Skip to main content
CenXiv.org
此网站处于试运行阶段,支持我们!
我们衷心感谢所有贡献者的支持。
贡献
赞助
cenxiv logo > q-bio > arXiv:0906.2232

帮助 | 高级搜索

定量生物学 > 亚细胞过程

arXiv:0906.2232 (q-bio)
[提交于 2009年6月12日 ]

标题: 质膜中Ras纳米簇形成和信号传导的生物物理机制

标题: Biophysical mechanism for Ras-nanocluster formation and signaling in plasma membrane

Authors:Thomas Gurry, Ozan Kahramanogullari, Robert G. Endres
摘要: Ras GTPases 是脂质锚定的 G 蛋白,在细胞信号传导过程中起着基础性作用。 免疫金标记 Ras 的电子显微照片显示,膜结合的 Ras 分子会分离成纳米簇域。 已经提出了几种模型,试图获得纳米簇形成的定量描述,但所有模型都依赖于一些假设,例如 Ras 在簇中的比例与 Ras 单体的比例是恒定的,且与表达水平无关(簇/单体比例)。 然而,这一假设与质量作用定律不一致。 在此,我们提出了一种基于膜中 Ras 分子之间短程吸引和长程排斥的 Ras 聚集的生物物理模型。 为了验证该模型,我们进行了蒙特卡洛模拟,并将统计聚集特性与实验数据进行了比较。 我们发现,可以在不假设恒定的簇/单体比例或脂质筏存在的前提下,恢复不同 Ras 表达水平下的实验观察到的聚集现象。 此外,我们的模型对 Ras 纳米簇的信号传递特性做出了预测,以支持 Ras 纳米簇作为高保真信号传递的模拟-数字-模拟转换器的观点。
摘要: Ras GTPases are lipid-anchored G proteins which play a fundamental role in cell signaling processes. Electron micrographs of immunogold-labeled Ras have shown that membrane-bound Ras molecules segregate into nanocluster domains. Several models have been developed in attempts to obtain quantitative descriptions of nanocluster formation, but all have relied on assumptions such as a constant, expression-level independent ratio of Ras in clusters to Ras monomers (cluster/monomer ratio). However, this assumption is inconsistent with the law of mass action. Here, we present a biophysical model of Ras clustering based on short-range attraction and long-range repulsion between Ras molecules in the membrane. To test this model, we performed Monte Carlo simulations and compared statistical clustering properties with experimental data. We find that we can recover the experimentally-observed clustering across a range of Ras expression levels, without assuming a constant cluster/monomer ratio or the existence of lipid rafts. In addition, our model makes predictions about the signaling properties of Ras nanoclusters in support of the idea that Ras nanoclusters act as an analog-digital-analog converter for high fidelity signaling.
评论: 8张图表。《公共科学图书馆期刊》,待发表
主题: 亚细胞过程 (q-bio.SC)
引用方式: arXiv:0906.2232 [q-bio.SC]
  (或者 arXiv:0906.2232v1 [q-bio.SC] 对于此版本)
  https://doi.org/10.48550/arXiv.0906.2232
通过 DataCite 发表的 arXiv DOI
相关 DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0006148
链接到相关资源的 DOI

提交历史

来自: Thomas Gurry [查看电子邮件]
[v1] 星期五, 2009 年 6 月 12 日 00:45:03 UTC (2,758 KB)
全文链接:

获取论文:

    查看标题为《》的 PDF
  • 查看中文 PDF
  • 查看 PDF
  • TeX 源代码
  • 其他格式
查看许可
当前浏览上下文:
q-bio.SC
< 上一篇   |   下一篇 >
新的 | 最近的 | 2009-06
切换浏览方式为:
q-bio

参考文献与引用

  • NASA ADS
  • 谷歌学术搜索
  • 语义学者
a 导出 BibTeX 引用 加载中...

BibTeX 格式的引用

×
数据由提供:

收藏

BibSonomy logo Reddit logo

文献和引用工具

文献资源探索 (什么是资源探索?)
连接的论文 (什么是连接的论文?)
Litmaps (什么是 Litmaps?)
scite 智能引用 (什么是智能引用?)

与本文相关的代码,数据和媒体

alphaXiv (什么是 alphaXiv?)
CatalyzeX 代码查找器 (什么是 CatalyzeX?)
DagsHub (什么是 DagsHub?)
Gotit.pub (什么是 GotitPub?)
Hugging Face (什么是 Huggingface?)
带有代码的论文 (什么是带有代码的论文?)
ScienceCast (什么是 ScienceCast?)

演示

复制 (什么是复制?)
Hugging Face Spaces (什么是 Spaces?)
TXYZ.AI (什么是 TXYZ.AI?)

推荐器和搜索工具

影响之花 (什么是影响之花?)
核心推荐器 (什么是核心?)
IArxiv 推荐器 (什么是 IArxiv?)
  • 作者
  • 地点
  • 机构
  • 主题

arXivLabs:与社区合作伙伴的实验项目

arXivLabs 是一个框架,允许合作伙伴直接在我们的网站上开发和分享新的 arXiv 特性。

与 arXivLabs 合作的个人和组织都接受了我们的价值观,即开放、社区、卓越和用户数据隐私。arXiv 承诺这些价值观,并且只与遵守这些价值观的合作伙伴合作。

有一个为 arXiv 社区增加价值的项目想法吗? 了解更多关于 arXivLabs 的信息.

这篇论文的哪些作者是支持者? | 禁用 MathJax (什么是 MathJax?)
  • 关于
  • 帮助
  • contact arXivClick here to contact arXiv 联系
  • 订阅 arXiv 邮件列表点击这里订阅 订阅
  • 版权
  • 隐私政策
  • 网络无障碍帮助
  • arXiv 运营状态
    通过...获取状态通知 email 或者 slack

京ICP备2025123034号