定量生物学

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2025年10月17日， 星期五 (展示 24 之 24 条目 )

[42] arXiv:2510.14917 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 累积量、矩和选择：进化与统计之间的联系 显示英文标题

标题： Cumulants, Moments and Selection: The Connection Between Evolution and Statistics

Hasan Ahmed, Deena Goodgold, Khushali Kothari, Rustom Antia

主题： 种群与进化 (q-bio.PE)

[43] arXiv:2510.14601 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 任务执行中大脑反应沿感觉运动-关联轴的非线性偏移 显示英文标题

标题： Nonlinear shift along the sensorimotor-association-axis in brain responses to task performance

Fan Cao, Yuqi Yuan, Xiaohui Yan, Bohan Zhang, Kyle Perkins

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[44] arXiv:2510.14486 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 语义表示在生物启发的交叉监督神经网络集合中出现 显示英文标题

标题： Semantic representations emerge in biologically inspired ensembles of cross-supervising neural networks

Roy Urbach, Elad Schneidman

评论： 29页，8图，2个补充图

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 人工智能 (cs.AI)

[45] arXiv:2510.14481 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 细胞水平上的病毒种群动力学，考虑复制周期 显示英文标题

标题： Viral population dynamics at the cellular level, considering the replication cycle

Seong Jun Park

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 定量方法 (q-bio.QM)

[46] arXiv:2510.14382 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： “什么”和“何时”预测在储层脉冲网络中通过误差调制可塑性进行联合编码 显示英文标题

标题： Joint encoding of "what" and "when" predictions through error-modulated plasticity in reservoir spiking networks

Yohei Yamada, Zenas C. Chao

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[47] arXiv:2510.14282 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 可进化化学感受器：迈向自主与进化的整合 显示英文标题

标题： Evolvable Chemotons: Toward the Integration of Autonomy and Evolution

Kazuya Horibe, Daichi G. Suzuki

评论： 被接受为ALIFE 2025的最新摘要

主题： 种群与进化 (q-bio.PE)

[48] arXiv:2510.14227 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 感觉运动依赖关系与认知的感觉运动方法 显示英文标题

标题： Sensorimotor Contingencies and The Sensorimotor Approach to Cognition

Denizhan Pak

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[49] arXiv:2510.14188 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 使用信息几何表征脑电中的高阶交互作用 显示英文标题

标题： Using Information Geometry to Characterize Higher-Order Interactions in EEG

Eric Albers, Paul Marriott, Masami Tatsuno

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 定量方法 (q-bio.QM)

[50] arXiv:2510.13932 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： SUND：使用非线性动态模型进行仿真 - 用于以模块化方式模拟多级、时间动态系统的工具箱 显示英文标题

标题： SUND: simulation using nonlinear dynamic models - a toolbox for simulating multi-level, time-dynamic systems in a modular way

Henrik Podéus (1), Gustav Magnusson (2), Sasan Keshmiri (1), Kajsa Tunedal (1, 2), Nicolas Sundqvist (1), William Lövfors (1), Gunnar Cedersund (1, 2, 3) ((1) Department of Biomedical Engineering, Linköping University, Linköping, Sweden, (2) Center for Medical Image Science and Visualization (CMIV), Linköping University, Linköping, Sweden, (3) School of Medical Sciences and Inflammatory Response and Infection Susceptibility Centre (iRiSC), Faculty of Medicine and Health, Örebro, Sweden)

评论： 6页，1图，软件论文。最后两位作者对本工作贡献相同。Gunnar Cedersund是通讯作者

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[51] arXiv:2510.13911 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 口腔GPT：一种用于口腔黏膜疾病诊断和描述的两阶段视觉-语言模型 显示英文标题

标题： OralGPT: A Two-Stage Vision-Language Model for Oral Mucosal Disease Diagnosis and Description

Jia Zhang, Bodong Du, Yitong Miao, Dongwei Sun, Xiangyong Cao

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[52] arXiv:2510.13897 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 双注意力ResNet在DCE-MRI的HER2预测中优于Transformer 显示英文标题

标题： Dual-attention ResNet outperforms transformers in HER2 prediction on DCE-MRI

Naomi Fridman, Anat Goldstein

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI)

[53] arXiv:2510.13896 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： GenCellAgent：通过大型语言模型代理实现可推广的、无需训练的细胞图像分割 显示英文标题

标题： GenCellAgent: Generalizable, Training-Free Cellular Image Segmentation via Large Language Model Agents

Xi Yu, Yang Yang, Qun Liu, Yonghua Du, Sean McSweeney, Yuewei Lin

评论： 43页

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 计算机视觉与模式识别 (cs.CV) ; 多智能体系统 (cs.MA)

[54] arXiv:2510.13894 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 贝叶斯还是海森堡：谁（谁）在统治？ 显示英文标题

标题： Bayes or Heisenberg: Who(se) Rules?

