定量生物学 > 分子网络
[提交于 2025年1月25日
(v1)
,最后修订 2025年1月29日 (此版本, v2)]
标题: 通过基于量子行走的网络分析推进对长期新冠病理生理学的理解
标题: Advancing Understanding of Long COVID Pathophysiology Through Quantum Walk-Based Network Analysis
摘要: 长期新冠肺炎是一种多系统疾病,其特征是在感染新冠病毒后出现持续的症状,如疲劳、认知障碍和全身性炎症,但其机制仍不清楚。 在本研究中,我们应用了量子游走(QW),一种利用量子干涉的计算方法,来探索大规模的SARS-CoV-2诱导蛋白(SIP)网络。 与传统的带重启的随机游走(RWR)方法相比,QW在遍历网络深层区域方面表现出更强的能力,揭示了与长期新冠肺炎相关的蛋白质和通路。 关键发现包括线粒体功能障碍、血栓炎性反应和神经炎症作为核心机制。 QW独特地识别出CDGSH铁硫结构域含蛋白家族和VDAC1,这是一种线粒体钙转运蛋白,作为这些过程的关键调节因子。 VDAC1被确定为潜在的生物标志物和治疗靶点,得到了如大麻二醇等美国食品药品监督管理局批准的化合物的支持。 这些发现突显了QW作为一种强大的工具,用于阐明复杂的生物系统,并为类似长期新冠肺炎等状况发现新的治疗靶点。
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