Skip to main content
CenXiv.org
此网站处于试运行阶段,支持我们!
我们衷心感谢所有贡献者的支持。
贡献
赞助
cenxiv logo > q-bio > arXiv:2507.08144

帮助 | 高级搜索

定量生物学 > 其他定量生物学

arXiv:2507.08144 (q-bio)
[提交于 2025年7月10日 ]

标题: 人工智能在药动学研究与教育中的非线性混合效应模型编程:捷径还是陷阱?

标题: AI for NONMEM Coding in Pharmacometrics Research and Education: Shortcut or Pitfall?

Authors:Wenhao Zheng, Wanbing Wang, Carl M.J. Kirkpatrick, Cornelia B. Landersdorfer, Huaxiu Yao, Jiawei Zhou
摘要: 人工智能(AI)正日益被探索作为支持药动学建模的工具,特别是在解决与NONMEM相关的编码挑战方面。 在本研究中,我们评估了七种AI代理在13个药动学任务中的生成NONMEM代码的能力,包括一系列群体药动学(PK)和药效学(PD)模型。 我们进一步开发了一个标准化评分标准来评估代码准确性,并创建了一个优化的提示来提高AI代理的性能。 我们的结果表明,OpenAI o1和gpt-4.1模型表现最佳,当使用我们优化的提示时,它们能够为所有任务生成具有高度准确性的代码。 总体而言,AI代理在编写基本的NONMEM模型结构方面表现良好,为药动学模型编码提供了有用的基础。 然而,用户审查和改进仍然是必不可少的,特别是对于具有特殊数据集对齐或高级编码技术的复杂模型。 我们还讨论了AI在药动学教育中的应用,特别是防止过度依赖AI进行编码的策略。 这项工作为当前AI代理在NONMEM编码中的表现提供了一个基准,并介绍了一个实用的提示,可以促进在药动学研究和教育中更准确和高效地使用AI。
摘要: Artificial intelligence (AI) is increasingly being explored as a tool to support pharmacometric modeling, particularly in addressing the coding challenges associated with NONMEM. In this study, we evaluated the ability of seven AI agents to generate NONMEM codes across 13 pharmacometrics tasks, including a range of population pharmacokinetic (PK) and pharmacodynamic (PD) models. We further developed a standardized scoring rubric to assess code accuracy and created an optimized prompt to improve AI agent performance. Our results showed that the OpenAI o1 and gpt-4.1 models achieved the best performance, both generating codes with great accuracy for all tasks when using our optimized prompt. Overall, AI agents performed well in writing basic NONMEM model structures, providing a useful foundation for pharmacometrics model coding. However, user review and refinement remain essential, especially for complex models with special dataset alignment or advanced coding techniques. We also discussed the applications of AI in pharmacometrics education, particularly strategies to prevent over-reliance on AI for coding. This work provides a benchmark for current AI agents performance in NONMEM coding and introduces a practical prompt that can facilitate more accurate and efficient use of AI in pharmacometrics research and education.
主题: 其他定量生物学 (q-bio.OT)
引用方式: arXiv:2507.08144 [q-bio.OT]
  (或者 arXiv:2507.08144v1 [q-bio.OT] 对于此版本)
  https://doi.org/10.48550/arXiv.2507.08144
通过 DataCite 发表的 arXiv DOI

提交历史

来自: Jiawei Zhou [查看电子邮件]
[v1] 星期四, 2025 年 7 月 10 日 20:05:35 UTC (465 KB)
全文链接:

获取论文:

    查看标题为《》的 PDF
  • 查看中文 PDF
  • 查看 PDF
  • 其他格式
许可图标 查看许可
当前浏览上下文:
q-bio.OT
< 上一篇   |   下一篇 >
新的 | 最近的 | 2025-07
切换浏览方式为:
q-bio

参考文献与引用

  • NASA ADS
  • 谷歌学术搜索
  • 语义学者
a 导出 BibTeX 引用 加载中...

BibTeX 格式的引用

×
数据由提供:

收藏

BibSonomy logo Reddit logo

文献和引用工具

文献资源探索 (什么是资源探索?)
连接的论文 (什么是连接的论文?)
Litmaps (什么是 Litmaps?)
scite 智能引用 (什么是智能引用?)

与本文相关的代码,数据和媒体

alphaXiv (什么是 alphaXiv?)
CatalyzeX 代码查找器 (什么是 CatalyzeX?)
DagsHub (什么是 DagsHub?)
Gotit.pub (什么是 GotitPub?)
Hugging Face (什么是 Huggingface?)
带有代码的论文 (什么是带有代码的论文?)
ScienceCast (什么是 ScienceCast?)

演示

复制 (什么是复制?)
Hugging Face Spaces (什么是 Spaces?)
TXYZ.AI (什么是 TXYZ.AI?)

推荐器和搜索工具

影响之花 (什么是影响之花?)
核心推荐器 (什么是核心?)
IArxiv 推荐器 (什么是 IArxiv?)
  • 作者
  • 地点
  • 机构
  • 主题

arXivLabs:与社区合作伙伴的实验项目

arXivLabs 是一个框架,允许合作伙伴直接在我们的网站上开发和分享新的 arXiv 特性。

与 arXivLabs 合作的个人和组织都接受了我们的价值观,即开放、社区、卓越和用户数据隐私。arXiv 承诺这些价值观,并且只与遵守这些价值观的合作伙伴合作。

有一个为 arXiv 社区增加价值的项目想法吗? 了解更多关于 arXivLabs 的信息.

这篇论文的哪些作者是支持者? | 禁用 MathJax (什么是 MathJax?)
  • 关于
  • 帮助
  • contact arXivClick here to contact arXiv 联系
  • 订阅 arXiv 邮件列表点击这里订阅 订阅
  • 版权
  • 隐私政策
  • 网络无障碍帮助
  • arXiv 运营状态
    通过...获取状态通知 email 或者 slack

京ICP备2025123034号