定量生物学

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2025年10月17日， 星期五 (继续， 展示 最后 24 之 15 条目 )

[51] arXiv:2510.13911 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 口腔GPT：一种用于口腔黏膜疾病诊断和描述的两阶段视觉-语言模型 显示英文标题

标题： OralGPT: A Two-Stage Vision-Language Model for Oral Mucosal Disease Diagnosis and Description

Jia Zhang, Bodong Du, Yitong Miao, Dongwei Sun, Xiangyong Cao

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[52] arXiv:2510.13897 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 双注意力ResNet在DCE-MRI的HER2预测中优于Transformer 显示英文标题

标题： Dual-attention ResNet outperforms transformers in HER2 prediction on DCE-MRI

Naomi Fridman, Anat Goldstein

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI)

[53] arXiv:2510.13896 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： GenCellAgent：通过大型语言模型代理实现可推广的、无需训练的细胞图像分割 显示英文标题

标题： GenCellAgent: Generalizable, Training-Free Cellular Image Segmentation via Large Language Model Agents

Xi Yu, Yang Yang, Qun Liu, Yonghua Du, Sean McSweeney, Yuewei Lin

评论： 43页

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 计算机视觉与模式识别 (cs.CV) ; 多智能体系统 (cs.MA)

[54] arXiv:2510.13894 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 贝叶斯还是海森堡：谁（谁）在统治？ 显示英文标题

标题： Bayes or Heisenberg: Who(se) Rules?

Volker Tresp Hang Li, Federico Harjes, Yunpu Ma

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG) ; 量子物理 (quant-ph)

[55] arXiv:2510.13886 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于物理信息的自编码器用于DSC-MRI灌注后处理：胶质瘤分级的应用 显示英文标题

标题： Physics-Informed autoencoder for DSC-MRI Perfusion post-processing: application to glioma grading

Pierre Fayolle, Alexandre Bône, Noëlie Debs, Mathieu Naudin, Pascal Bourdon, Remy Guillevin, David Helbert

评论： 5页，5图，IEEE ISBI 2025，休斯顿，德克萨斯州，美国

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 图像与视频处理 (eess.IV) ; 信号处理 (eess.SP)

[56] arXiv:2510.13883 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 大型语言模型代理实现微孔微流控的自主设计与图像分析 显示英文标题

标题： Large Language Model Agents Enable Autonomous Design and Image Analysis of Microwell Microfluidics

Dinh-Nguyen Nguyen, Sadia Shakil, Raymond Kai-Yu Tong, Ngoc-Duy Dinh

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 多智能体系统 (cs.MA)

[57] arXiv:2510.13845 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 多模态大语言模型中的具体实现 显示英文标题

标题： Embodiment in multimodal large language models

Akila Kadambi, Lisa Aziz-Zadeh, Antonio Damasio, Marco Iacoboni, Srini Narayanan

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[58] arXiv:2510.13841 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于脑部MRI分类自闭症的混合深度学习方法 显示英文标题

标题： Hybrid Deep Learning Approaches for Classifying Autism from Brain MRI

Ashley Chen

评论： 25页，13图，4表，19参考文献

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 机器学习 (cs.LG)

[59] arXiv:2510.13826 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 面向神经认知启发的智能：从人工智能的结构模仿到类人功能认知 显示英文标题

标题： Towards Neurocognitive-Inspired Intelligence: From AI's Structural Mimicry to Human-Like Functional Cognition

Noorbakhsh Amiri Golilarz, Hassan S. Al Khatib, Shahram Rahimi

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 人工智能 (cs.AI)

[60] arXiv:2510.13816 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： GQVis：用于生成式人工智能的基因组数据问题和可视化数据集 显示英文标题

标题： GQVis: A Dataset of Genomics Data Questions and Visualizations for Generative AI

Skylar Sargent Walters, Arthea Valderrama, Thomas C. Smits, David Kouřil, Huyen N. Nguyen, Sehi L'Yi, Devin Lange, Nils Gehlenborg

主题： 基因组学 (q-bio.GN) ; 人工智能 (cs.AI) ; 人机交互 (cs.HC) ; 机器学习 (cs.LG)

[61] arXiv:2510.13815 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 一种用于儿科癫痫严重程度的双特征定量脑电图指数：在CHB-MIT上的外部预验证及向Dravet队列的路线图 显示英文标题

标题： A Two-Feature Quantitative EEG Index of Pediatric Epilepsy Severity: External Pre-Validation on CHB-MIT and Roadmap to Dravet Cohorts

Khartik Uppalapati, Bora Yimenicioglu, Shakeel Abdulkareem, Bhavya Uppalapati, Viraj Kamath, Adan Eftekhari, Pranav Ayyappan

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[62] arXiv:2510.14787 (交叉列表自 eess.SY) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 一种用于分析和控制虫媒疾病传播的人-媒介易感-感染-易感模型 显示英文标题

标题： A Human-Vector Susceptible-Infected-Susceptible Model for Analyzing and Controlling the Spread of Vector-Borne Diseases

Lorenzo Zino, Alessandro Casu, Alessandro Rizzo

评论： 发表于2025年欧洲控制会议（ECC）论文集

期刊参考： 2025年欧洲控制会议论文集，第1219-1224页，2025

主题： 系统与控制 (eess.SY) ; 优化与控制 (math.OC) ; 种群与进化 (q-bio.PE)

