Skip to main content
CenXiv.org
此网站处于试运行阶段,支持我们!
我们衷心感谢所有贡献者的支持。
贡献
赞助
cenxiv logo > physics > arXiv:2503.22364

帮助 | 高级搜索

物理学 > 生物物理

arXiv:2503.22364 (physics)
[提交于 2025年3月28日 ]

标题: 可溶性蛋白在软着陆ESIBD后的高分辨率冷冻电镜结构确定

标题: High-resolution cryoEM structure determination of soluble proteins after soft-landing ESIBD

Authors:Lukas Eriksson, Tim K. Esser, Marko Grabarics, Laurence T. Seeley, Simon B. Knoblauch, Paul Fremdling, Thomas Reynolds, Jani R. Bolla, Lindsay Baker, Stephan Rauschenbach
摘要: 软着陆电喷雾离子束沉积(ESIBD),即在真空下对大型和复杂分子进行化学选择性、完整沉积的方法,是一种用于扫描探针显微镜(SPM)的成熟样品制备方法,它有助于对大型和复杂分子进行高分辨率成像。 继承自质谱分析,ESIBD的优势特性,如化学纯度和选择性,以及在真空环境下对样品环境的精确控制,与其他分析方法结合时也具有吸引力。 因此,最近ESIBD被用于通过天然电喷雾电离(天然ESIBD)将蛋白质引入气相来制备电子冷冻显微镜(cryoEM)的样品。 然而,这种方法的普遍适用性和基于ESIBD的cryoEM工作流程的最佳条件仍不清楚。 在此,我们介绍了专为ESIBD+cryoEM工作流程设计的仪器和方法,该方法基于对沉积条件和样品环境的精确控制。 我们确定了蛋白质温和沉积的最优条件,均质超薄非晶冰的生长条件以及避免污染的条件,从而实现了多种蛋白质系统的原子级分辨率cryoEM成像。 我们的结果证实了蛋白质的天然二级结构和总体形状的保留。 ESIBD+cryoEM直接将天然MS的化学洞察与cryoEM的结构精度联系起来,为结构生物学应用提供了一个多功能平台。
摘要: Soft-landing electrospray ion beam deposition (ESIBD), i.e. the chemically selective, intact deposition of large and complex molecules on surfaces in vacuum, is a well-established sample preparation method for scanning probe microscopy (SPM), where it facilitates the high-resolution imaging of large and complex molecules. Inherited from mass spectrometry, the advantageous properties of ESIBD, chemical purity and selectivity, as well as precise control over the sample environment in vacuum, are also desirable in combination with other analytical methods. Therefore, recently ESIBD has been pursued for the fabrication of samples for electron cryo-microscopy (cryoEM) with proteins introduced into the gas phase via native electrospray ionisation (native ESIBD). However, the general applicability of this approach and the optimal conditions for an ESIBD-based cryoEM workflow remain unclear. Here, we present instrumentation and methods for a dedicated ESIBD+cryoEM workflow, based on precise control over deposition conditions and sample environment. We establish optimal conditions for gentle deposition of the proteins, for growing homogeneous, ultra-thin, amorphous ice, and for avoiding contamination, which allows for atomic-resolution cryoEM imaging of multiple protein systems. Our results confirm the retention of the protein's native secondary structure and general shape. ESIBD+cryoEM directly links native MS chemical insights with cryoEM's structural precision, offering a versatile platform for structural biology applications.
主题: 生物物理 (physics.bio-ph) ; 化学物理 (physics.chem-ph); 仪器与探测器 (physics.ins-det)
引用方式: arXiv:2503.22364 [physics.bio-ph]
  (或者 arXiv:2503.22364v1 [physics.bio-ph] 对于此版本)
  https://doi.org/10.48550/arXiv.2503.22364
通过 DataCite 发表的 arXiv DOI

提交历史

来自: Lukas Eriksson [查看电子邮件]
[v1] 星期五, 2025 年 3 月 28 日 12:14:43 UTC (21,613 KB)
全文链接:

获取论文:

    查看标题为《》的 PDF
  • 查看中文 PDF
  • 查看 PDF
  • HTML(实验性)
  • TeX 源代码
  • 其他格式
许可图标 查看许可
当前浏览上下文:
physics.bio-ph
< 上一篇   |   下一篇 >
新的 | 最近的 | 2025-03
切换浏览方式为:
physics
physics.chem-ph
physics.ins-det

参考文献与引用

  • NASA ADS
  • 谷歌学术搜索
  • 语义学者
a 导出 BibTeX 引用 加载中...

BibTeX 格式的引用

×
数据由提供:

收藏

BibSonomy logo Reddit logo

文献和引用工具

文献资源探索 (什么是资源探索?)
连接的论文 (什么是连接的论文?)
Litmaps (什么是 Litmaps?)
scite 智能引用 (什么是智能引用?)

与本文相关的代码,数据和媒体

alphaXiv (什么是 alphaXiv?)
CatalyzeX 代码查找器 (什么是 CatalyzeX?)
DagsHub (什么是 DagsHub?)
Gotit.pub (什么是 GotitPub?)
Hugging Face (什么是 Huggingface?)
带有代码的论文 (什么是带有代码的论文?)
ScienceCast (什么是 ScienceCast?)

演示

复制 (什么是复制?)
Hugging Face Spaces (什么是 Spaces?)
TXYZ.AI (什么是 TXYZ.AI?)

推荐器和搜索工具

影响之花 (什么是影响之花?)
核心推荐器 (什么是核心?)
IArxiv 推荐器 (什么是 IArxiv?)
  • 作者
  • 地点
  • 机构
  • 主题

arXivLabs:与社区合作伙伴的实验项目

arXivLabs 是一个框架,允许合作伙伴直接在我们的网站上开发和分享新的 arXiv 特性。

与 arXivLabs 合作的个人和组织都接受了我们的价值观,即开放、社区、卓越和用户数据隐私。arXiv 承诺这些价值观,并且只与遵守这些价值观的合作伙伴合作。

有一个为 arXiv 社区增加价值的项目想法吗? 了解更多关于 arXivLabs 的信息.

这篇论文的哪些作者是支持者? | 禁用 MathJax (什么是 MathJax?)
  • 关于
  • 帮助
  • contact arXivClick here to contact arXiv 联系
  • 订阅 arXiv 邮件列表点击这里订阅 订阅
  • 版权
  • 隐私政策
  • 网络无障碍帮助
  • arXiv 运营状态
    通过...获取状态通知 email 或者 slack

京ICP备2025123034号