Skip to main content
CenXiv.org
此网站处于试运行阶段,支持我们!
我们衷心感谢所有贡献者的支持。
贡献
赞助
cenxiv logo > q-bio > arXiv:2510.02416

帮助 | 高级搜索

定量生物学 > 基因组学

arXiv:2510.02416 (q-bio)
[提交于 2025年10月2日 ]

标题: 跨平台的Group 3 & 4髓母细胞瘤八种分子亚型的DNA甲基化分类器

标题: Cross-Platform DNA Methylation Classifier for the Eight Molecular Subtypes of Group 3 & 4 Medulloblastoma

Authors:Omer Abid, Gholamreza Rafiee
摘要: 髓母细胞瘤是一种恶性儿童脑癌,分子亚组的发现正在推动个性化治疗策略的发展。 2019年,一项共识在组3和组4中确定了八个新的亚型,每个亚型都表现出异质性特征。 分类器对于将这些发现转化为临床实践至关重要,它们支持临床试验、个性化治疗的开发和应用以及患者监测。 本研究提出了一种基于DNA甲基化的跨平台机器学习分类器,能够在HM450和EPIC甲基化芯片样本上区分这些亚型。 在两个独立测试集中,该模型实现了加权F1 = 0.95和平衡准确率= 0.957,并且在不同平台上保持一致。 作为首个跨平台解决方案,它提供了向后兼容性,同时扩展到新平台的应用范围,也提高了可及性。 一旦通过网络应用程序部署,它有望成为这些亚型的第一个公开可用的分类器,这将在未来计划实现。 总体而言,这项工作在推进精准医学和改善大多数流行亚组髓母细胞瘤患者临床结果的方向上迈出了重要一步,即组3和组4。
摘要: Medulloblastoma is a malignant pediatric brain cancer, and the discovery of molecular subgroups is enabling personalized treatment strategies. In 2019, a consensus identified eight novel subtypes within Groups 3 and 4, each displaying heterogeneous characteristics. Classifiers are essential for translating these findings into clinical practice by supporting clinical trials, personalized therapy development and application, and patient monitoring. This study presents a DNA methylation-based, cross-platform machine learning classifier capable of distinguishing these subtypes on both HM450 and EPIC methylation array samples. Across two independent test sets, the model achieved weighted F1 = 0.95 and balanced accuracy = 0.957, consistent across platforms. As the first cross-platform solution, it provides backward compatibility while extending applicability to a newer platform, also enhancing accessibility. It also has the potential to become the first publicly available classifier for these subtypes once deployed through a web application, as planned in the future. This work overall takes steps in the direction of advancing precision medicine and improving clinical outcomes for patients within the majority prevalence medulloblastoma subgroups, groups 3 and 4.
评论: 9页,5图,5表
主题: 基因组学 (q-bio.GN) ; 人工智能 (cs.AI)
引用方式: arXiv:2510.02416 [q-bio.GN]
  (或者 arXiv:2510.02416v1 [q-bio.GN] 对于此版本)
  https://doi.org/10.48550/arXiv.2510.02416
通过 DataCite 发表的 arXiv DOI

提交历史

来自: Gholamreza Rafiee [查看电子邮件]
[v1] 星期四, 2025 年 10 月 2 日 14:53:38 UTC (690 KB)
全文链接:

获取论文:

    查看标题为《》的 PDF
  • 查看中文 PDF
  • 查看 PDF
许可图标 查看许可
当前浏览上下文:
q-bio.GN
< 上一篇   |   下一篇 >
新的 | 最近的 | 2025-10
切换浏览方式为:
cs
cs.AI
q-bio

参考文献与引用

  • NASA ADS
  • 谷歌学术搜索
  • 语义学者
a 导出 BibTeX 引用 加载中...

BibTeX 格式的引用

×
数据由提供:

收藏

BibSonomy logo Reddit logo

文献和引用工具

文献资源探索 (什么是资源探索?)
连接的论文 (什么是连接的论文?)
Litmaps (什么是 Litmaps?)
scite 智能引用 (什么是智能引用?)

与本文相关的代码,数据和媒体

alphaXiv (什么是 alphaXiv?)
CatalyzeX 代码查找器 (什么是 CatalyzeX?)
DagsHub (什么是 DagsHub?)
Gotit.pub (什么是 GotitPub?)
Hugging Face (什么是 Huggingface?)
带有代码的论文 (什么是带有代码的论文?)
ScienceCast (什么是 ScienceCast?)

演示

复制 (什么是复制?)
Hugging Face Spaces (什么是 Spaces?)
TXYZ.AI (什么是 TXYZ.AI?)

推荐器和搜索工具

影响之花 (什么是影响之花?)
核心推荐器 (什么是核心?)
IArxiv 推荐器 (什么是 IArxiv?)
  • 作者
  • 地点
  • 机构
  • 主题

arXivLabs:与社区合作伙伴的实验项目

arXivLabs 是一个框架,允许合作伙伴直接在我们的网站上开发和分享新的 arXiv 特性。

与 arXivLabs 合作的个人和组织都接受了我们的价值观,即开放、社区、卓越和用户数据隐私。arXiv 承诺这些价值观,并且只与遵守这些价值观的合作伙伴合作。

有一个为 arXiv 社区增加价值的项目想法吗? 了解更多关于 arXivLabs 的信息.

这篇论文的哪些作者是支持者? | 禁用 MathJax (什么是 MathJax?)
  • 关于
  • 帮助
  • contact arXivClick here to contact arXiv 联系
  • 订阅 arXiv 邮件列表点击这里订阅 订阅
  • 版权
  • 隐私政策
  • 网络无障碍帮助
  • arXiv 运营状态
    通过...获取状态通知 email 或者 slack

京ICP备2025123034号