生物大分子

2025年03月 的作者和标题

[1] arXiv:2503.00165 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 利用序列纯化进行AlphaFold2的多个构象状态的准确预测 显示英文标题

标题： Leveraging Sequence Purification for Accurate Prediction of Multiple Conformational States with AlphaFold2

Enming Xing, Junjie Zhang, Shen Wang, Xiaolin Cheng

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[2] arXiv:2503.00913 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 将计算蛋白质设计应用于治疗性抗体发现——现状与展望 显示英文标题

标题： Applying computational protein design to therapeutic antibody discovery -- current state and perspectives

Weronika Bielska, Igor Jaszczyszyn, Pawel Dudzic, Bartosz Janusz, Dawid Chomicz, Sonia Wrobel, Victor Greiff, Ryan Feehan, Jared Adolf-Bryfogle, Konrad Krawczyk

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[3] arXiv:2503.01376 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 通过与大型语言模型合作，推动基于结构的药物设计的边界 显示英文标题

标题： Pushing the boundaries of Structure-Based Drug Design through Collaboration with Large Language Models

Bowen Gao, Yanwen Huang, Yiqiao Liu, Wenxuan Xie, Wei-Ying Ma, Ya-Qin Zhang, Yanyan Lan

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[4] arXiv:2503.02058 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： RiboGen：具有等变多流的RNA序列和结构联合生成 显示英文标题

标题： RiboGen: RNA Sequence and Structure Co-Generation with Equivariant MultiFlow

Dana Rubin, Allan dos Santos Costa, Manvitha Ponnapati, Joseph Jacobson

评论： 6页

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 机器学习 (cs.LG)

[5] arXiv:2503.03503 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 协作专家大语言模型引导的多目标分子优化 显示英文标题

标题： Collaborative Expert LLMs Guided Multi-Objective Molecular Optimization

Jiajun Yu, Yizhen Zheng, Huan Yee Koh, Shirui Pan, Tianyue Wang, Haishuai Wang

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[6] arXiv:2503.03989 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 通过全原子随机流将蛋白质动力学整合到基于结构的药物设计中 显示英文标题

标题： Integrating Protein Dynamics into Structure-Based Drug Design via Full-Atom Stochastic Flows

Xiangxin Zhou, Yi Xiao, Haowei Lin, Xinheng He, Jiaqi Guan, Yang Wang, Qiang Liu, Feng Zhou, Liang Wang, Jianzhu Ma

评论： 被ICLR 2025接收

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 机器学习 (cs.LG)

[7] arXiv:2503.04200 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： DeepSilencer：一种预测siRNA敲低效率的新深度学习模型 显示英文标题

标题： DeepSilencer: A Novel Deep Learning Model for Predicting siRNA Knockdown Efficiency

Wangdan Liao, Weidong Wang

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[8] arXiv:2503.05025 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： ProtComposer：具有三维椭球体的组合蛋白质结构生成 显示英文标题

标题： ProtComposer: Compositional Protein Structure Generation with 3D Ellipsoids

Hannes Stark, Bowen Jing, Tomas Geffner, Jason Yim, Tommi Jaakkola, Arash Vahdat, Karsten Kreis

评论： 作为会议论文发表，并在ICLR 2025上做口头报告（前1.8%）

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[9] arXiv:2503.05738 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于主链几何结构的蛋白质构象系综学习 显示英文标题

标题： Learning conformational ensembles of proteins based on backbone geometry

Nicolas Wolf, Leif Seute, Vsevolod Viliuga, Simon Wagner, Jan Stühmer, Frauke Gräter

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 统计力学 (cond-mat.stat-mech) ; 机器学习 (cs.LG) ; 计算物理 (physics.comp-ph)

[10] arXiv:2503.06123 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 电针治疗高位脊髓损伤后逼尿肌膀胱颈失协调的机制蛋白质组学 显示英文标题

