定量生物学 > 定量方法
[提交于 2016年8月9日
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标题: 随机异聚物的循环概率有助于理解生物聚合物的标度特性
标题: The looping probability of random heteropolymers helps to understand the scaling properties of biopolymers
摘要: 随机异聚物是对生物聚合物的最小描述,并可以为研究生物物理实验中环的形成提供一个理论框架。 一种两态模型提供了一种一致且稳健的方法来研究典型生物系统尺寸的聚合物中环形成的标度性质。 将其与自适应调整的模拟退火模拟相结合,我们可以数值计算链内随机相互作用的几个实现的环形成性质。 与均聚物不同,随机异聚物在不同温度下表现出连续的标度指数集。 使用自平均量的必要性使得有限尺寸效应在低温下即使对于长聚合物也占主导地位,掩盖了环形成概率的长度无关特性,这与均聚物球状结构的预期类似。 这可能为实验中发现的小标度指数提供一个简单的解释,例如在染色体折叠中。
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