang, Xiaorui Su, Varun Ullanat, Intae Moon, Ivy Liang, Lindsay Clegg, Damilola Olabode, Ruthie Johnson, Nicholas Ho, Megan Gibbs, Megan Gibbs, Alexander Gusev, Bino John, Marinka Zitnik

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[10] arXiv:2503.03131 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 空间结构化的病毒动力学模型：范围综述 显示英文标题

标题： Spatially-Structured Models of Viral Dynamics: A Scoping Review

Thomas Williams, James M. McCaw, James M. Osborne

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[11] arXiv:2503.03950 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 生命系统的组织本质 显示英文标题

标题： The Nature of Organization in Living Systems

Pedro Márquez-Zacarías, Andrés Ortiz-Muñoz, Emma P. Bingham

评论： 22页，7图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 种群与进化 (q-bio.PE)

[12] arXiv:2503.04507 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 一种用于药物发现的莫尔斯变换 显示英文标题

标题： A Morse Transform for Drug Discovery

Alexander M. Tanaka, Aras T. Asaad, Richard Cooper, Vidit Nanda

评论： 25页，5个主要图表，2个主要表格，6个补充图表和4个补充表格

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[13] arXiv:2503.04851 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： VenusMutHub：在小规模实验数据上对蛋白质突变效应预测器的系统评估 显示英文标题

标题： VenusMutHub: A systematic evaluation of protein mutation effect predictors on small-scale experimental data

Liang Zhang, Hua Pang, Chenghao Zhang, Song Li, Yang Tan, Fan Jiang, Mingchen Li, Yuanxi Yu, Ziyi Zhou, Banghao Wu, Bingxin Zhou, Hao Liu, Pan Tan, Liang Hong

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[14] arXiv:2503.05591 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 利用IUPAC名称和机器学习辅助药物发现和开发，以人酪氨酸-DNA磷酸二酯酶1（TDP1）抑制剂为例 显示英文标题

标题： Leveraging of the IUPAC Names and Machine Learning for Assisting Drug Discovery and Development, demonstrated on the Case of Human Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase 1 (TDP1) Inhibitors

Mariya L. Ivanova, Nicola Russo, Gueorgui Mihaylov, Konstantin Nikolic

评论： 18页，7图，7表

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[15] arXiv:2503.07283 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 后新冠综合征（PCS）的子领域——基于人群的研究 显示英文标题

标题： Subdomains of Post-COVID-Syndrome (PCS) -- A Population-Based Study

Sabrina Ballhausen, Anne-Kathrin Ruß, Wolfgang Lieb, Anna Horn, Lilian Krist, Julia Fricke, Carmen Scheibenbogen, Klaus F. Rabe, Walter Maetzler, Corina Maetzler, Martin Laudien, Derk Frank, Jan Heyckendorf, Olga Miljukov, Karl Georg Haeusler, Nour Eddine El Mokthari, Martin Witzenrath, Jörg Janne Vehreschild, Katharina S. Appel, Irina Chaplinskaya-Sobol, Thalea Tamminga, Carolin Nürnberger, Lena Schmidbauer, Caroline Morbach, Stefan Störk, Jens-Peter Reese, Thomas Keil, Peter Heuschmann, Stefan Schreiber, Michael Krawczak, Thomas Bahmer

评论： 29页和6页的补充材料，3张表格正文手稿，4张补充表格，4张图

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[16] arXiv:2503.07451 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 使用连续Petri网建模HIF-ILK相互作用 显示英文标题

标题： Modeling HIF-ILK Interaction Using Continuous Petri Nets

Viktor Gilin, Sanne Laauwen, Yuying Xia, Noria Yousufi, Lu Cao

期刊参考： 第18届国际生物医学工程系统与技术会议论文集 - 生物信息学，2025

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[17] arXiv:2503.07477 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 拟南芥根毛对磷饥饿响应的Petri网建模 显示英文标题

标题： Petri Net Modeling of Root Hair Response to Phosphate Starvation in Arabidopsis Thaliana

Amber H. B. Fijn, Casper H. Stiekema, Stijn Boere, Marijan Višić, Lu Cao

期刊参考： 第18届国际生物医学工程系统与技术会议论文集 - 生物信息学，2025

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[18] arXiv:2503.07664 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 抗生素耐药性微生物学数据集（ARMD）：来自电子健康记录的抗菌药物耐药性资源 显示英文标题

