定量生物学

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2025年10月20日， 星期一 (展示 10 之 10 条目 )

[32] arXiv:2510.15828 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： GENESIS：情景语义交互的生成模型 显示英文标题

标题： GENESIS: A Generative Model of Episodic-Semantic Interaction

Marco D'Alessandro, Leo D'Amato, Mikel Elkano, Mikel Uriz, Giovanni Pezzulo

评论： 17页，6图

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 人工智能 (cs.AI)

[33] arXiv:2510.15826 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 量化迈阿密戴德县长期基孔肯雅热持续的风险 显示英文标题

标题： Quantifying the Risk of Long Term Chikungunya Persistence in Miami Dade County

Antonio Gondim, Leonardo Schultz, Xi Huo, Shigui Ruan

主题： 种群与进化 (q-bio.PE)

[34] arXiv:2510.15811 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 肥料促进，杀虫剂稳定：解决农业中富营养化的悖论 显示英文标题

标题： Fertilizers Fuel, Insecticides Stabilize: Resolving the Paradox of Enrichment in Agriculture

Vaibhava Srivastava, Jason R. Rohr, Rana D. Parshad

主题： 种群与进化 (q-bio.PE)

[35] arXiv:2510.15745 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 2025年大脑模拟报告状态 显示英文标题

标题： State of Brain Emulation Report 2025

Niccolò Zanichelli, Maximilian Schons, Isaak Freeman, Philip Shiu, Anton Arkhipov

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[36] arXiv:2510.14997 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 机器学习算法在预测糖尿病患者肾病和心脏病早期检测中的评估与实现 显示英文标题

标题： Evaluation and Implementation of Machine Learning Algorithms to Predict Early Detection of Kidney and Heart Disease in Diabetic Patients

Syed Ibad Hasnain

评论： 这篇论文是在达拉克什安·萨利姆教授的指导下完成的。我深深感谢她在我的研究生学习期间给予的指导和帮助。

主题： 其他定量生物学 (q-bio.OT) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[37] arXiv:2510.14989 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 带有硬结构约束的蛋白质设计的约束扩散 显示英文标题

标题： Constrained Diffusion for Protein Design with Hard Structural Constraints

Jacob K. Christopher, Austin Seamann, Jingyi Cui, Sagar Khare, Ferdinando Fioretto

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[38] arXiv:2510.14984 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： $\textit{Less In More Out}$的力学：建模基于织物的软体机器人心脏 显示英文标题

标题： The mechanics of $\textit{Less In More Out}$: modeling fabric-based soft robotic hearts

Marin Lauber, Mathias Peirlinck

主题： 组织与器官 (q-bio.TO) ; 计算物理 (physics.comp-ph)

[39] arXiv:2510.15542 (交叉列表自 cs.NE) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： SpikeFit：面向神经形态硬件的脉冲网络最优部署 显示英文标题

标题： SpikeFit: Towards Optimal Deployment of Spiking Networks on Neuromorphic Hardware

Ivan Kartashov, Mariia Pushkareva, Iakov Karandashev

评论： 13页，2图。正在进行中

主题： 神经与进化计算 (cs.NE) ; 机器学习 (cs.LG) ; 神经与认知 (q-bio.NC)

[40] arXiv:2510.15478 (交叉列表自 physics.bio-ph) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 在生理氧和盐条件下，超高速率辐射的DNA的保留 显示英文标题

标题： Sparing of DNA irradiated with Ultra-High Dose-Rates under Physiological Oxygen and Salt conditions

Marc Benjamin Hahn (1), Sepideh Aminzadeh-Gohari (2), Anna Grebinyk (2), Matthias Gross (2), Andreas Hoffmann (2), Xiangkun Li (2), Anne Oppelt (2), Chris Richard (2), Felix Riemer (2), Frank Stephan (2), Elif Tarakci (2), Daniel Villani (2) ((1) Institut für Chemie, Universität Potsdam, Karl-Liebknecht-Str. 24-25, 14476 Potsdam, Germany, (2) Deutsches Elektronen-Synchrotron, DESY, Platanenallee 6, 15738 Zeuthen, Germany)

评论： 34页，12图

主题： 生物物理 (physics.bio-ph) ; 化学物理 (physics.chem-ph) ; 医学物理 (physics.med-ph) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[41] arXiv:2510.15127 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 通过进化博弈论框架在临床重症监护环境中导航机械通气的后果 显示英文标题

标题： Navigating the consequences of mechanical ventilation in clinical intensive care settings through an evolutionary game-theoretic framework

David J. Albers, Tell D. Bennett, Jana de Wiljes, Bradford J. Smith, Peter D. Sottile, J.N. Stroh

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 优化与控制 (math.OC) ; 定量方法 (q-bio.QM)

2025年10月17日， 星期五 (展示 首先 24 之 15 条目 )

[42] arXiv:2510.14917 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 累积量、矩和选择：进化与统计之间的联系 显示英文标题

标题： Cumulants, Moments and Selection: The Connection Between Evolution and Statistics

Hasan Ahmed, Deena Goodgold, Khushali Kothari, Rustom Antia

主题： 种群与进化 (q-bio.PE)

[43] arXiv:2510.14601 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 任务执行中大脑反应沿感觉运动-关联轴的非线性偏移 显示英文标题

标题： Nonlinear shift along the sensorimotor-association-axis in brain responses to task performance

