定量生物学 > 种群与进化
[提交于 2018年3月4日
]
标题: 利用RAPD标记对四种茄子物种(Solanum melongena L)的遗传多样性和基因组关系进行分析
标题: Analysis of genetic diversity and genome relationships of four eggplant species (Solanum melongena L) using RAPD markers
摘要: 茄子(Solanum melongena)是茄属中的一种多样性植物,在印度尼西亚广泛种植和分布,并被社区广泛使用。 本研究利用RAPD(随机扩增多态性DNA)探讨了四种当地印尼茄子品种的遗传多样性,即leuca、tekokak、gelatik和kopek。 样品来自印度尼西亚 Bogor 的农业技术评估研究所(BPTP)。 数据观察结果以茄子植物的DNA图谱形式呈现,并进行了描述性和定量分析。 使用四个引物(OPF01、OPF02、OPF03 和 OPF04)成功评分了30个DNA条带(28个多态性和2个单态性)。 这些引物能够扩增所有四种茄子样品。 PCR-RAPD可视化结果产生了300-1500 bp的条带。 聚类分析结果显示存在三个聚类(A、B 和 C)。 聚类 A(系数为 49%)由 gelatik 组成,聚类 B(系数为 65%)由 TPU(Kopek)和 TK(Tekokak)组成,聚类 C(系数为 55%)由 LC(Leunca)组成。 这些结果表明,在 TK(Tekokak)和 TPU(Kopek)样品中发现了最接近的亲缘关系。
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