标题： Antibiotic Resistance Microbiology Dataset (ARMD): A Resource for Antimicrobial Resistance from EHRs

Fateme Nateghi Haredasht, Fatemeh Amrollahi, Manoj Maddali, Nicholas Marshall, Stephen P. Ma, Lauren N. Cooper, Andrew O. Johnson, Ziming Wei, Richard J. Medford, Sanjat Kanjilal, Niaz Banaei, Stanley Deresinski, Mary K. Goldstein, Steven M. Asch, Amy Chang, Jonathan H. Chen

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 信息检索 (cs.IR) ; 机器学习 (cs.LG) ; 应用 (stat.AP)

[19] arXiv:2503.08598 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 面向物种分类的\textit{拟平行果蝇}组 显示英文标题

标题： Towards species' classification of the \textit{Anastrepha pseudoparallela} group

Gabriel R. Palma, Rocío Alaiz, Alexandre S. Araújo, Marcoandre Savaris, Roberto A. Zucchi, Charles Markham, Rafael A. Moral

评论： 35页

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[20] arXiv:2503.08732 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 量化重症监护病房患者的昼夜节律失调及其与谵妄的关系 显示英文标题

标题： Quantifying Circadian Desynchrony in ICU Patients and Its Association with Delirium

Yuanfang Ren, Andrea E. Davidson, Jiaqing Zhang, Miguel Contreras, Ayush K. Patel, Michelle Gumz, Tezcan Ozrazgat-Baslanti, Parisa Rashidi, Azra Bihorac

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI)

[21] arXiv:2503.08746 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 计算机模拟临床试验在药物开发中的系统综述 显示英文标题

标题： In silico clinical trials in drug development: a systematic review

Bohua Chen, Lucia Chantal Schneider, Christian Röver, Emmanuelle Comets, Markus Christian Elze, Andrew Hooker, Joanna IntHout, Anne-Sophie Jannot, Daria Julkowska, Yanis Mimouni, Marina Savelieva, Nigel Stallard, Moreno Ursino, Marc Vandemeulebroecke, Sebastian Weber, Martin Posch, Sarah Zohar, Tim Friede

评论： 30页，9图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 方法论 (stat.ME)

[22] arXiv:2503.08747 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 生成式人工智能用于通过磁共振成像检测癌症 显示英文标题

标题： IA generativa aplicada a la detección del cáncer a través de Resonancia Magnética

Virginia del Campo, Iker Malaina

评论： 在西班牙语中

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[23] arXiv:2503.08938 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于数据的阿尔茨海默病淀粉样蛋白β靶向抗体建模 显示英文标题

标题： Data-Driven Modeling of Amyloid-beta Targeted Antibodies for Alzheimer's Disease

Kobra Rabiei, Jeffrey R. Petrella, Suzanne Lenhart, Chun Liu, P. Murali Doraiswamy, Wenrui Hao

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[24] arXiv:2503.09007 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 使用外源性噪声驱动的神经随机微分方程重建噪声基因调控动力学 显示英文标题

标题： Reconstructing Noisy Gene Regulation Dynamics Using Extrinsic-Noise-Driven Neural Stochastic Differential Equations

Jiancheng Zhang, Xiangting Li, Xiaolu Guo, Zhaoyi You, Lucas Böttcher, Alex Mogilner, Alexander Hoffman, Tom Chou, Mingtao Xia

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[25] arXiv:2503.10362 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： BioSerenity-E1：一种用于医疗应用的自监督EEG模型 显示英文标题

标题： BioSerenity-E1: a self-supervised EEG model for medical applications

Ruggero G. Bettinardi, Mohamed Rahmouni, Ulysse Gimenez

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 信号处理 (eess.SP) ; 神经与认知 (q-bio.NC)

[26] arXiv:2503.10510 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于注意力的全切片图像分类的极限学习机 显示英文标题

标题： Extreme Learning Machines for Attention-based Multiple Instance Learning in Whole-Slide Image Classification

Rajiv Krishnakumar, Julien Baglio, Frederik F. Flöther, Christian Ruiz, Stefan Habringer, Nicole H. Romano

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 量子物理 (quant-ph)

[27] arXiv:2503.10708 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 通过物理信息深度学习方法探索乙型肝炎病毒传播动力学 显示英文标题

标题： Exploration of Hepatitis B Virus Infection Dynamics through Physics-Informed Deep Learning Approach

