定量生物学

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2025年07月21日， 星期一 (继续， 展示 最后 11 之 8 条目 )

[74] arXiv:2507.13580 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 一种整合大型语言模型和化学片段空间的协作框架：对先导化合物设计的相互启发 显示英文标题

标题： A Collaborative Framework Integrating Large Language Model and Chemical Fragment Space: Mutual Inspiration for Lead Design

Hao Tuo, Yan Li, Xuanning Hu, Haishi Zhao, Xueyan Liu, Bo Yang

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 机器学习 (cs.LG)

[75] arXiv:2507.13531 [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 半代数假设检验方法论考虑因素与不完整U统计量 显示英文标题

标题： Methodological considerations for semialgebraic hypothesis testing with incomplete U-statistics

David Barnhill, Marina Garrote-López, Elizabeth Gross, Max Hill, Bryson Kagy, John A. Rhodes, Joy Z. Zhang

评论： 26页 + 11页 补充材料

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 方法论 (stat.ME)

[76] arXiv:2507.14056 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于去甲肾上腺素的增益调制减少联合训练中的稳定性差距 显示英文标题

标题： Noradrenergic-inspired gain modulation attenuates the stability gap in joint training

Alejandro Rodriguez-Garcia, Anindya Ghosh, Srikanth Ramaswamy

评论： 18页，5图，1表，1伪代码

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 人工智能 (cs.AI) ; 神经与认知 (q-bio.NC)

[77] arXiv:2507.13974 (交叉列表自 eess.IV) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 利用病理学基础模型进行H&E图像中黑色素瘤的全景分割 显示英文标题

标题： Leveraging Pathology Foundation Models for Panoptic Segmentation of Melanoma in H&E Images

Jiaqi Lv, Yijie Zhu, Carmen Guadalupe Colin Tenorio, Brinder Singh Chohan, Mark Eastwood, Shan E Ahmed Raza

评论： 被MIUA 2025接受

主题： 图像与视频处理 (eess.IV) ; 计算机视觉与模式识别 (cs.CV) ; 定量方法 (q-bio.QM)

[78] arXiv:2507.13950 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： MoDyGAN：将分子动力学与生成对抗网络结合以研究蛋白质构象空间 显示英文标题

标题： MoDyGAN: Combining Molecular Dynamics With GANs to Investigate Protein Conformational Space

Jingbo Liang, Bruna Jacobson

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 生物物理 (physics.bio-ph) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[79] arXiv:2507.13762 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： MolPIF：一种用于分子生成的参数插值流模型 显示英文标题

标题： MolPIF: A Parameter Interpolation Flow Model for Molecule Generation

Yaowei Jin, Junjie Wang, Wenkai Xiang, Duanhua Cao, Dan Teng, Zhehuan Fan, Jiacheng Xiong, Xia Sheng, Chuanlong Zeng, Duo An, Mingyue Zheng, Shuangjia Zheng, Qian Shi

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[80] arXiv:2507.13646 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于Transformer的蛋白质序列分析与设计语言模型综述 显示英文标题

标题： A Comprehensive Review of Transformer-based language models for Protein Sequence Analysis and Design

Nimisha Ghosh, Daniele Santoni, Debaleena Nawn, Eleonora Ottaviani, Giovanni Felici

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 人工智能 (cs.AI) ; 定量方法 (q-bio.QM)

[81] arXiv:2507.13501 (交叉列表自 cs.CL) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 在函数空间中对句法对象和合并操作进行编码 显示英文标题

标题： Encoding syntactic objects and Merge operations in function spaces

Matilde Marcolli, Robert C. Berwick

评论： 40页，LaTeX，4个png图表

主题： 计算与语言 (cs.CL) ; 环与代数 (math.RA) ; 神经与认知 (q-bio.NC)