计算机科学 > 机器学习
[提交于 2025年1月11日
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标题: 双模态表征学习用于分子性质预测
标题: Dual-Modality Representation Learning for Molecular Property Prediction
摘要: 分子属性预测近年来引起了广泛关注。 准确预测药物属性很大程度上依赖于有效的分子表示。 化学化合物的结构通常以图或SMILES序列的形式表示。 在学习药物属性方面的最新进展通常采用基于图表示的图神经网络(GNNs)。 对于SMILES表示,Transformer-based架构已被采用,将每个SMILES字符串视为标记序列。 由于每种表示方法都有其优缺点,结合两种表示方法在学习药物属性方面是一个有前景的方向。 我们提出了一种名为双模态交叉注意力(DMCA)的方法,该方法通过采用交叉注意力机制,可以有效结合两种表示的优势。 DMCA在八个数据集上进行了评估,包括分类和回归任务。 结果表明,我们的方法整体表现最佳,突显了其在利用图和SMILES模态互补信息方面的有效性。
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