定量生物学 > 基因组学
[提交于 2025年7月10日
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标题: HybridQC:用于单细胞RNA测序数据的机器学习增强质量控制
标题: HybridQC: Machine Learning-Augmented Quality Control for Single-Cell RNA-seq Data
摘要: HybridQC 是一个 R 包,通过结合传统的基于阈值的过滤和基于机器学习的异常值检测,简化了单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)数据的质量控制(QC)。它提供了一个高效且自适应的框架,使用诸如孤立森林等技术,在噪声或浅深度数据集中识别低质量细胞,同时与广泛采用的格式如 Seurat 对象兼容。该包轻量级,易于安装,适用于研究环境中的小到中型 scRNA-seq 数据集。HybridQC 特别适用于涉及非模式生物、稀有样本或试点研究的项目,其中自动化和灵活的 QC 对于可重复性和下游分析至关重要。
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