[63] arXiv:2510.14455 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 编码器作为编辑器：代码驱动的可解释分子优化 显示英文标题

标题： Coder as Editor: Code-driven Interpretable Molecular Optimization

Wenyu Zhu, Chengzhu Li, Xiaohe Tian, Yifan Wang, Yinjun Jia, Jianhui Wang, Bowen Gao, Ya-Qin Zhang, Wei-Ying Ma, Yanyan Lan

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[64] arXiv:2510.14311 (交叉列表自 math.AP) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 传播速度的行波扩散Lotka-Volterra系统强竞争 显示英文标题

标题： Propagation speed of traveling waves for diffusive Lotka-Volterra system with strong competition

Ken-Ichi Nakamura, Toshiko Ogiwara

评论： 15页，2图

主题： 偏微分方程分析 (math.AP) ; 种群与进化 (q-bio.PE)

[65] arXiv:2510.14143 (交叉列表自 cs.CV) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 三次方：CUDA加速的三维生物图像计算 显示英文标题

标题： cubic: CUDA-accelerated 3D Bioimage Computing

Alexandr A. Kalinin, Anne E. Carpenter, Shantanu Singh, Matthew J. O'Meara

评论： 被ICCV 2025生物图像计算研讨会接收

主题： 计算机视觉与模式识别 (cs.CV) ; 定量方法 (q-bio.QM)

2025年10月16日， 星期四 (展示 首先 17 之 10 条目 )

[66] arXiv:2510.13688 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于雅可比矩阵的非线性神经编码模型解释 显示英文标题

标题： Jacobian-Based Interpretation of Nonlinear Neural Encoding Model

Xiaohui Gao, Haoran Yang, Yue Cheng, Mengfei Zuo, Yiheng Liu, Peiyang Li, Xintao Hu

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[67] arXiv:2510.13520 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： qLOOK：用于qPCR实验数字存储和可重复分析的最小信息系统 显示英文标题

标题： qLOOK: A Minimal Information System for Digital Storage and Reproducible Analysis of qPCR experiments

Mirco Castoldi

评论： 10页，3图

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[68] arXiv:2510.13270 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 系统发育树中的幂律与偏好凝聚过程 显示英文标题

标题： Power-laws in phylogenetic trees and the preferential coalescent

Stephan Kleinbölting, Nigel Goldenfeld, Johannes Berg

评论： 7页

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 其他统计 (stat.OT)

[69] arXiv:2510.13156 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 共振与放电神经元中从中心产生的尖峰振荡的分岔 显示英文标题

标题： Bifurcation of spiking oscillations from a center in resonate-and-fire neurons

Oleg Makarenkov, Marianne Bezaire, Michael Hasselmo

评论： 19页，14图

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 动力系统 (math.DS)

[70] arXiv:2510.13127 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于AlphaFold的环肽精确设计 显示英文标题

标题： Precision Design of Cyclic Peptides using AlphaFold

Cheuk Sau Au (Hong Kong University of Science and Technology)

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[71] arXiv:2510.13118 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： Omni-QALAS：用于同时T1、T2和髓鞘水成像的优化多参数成像 显示英文标题

标题： Omni-QALAS: Optimized Multiparametric Imaging for Simultaneous T1, T2 and Myelin Water Mapping

Shizhuo Li, Unay Dorken Gallastegi, Shohei Fujita, Yuting Chen, Pengcheng Xu, Yangsean Choi, Borjan Gagoski, Huihui Ye, Huafeng Liu, Berkin Bilgic, Yohan Jun

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[72] arXiv:2510.13017 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 使用瞬时相遇率来量化领地组织的空间模式 显示英文标题

标题： Using transient encounter rates to quantify spatial patterns of home-range organization

Anudeep Surendran, Justin M. Calabrese, William F. Fagan, Ricardo Martinez-Garcia

评论： 24页，正文中有5幅图

主题： 种群与进化 (q-bio.PE)

[73] arXiv:2510.12976 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 无似然推断系统发育树后验分布 显示英文标题

标题： Likelihood-free inference of phylogenetic tree posterior distributions

Luc Blassel, Bastien Boussau, Nicolas Lartillot, Laurent Jacob

评论： 13页，2图

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 定量方法 (q-bio.QM)

[74] arXiv:2510.12842 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： Protenix-Mini+：具有可扩展Pairformer的高效结构预测模型 显示英文标题

标题： Protenix-Mini+: efficient structure prediction model with scalable pairformer

Bo Qiang, Chengyue Gong, Xinshi Chen, Yuxuan Zhang, Wenzhi Xiao

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[75] arXiv:2510.12840 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： ST2HE：一种用于高分辨率空间转录组数据虚拟组织学和注释的跨平台框架 显示英文标题

标题： ST2HE: A Cross-Platform Framework for Virtual Histology and Annotation of High-Resolution Spatial Transcriptomics Data

Zhentao Liu, Arun Das, Wen Meng, Yu-Chiao Chiu, Shou-Jiang Gao, Yufei Huang

评论： 36页，5图，1表

主题： 定量方法 (q-bio.QM)