Volker Tresp Hang Li, Federico Harjes, Yunpu Ma

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG) ; 量子物理 (quant-ph)

[55] arXiv:2510.13886 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于物理信息的自编码器用于DSC-MRI灌注后处理：胶质瘤分级的应用 显示英文标题

标题： Physics-Informed autoencoder for DSC-MRI Perfusion post-processing: application to glioma grading

Pierre Fayolle, Alexandre Bône, Noëlie Debs, Mathieu Naudin, Pascal Bourdon, Remy Guillevin, David Helbert

评论： 5页，5图，IEEE ISBI 2025，休斯顿，德克萨斯州，美国

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 图像与视频处理 (eess.IV) ; 信号处理 (eess.SP)

[56] arXiv:2510.13883 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 大型语言模型代理实现微孔微流控的自主设计与图像分析 显示英文标题

标题： Large Language Model Agents Enable Autonomous Design and Image Analysis of Microwell Microfluidics

Dinh-Nguyen Nguyen, Sadia Shakil, Raymond Kai-Yu Tong, Ngoc-Duy Dinh

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 多智能体系统 (cs.MA)

[57] arXiv:2510.13845 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 多模态大语言模型中的具体实现 显示英文标题

标题： Embodiment in multimodal large language models

Akila Kadambi, Lisa Aziz-Zadeh, Antonio Damasio, Marco Iacoboni, Srini Narayanan

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[58] arXiv:2510.13841 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于脑部MRI分类自闭症的混合深度学习方法 显示英文标题

标题： Hybrid Deep Learning Approaches for Classifying Autism from Brain MRI

Ashley Chen

评论： 25页，13图，4表，19参考文献

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 机器学习 (cs.LG)

[59] arXiv:2510.13826 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 面向神经认知启发的智能：从人工智能的结构模仿到类人功能认知 显示英文标题

标题： Towards Neurocognitive-Inspired Intelligence: From AI's Structural Mimicry to Human-Like Functional Cognition

Noorbakhsh Amiri Golilarz, Hassan S. Al Khatib, Shahram Rahimi

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 人工智能 (cs.AI)

[60] arXiv:2510.13816 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： GQVis：用于生成式人工智能的基因组数据问题和可视化数据集 显示英文标题

标题： GQVis: A Dataset of Genomics Data Questions and Visualizations for Generative AI

Skylar Sargent Walters, Arthea Valderrama, Thomas C. Smits, David Kouřil, Huyen N. Nguyen, Sehi L'Yi, Devin Lange, Nils Gehlenborg

主题： 基因组学 (q-bio.GN) ; 人工智能 (cs.AI) ; 人机交互 (cs.HC) ; 机器学习 (cs.LG)

[61] arXiv:2510.13815 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 一种用于儿科癫痫严重程度的双特征定量脑电图指数：在CHB-MIT上的外部预验证及向Dravet队列的路线图 显示英文标题

标题： A Two-Feature Quantitative EEG Index of Pediatric Epilepsy Severity: External Pre-Validation on CHB-MIT and Roadmap to Dravet Cohorts

Khartik Uppalapati, Bora Yimenicioglu, Shakeel Abdulkareem, Bhavya Uppalapati, Viraj Kamath, Adan Eftekhari, Pranav Ayyappan

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[62] arXiv:2510.14787 (交叉列表自 eess.SY) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 一种用于分析和控制虫媒疾病传播的人-媒介易感-感染-易感模型 显示英文标题

标题： A Human-Vector Susceptible-Infected-Susceptible Model for Analyzing and Controlling the Spread of Vector-Borne Diseases

Lorenzo Zino, Alessandro Casu, Alessandro Rizzo

评论： 发表于2025年欧洲控制会议（ECC）论文集

期刊参考： 2025年欧洲控制会议论文集，第1219-1224页，2025

主题： 系统与控制 (eess.SY) ; 优化与控制 (math.OC) ; 种群与进化 (q-bio.PE)

[63] arXiv:2510.14455 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 编码器作为编辑器：代码驱动的可解释分子优化 显示英文标题

标题： Coder as Editor: Code-driven Interpretable Molecular Optimization

Wenyu Zhu, Chengzhu Li, Xiaohe Tian, Yifan Wang, Yinjun Jia, Jianhui Wang, Bowen Gao, Ya-Qin Zhang, Wei-Ying Ma, Yanyan Lan

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[64] arXiv:2510.14311 (交叉列表自 math.AP) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 传播速度的行波扩散Lotka-Volterra系统强竞争 显示英文标题

标题： Propagation speed of traveling waves for diffusive Lotka-Volterra system with strong competition

Ken-Ichi Nakamura, Toshiko Ogiwara

评论： 15页，2图

主题： 偏微分方程分析 (math.AP) ; 种群与进化 (q-bio.PE)

[65] arXiv:2510.14143 (交叉列表自 cs.CV) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 三次方：CUDA加速的三维生物图像计算 显示英文标题

标题： cubic: CUDA-accelerated 3D Bioimage Computing

Alexandr A. Kalinin, Anne E. Carpenter, Shantanu Singh, Matthew J. O'Meara

评论： 被ICCV 2025生物图像计算研讨会接收

主题： 计算机视觉与模式识别 (cs.CV) ; 定量方法 (q-bio.QM)

2025年10月16日， 星期四 (展示 首先 17 之 1 条目 )

[66] arXiv:2510.13688 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于雅可比矩阵的非线性神经编码模型解释 显示英文标题

标题： Jacobian-Based Interpretation of Nonlinear Neural Encoding Model

Xiaohui Gao, Haoran Yang, Yue Cheng, Mengfei Zuo, Yiheng Liu, Peiyang Li, Xintao Hu

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)