Skip to main content
CenXiv.org
此网站处于试运行阶段,支持我们!
我们衷心感谢所有贡献者的支持。
贡献
赞助
cenxiv logo > q-bio > arXiv:1106.0079

帮助 | 高级搜索

定量生物学 > 种群与进化

arXiv:1106.0079 (q-bio)
[提交于 2011年6月1日 ]

标题: 时间依赖性环境中的适应度包括几何贡献

标题: Fitness in time-dependent environments includes a geometric contribution

Authors:Sorin Tanase-Nicola, Ilya Nemenman
摘要: 表型进化意味着新基因组序列的顺序固定。 这些突变固定的速率在一定程度上取决于突变体与祖先的相对适应度(选择系数)。 使用一个简单的人口动力学模型,我们表明在动态环境中的相对适应度不等于在单个环境上平均的适应度。 相反,它包含一个明确依赖于环境序列的项。 这个项具有几何性质,并且仅取决于系统在环境状态空间中所采取轨迹所包围的有向面积。 它与经典和量子物理系统中广泛研究的几何相位有关。 我们讨论这些观察结果可能的生物学意义,重点在于新型代谢或抗压功能的进化。
摘要: Phenotypic evolution implies sequential fixations of new genomic sequences. The speed at which these mutations fixate depends, in part, on the relative fitness (selection coefficient) of the mutant vs. the ancestor. Using a simple population dynamics model we show that the relative fitness in dynamical environments is not equal to the fitness averaged over individual environments. Instead it includes a term that explicitly depends on the sequence of the environments. This term is geometric in nature and depends only on the oriented area enclosed by the trajectory taken by the system in the environment state space. It is related to the well-studied geometric phases in classical and quantum physical systems. We discuss possible biological implications of these observations, focusing on evolution of novel metabolic or stress-resistant functions.
主题: 种群与进化 (q-bio.PE)
引用方式: arXiv:1106.0079 [q-bio.PE]
  (或者 arXiv:1106.0079v1 [q-bio.PE] 对于此版本)
  https://doi.org/10.48550/arXiv.1106.0079
通过 DataCite 发表的 arXiv DOI
期刊参考: J. R. Soc. Interface 9(71), 1354-1362, 2012
相关 DOI: https://doi.org/10.1098/rsif.2011.0695
链接到相关资源的 DOI

提交历史

来自: Ilya M. Nemenman [查看电子邮件]
[v1] 星期三, 2011 年 6 月 1 日 02:30:55 UTC (304 KB)
全文链接:

获取论文:

    查看标题为《》的 PDF
  • 查看中文 PDF
  • 查看 PDF
  • TeX 源代码
  • 其他格式
查看许可
当前浏览上下文:
q-bio.PE
< 上一篇   |   下一篇 >
新的 | 最近的 | 2011-06
切换浏览方式为:
q-bio

参考文献与引用

  • NASA ADS
  • 谷歌学术搜索
  • 语义学者
a 导出 BibTeX 引用 加载中...

BibTeX 格式的引用

×
数据由提供:

收藏

BibSonomy logo Reddit logo

文献和引用工具

文献资源探索 (什么是资源探索?)
连接的论文 (什么是连接的论文?)
Litmaps (什么是 Litmaps?)
scite 智能引用 (什么是智能引用?)

与本文相关的代码,数据和媒体

alphaXiv (什么是 alphaXiv?)
CatalyzeX 代码查找器 (什么是 CatalyzeX?)
DagsHub (什么是 DagsHub?)
Gotit.pub (什么是 GotitPub?)
Hugging Face (什么是 Huggingface?)
带有代码的论文 (什么是带有代码的论文?)
ScienceCast (什么是 ScienceCast?)

演示

复制 (什么是复制?)
Hugging Face Spaces (什么是 Spaces?)
TXYZ.AI (什么是 TXYZ.AI?)

推荐器和搜索工具

影响之花 (什么是影响之花?)
核心推荐器 (什么是核心?)
IArxiv 推荐器 (什么是 IArxiv?)
  • 作者
  • 地点
  • 机构
  • 主题

arXivLabs:与社区合作伙伴的实验项目

arXivLabs 是一个框架,允许合作伙伴直接在我们的网站上开发和分享新的 arXiv 特性。

与 arXivLabs 合作的个人和组织都接受了我们的价值观,即开放、社区、卓越和用户数据隐私。arXiv 承诺这些价值观,并且只与遵守这些价值观的合作伙伴合作。

有一个为 arXiv 社区增加价值的项目想法吗? 了解更多关于 arXivLabs 的信息.

这篇论文的哪些作者是支持者? | 禁用 MathJax (什么是 MathJax?)
  • 关于
  • 帮助
  • contact arXivClick here to contact arXiv 联系
  • 订阅 arXiv 邮件列表点击这里订阅 订阅
  • 版权
  • 隐私政策
  • 网络无障碍帮助
  • arXiv 运营状态
    通过...获取状态通知 email 或者 slack

京ICP备2025123034号