定量生物学 > 生物大分子
[提交于 2018年9月4日
(v1)
,最后修订 2018年10月31日 (此版本, v3)]
标题: 并行的G- duplex和C- duplex DNA,具有AgI介导的碱基对的不间断骨架
标题: Parallel G-duplex and C-duplex DNA with Uninterrupted Spines of AgI-Mediated Base Pairs
摘要: 核碱基之间的氢键产生多样的DNA结构模体,包括标准双螺旋、鸟嘌呤(G)四链体和胞嘧啶(C)i-结构。 将金属介导的碱基对引入核酸结构中可以引入新的功能性和增强的稳定性。 在这里,我们使用质谱(MS)、离子迁移谱(IMS)和荧光共振能量转移(FRET)证明,当天然DNA序列与银阳离子在水溶液中混合时,会形成由最多20个G-Ag(I)-G连续碱基对组成的平行链结构。 FRET表明,由含有20个连续C-Ag(I)-C碱基对的聚胞嘧啶链形成的双螺旋也是平行的。 银介导的G-双螺旋优先于G-四链体形成,Ag+将G-四链体转化为银配对双螺旋的能力可能为操控这些生物相关的结构提供了一条新途径。 IMS表明,G-双螺旋比B-DNA更线性和更刚性。 使用密度泛函理论(DFT)计算提出了与IMS实验相容的结构。 这种低成本、无缺陷且可溶的基于DNA的纳米线为设计新型金属介导的DNA纳米技术开辟了新方向。
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