Fan Cao, Yuqi Yuan, Xiaohui Yan, Bohan Zhang, Kyle Perkins

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[44] arXiv:2510.14486 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 语义表示在生物启发的交叉监督神经网络集合中出现 显示英文标题

标题： Semantic representations emerge in biologically inspired ensembles of cross-supervising neural networks

Roy Urbach, Elad Schneidman

评论： 29页，8图，2个补充图

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 人工智能 (cs.AI)

[45] arXiv:2510.14481 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 细胞水平上的病毒种群动力学，考虑复制周期 显示英文标题

标题： Viral population dynamics at the cellular level, considering the replication cycle

Seong Jun Park

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 定量方法 (q-bio.QM)

[46] arXiv:2510.14382 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： “什么”和“何时”预测在储层脉冲网络中通过误差调制可塑性进行联合编码 显示英文标题

标题： Joint encoding of "what" and "when" predictions through error-modulated plasticity in reservoir spiking networks

Yohei Yamada, Zenas C. Chao

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[47] arXiv:2510.14282 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 可进化化学感受器：迈向自主与进化的整合 显示英文标题

标题： Evolvable Chemotons: Toward the Integration of Autonomy and Evolution

Kazuya Horibe, Daichi G. Suzuki

评论： 被接受为ALIFE 2025的最新摘要

主题： 种群与进化 (q-bio.PE)

[48] arXiv:2510.14227 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 感觉运动依赖关系与认知的感觉运动方法 显示英文标题

标题： Sensorimotor Contingencies and The Sensorimotor Approach to Cognition

Denizhan Pak

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[49] arXiv:2510.14188 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 使用信息几何表征脑电中的高阶交互作用 显示英文标题

标题： Using Information Geometry to Characterize Higher-Order Interactions in EEG

Eric Albers, Paul Marriott, Masami Tatsuno

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 定量方法 (q-bio.QM)

[50] arXiv:2510.13932 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： SUND：使用非线性动态模型进行仿真 - 用于以模块化方式模拟多级、时间动态系统的工具箱 显示英文标题

标题： SUND: simulation using nonlinear dynamic models - a toolbox for simulating multi-level, time-dynamic systems in a modular way

Henrik Podéus (1), Gustav Magnusson (2), Sasan Keshmiri (1), Kajsa Tunedal (1, 2), Nicolas Sundqvist (1), William Lövfors (1), Gunnar Cedersund (1, 2, 3) ((1) Department of Biomedical Engineering, Linköping University, Linköping, Sweden, (2) Center for Medical Image Science and Visualization (CMIV), Linköping University, Linköping, Sweden, (3) School of Medical Sciences and Inflammatory Response and Infection Susceptibility Centre (iRiSC), Faculty of Medicine and Health, Örebro, Sweden)

评论： 6页，1图，软件论文。最后两位作者对本工作贡献相同。Gunnar Cedersund是通讯作者

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[51] arXiv:2510.13911 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 口腔GPT：一种用于口腔黏膜疾病诊断和描述的两阶段视觉-语言模型 显示英文标题

标题： OralGPT: A Two-Stage Vision-Language Model for Oral Mucosal Disease Diagnosis and Description

Jia Zhang, Bodong Du, Yitong Miao, Dongwei Sun, Xiangyong Cao

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[52] arXiv:2510.13897 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 双注意力ResNet在DCE-MRI的HER2预测中优于Transformer 显示英文标题

标题： Dual-attention ResNet outperforms transformers in HER2 prediction on DCE-MRI

Naomi Fridman, Anat Goldstein

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI)

[53] arXiv:2510.13896 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： GenCellAgent：通过大型语言模型代理实现可推广的、无需训练的细胞图像分割 显示英文标题

标题： GenCellAgent: Generalizable, Training-Free Cellular Image Segmentation via Large Language Model Agents

Xi Yu, Yang Yang, Qun Liu, Yonghua Du, Sean McSweeney, Yuewei Lin

评论： 43页

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 计算机视觉与模式识别 (cs.CV) ; 多智能体系统 (cs.MA)

[54] arXiv:2510.13894 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 贝叶斯还是海森堡：谁（谁）在统治？ 显示英文标题

标题： Bayes or Heisenberg: Who(se) Rules?

Volker Tresp Hang Li, Federico Harjes, Yunpu Ma

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG) ; 量子物理 (quant-ph)

[55] arXiv:2510.13886 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于物理信息的自编码器用于DSC-MRI灌注后处理：胶质瘤分级的应用 显示英文标题

标题： Physics-Informed autoencoder for DSC-MRI Perfusion post-processing: application to glioma grading

Pierre Fayolle, Alexandre Bône, Noëlie Debs, Mathieu Naudin, Pascal Bourdon, Remy Guillevin, David Helbert

评论： 5页，5图，IEEE ISBI 2025，休斯顿，德克萨斯州，美国

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 图像与视频处理 (eess.IV) ; 信号处理 (eess.SP)

[56] arXiv:2510.13883 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 大型语言模型代理实现微孔微流控的自主设计与图像分析 显示英文标题

标题： Large Language Model Agents Enable Autonomous Design and Image Analysis of Microwell Microfluidics

Dinh-Nguyen Nguyen, Sadia Shakil, Raymond Kai-Yu Tong, Ngoc-Duy Dinh

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 多智能体系统 (cs.MA)