Bikram Das, Rupchand Sutradhar, D C Dalal

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[28] arXiv:2503.11347 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 整合动态系统建模与时空scRNA-seq数据分析 显示英文标题

标题： Integrating Dynamical Systems Modeling with Spatiotemporal scRNA-seq Data Analysis

Zhenyi Zhang, Yuhao Sun, Qiangwei Peng, Tiejun Li, Peijie Zhou

期刊参考： 熵-2025

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 生物物理 (physics.bio-ph)

[29] arXiv:2503.12330 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 通过实时代谢分析计算识别酮体代谢作为睡眠稳定性和昼夜节律动态的关键调节因子 显示英文标题

标题： Computational identification of ketone metabolism as a key regulator of sleep stability and circadian dynamics via real-time metabolic profiling

Hao Huang, Kaijing Xu, Michael Lardelli

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 基因组学 (q-bio.GN) ; 神经与认知 (q-bio.NC)

[30] arXiv:2503.13627 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 最优复合筛选以促进多样性和平行化学 显示英文标题

标题： Optimal compound downselection to promote diversity and parallel chemistry

Jenna C. Fromer, Alexandra D. Volkova, Connor W. Coley

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[31] arXiv:2503.14009 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 通过定性动力学发展霍乱暴发预测：马拉维案例研究的见解 显示英文标题

标题： Developing cholera outbreak forecasting through qualitative dynamics: Insights into Malawi case study

Adrita Ghosh, Parthasakha Das, Tanujit Chakraborty, Pritha Das, Dibakar Ghosh

期刊参考： 《理论生物学杂志》，2025年

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 动力系统 (math.DS) ; 混沌动力学 (nlin.CD) ; 机器学习 (stat.ML)

[32] arXiv:2503.14253 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 肉桂：单粒子追踪数据中变化点检测与参数估计的混合方法 显示英文标题

标题： CINNAMON: A hybrid approach to change point detection and parameter estimation in single-particle tracking data

Jakub Malinowski, Marcin Kostrzewa, Michał Balcerek, Weronika Tomczuk, Janusz Szwabiński

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[33] arXiv:2503.14512 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于时间序列分析因果推理的中国stroke预测机器学习算法 显示英文标题

标题： Machine learning algorithms to predict stroke in China based on causal inference of time series analysis

Qizhi Zheng, Ayang Zhao, Xinzhu Wang, Yanhong Bai, Zikun Wang, Xiuying Wang, Xianzhang Zeng, Guanghui Dong

评论： 17页

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 应用 (stat.AP) ; 机器学习 (stat.ML)

[34] arXiv:2503.14528 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 路易斯安那州医疗补助计划参保者中烟草使用和社会决定因素对呼吸健康差异的纵向影响 显示英文标题

标题： Longitudinal Impact of Tobacco Use and Social Determinants on Respiratory Health Disparities Among Louisiana Medicaid Enrollees

Yead Rahman, Prerna Dua

评论： 29页，3个图，5个表格

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 应用 (stat.AP)

[35] arXiv:2503.14561 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 使用稀疏血液生物标志物识别疾病发作的关键阶段 显示英文标题

标题： Identifying Critical Phases for Disease Onset with Sparse Haematological Biomarkers

Andrea Zerio, Maya Bechler-Speicher, Tine Jess, Aleksejs Sazonovs

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[36] arXiv:2503.14571 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 高效数据选择用于训练基因组扰动模型 显示英文标题

标题： Efficient Data Selection for Training Genomic Perturbation Models

George Panagopoulos, Johannes F. Lutzeyer, Sofiane Ennadir, Michalis Vazirgiannis, Jun Pang

评论： 17页

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[37] arXiv:2503.14574 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 使用贝塞尔曲线的序列分析 显示英文标题

标题： Sequence Analysis Using the Bezier Curve

Taslim Murad, Sarwan Ali, Murray Patterson

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[38] arXiv:2503.14841 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 三维脉冲响应模型：按照能源系统特定适应性对训练过程进行建模 显示英文标题

标题： The three-dimensional impulse-response model: Modeling the training process in accordance with energy system-specific adaptation

Hilkka Kontro, Armando Mastracci, Stephen S. Cheung, Martin J. MacInnis

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[39] arXiv:2503.16214 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 针对神经退行性变：使用PubChem和Scikit-learn发现G9a抑制剂的三种机器学习方法 显示英文标题

标题： Targeting Neurodegeneration: Three Machine Learning Methods for G9a Inhibitors Discovery Using PubChem and Scikit-learn

Mariya L. Ivanova, Nicola Russo, Konstantin Nikolic

评论： 25页，13图，14表

期刊参考： 计算机辅助分子设计杂志，2025

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[40] arXiv:2503.16560 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 阿尔茨海默病及相关痴呆的早期预测：利用健康社会决定因素数据的机器学习方法 显示英文标题

标题： Early Prediction of Alzheimer's and Related Dementias: A Machine Learning Approach Utilizing Social Determinants of Health Data

Bereket Kindo, Arjee Restar, Anh Tran

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 应用 (stat.AP)

[41] arXiv:2503.17135 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 现象学增长模型在流行病预测中的结构与实际可辨识性 显示英文标题

标题： Structural and Practical Identifiability of Phenomenological Growth Models for Epidemic Forecasting

Yuganthi R. Liyanage, Gerardo Chowell, Gleb Pogudin, Necibe Tuncer

评论： 28页，6幅图。本文已被接受发表于《病毒学》

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[42] arXiv:2503.17293 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 利用统计模型提高休闲渔业的赛前预测和赛中管理 显示英文标题

标题： Leveraging statistical models to improve pre-season forecasting and in-season management of a recreational fishery

A. Challen Hyman, Chloe Ramsay, Tiffanie A. Cross, Beverly Sauls, Thomas K. Frazer

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 应用 (stat.AP)

[43] arXiv:2503.17550 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于可验证临床计算器及其元数据的LLM驱动的临床计算器聊天机器人 显示英文标题

标题： An LLM-Powered Clinical Calculator Chatbot Backed by Verifiable Clinical Calculators and their Metadata

Niranjan Kumar, Farid Seifi, Marisa Conte, Allen Flynn

评论： 10页，6表，1图

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[44] arXiv:2503.17656 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： NaFM：为小分子天然产物预训练基础模型 显示英文标题

标题： NaFM: Pre-training a Foundation Model for Small-Molecule Natural Products

Yuheng Ding, Bo Qiang, Yiran Zhou, Jie Yu, Qi Li, Liangren Zhang, Yusong Wang, Zhenmin Liu

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[45] arXiv:2503.18356 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： GRiNS：用于模拟基因调控网络动力学的Python库 显示英文标题

标题： GRiNS: A Python Library for Simulating Gene Regulatory Network Dynamics

Pradyumna Harlapur, Harshavardhan B V, Mohit Kumar Jolly

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 分子网络 (q-bio.MN)

[46] arXiv:2503.19935 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： CAN-STRESS：用于理解大麻使用、压力和生理反应的真实世界多模态数据集 显示英文标题

标题： CAN-STRESS: A Real-World Multimodal Dataset for Understanding Cannabis Use, Stress, and Physiological Responses

Reza Rahimi Azghan, Nicholas C. Glodosky, Ramesh Kumar Sah, Carrie Cuttler, Ryan McLaughlin, Michael J. Cleveland, Hassan Ghasemzadeh

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[47] arXiv:2503.20158 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： RxRx3-core：高内涵显微镜中药物-靶点相互作用的基准测试 显示英文标题

标题： RxRx3-core: Benchmarking drug-target interactions in High-Content Microscopy

Oren Kraus, Federico Comitani, John Urbanik, Kian Kenyon-Dean, Lakshmanan Arumugam, Saber Saberian, Cas Wognum, Safiye Celik, Imran S. Haque

评论： 发表于ICLR 2025年LMRL研讨会；基于过滤化合物井更新基因-基因相互作用结果后再计算已知关系基准

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 细胞行为 (q-bio.CB)

[48] arXiv:2503.20278 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 单元作为标记：语言模型中的高维几何和单元嵌入 显示英文标题

标题： The cell as a token: high-dimensional geometry in language models and cell embeddings

William Gilpin

评论： 4页，2图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[49] arXiv:2503.20357 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于生物标志物的衰老干预对医疗成本和个人价值的经济影响 显示英文标题

标题： Economic impact of biomarker-based aging interventions on healthcare costs and individual value

Federico Felizzi

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 一般经济学 (econ.GN)

[50] arXiv:2503.20766 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： PatchWorkPlot：多个序列上局部比对的同步可视化 显示英文标题

标题： PatchWorkPlot: simultaneous visualization of local alignments across multiple sequences

Mariia Pospelova, Yana Safonova

主题： 定量方法 (q-bio.QM)