标题： Mechanism of Electricacupuncture Treating Detrusor Bladder Neck Dyscoordination After Suprasacral Spinal Cord Injury by Proteomics

Liya Tang, Qirui Qu, Yiying Long, Xia Wu, Jincan Liu, Ming Xu, Hong Zhang, Lu Zhou, Qiong Liu, Kun Ai

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[11] arXiv:2503.08115 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 标准的线圈或球状相无法描述结构化蛋白质和固有无序蛋白质的变性状态 显示英文标题

标题： The standard coil or globule phases cannot describe the denatured state of structured proteins and intrinsically disordered proteins

F. Righini, G. Potel, R. Capelli, G. Tiana

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[12] arXiv:2503.08179 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： ProtTeX：使用大型语言模型进行蛋白质的结构上下文推理与编辑 显示英文标题

标题： ProtTeX: Structure-In-Context Reasoning and Editing of Proteins with Large Language Models

Zicheng Ma, Chuanliu Fan, Zhicong Wang, Zhenyu Chen, Xiaohan Lin, Yanheng Li, Shihao Feng, Jun Zhang, Ziqiang Cao, Yi Qin Gao

评论： 26页，9图

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 人工智能 (cs.AI)

[13] arXiv:2503.08764 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于稀疏自编码器的可解释蛋白质结构预测 显示英文标题

标题： Towards Interpretable Protein Structure Prediction with Sparse Autoencoders

Nithin Parsan, David J. Yang, John J. Yang

评论： 发表于 GEMBio ICLR 2025 工作坊

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[14] arXiv:2503.09085 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 可微折叠用于最近邻模型优化 显示英文标题

标题： Differentiable Folding for Nearest Neighbor Model Optimization

Ryan K. Krueger, Sharon Aviran, David H. Mathews, Jeffrey Zuber, Max Ward

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 定量方法 (q-bio.QM)

[15] arXiv:2503.09979 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 硅是植物合成生物学的下一个前沿领域 显示英文标题

标题： Silicon is the next frontier in plant synthetic biology

Aniruddha Acharya, Kaitlin Hopkins, Tatum Simms

评论： 20页，5图，1表

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[16] arXiv:2503.10489 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 超越原子：通过三维空间建模增强分子预训练表示 显示英文标题

标题： Beyond Atoms: Enhancing Molecular Pretrained Representations with 3D Space Modeling

Shuqi Lu, Xiaohong Ji, Bohang Zhang, Lin Yao, Siyuan Liu, Zhifeng Gao, Linfeng Zhang, Guolin Ke

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 机器学习 (cs.LG)

[17] arXiv:2503.13522 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 用于蛋白质结构预测与设计的深度学习方法 显示英文标题

标题： Advanced Deep Learning Methods for Protein Structure Prediction and Design

Yichao Zhang, Ningyuan Deng, Xinyuan Song, Ziqian Bi, Tianyang Wang, Zheyu Yao, Keyu Chen, Ming Li, Qian Niu, Junyu Liu, Benji Peng, Sen Zhang, Ming Liu, Li Zhang, Xuanhe Pan, Jinlang Wang, Pohsun Feng, Yizhu Wen, Lawrence KQ Yan, Hongming Tseng, Yan Zhong, Yunze Wang, Ziyuan Qin, Bowen Jing, Junjie Yang, Jun Zhou, Chia Xin Liang, Junhao Song

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[18] arXiv:2503.13789 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 以通用神经网络势模拟碳酸酐酶 II 显示英文标题

标题： Carbonic anhydrase II simulated with a universal neural network potential

Timothy T. Duignan

评论： 18页，8图

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 中尺度与纳米尺度物理 (cond-mat.mes-hall) ; 软凝聚态物理 (cond-mat.soft) ; 统计力学 (cond-mat.stat-mech) ; 生物物理 (physics.bio-ph)

[19] arXiv:2503.16996 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 一种能量自适应弹性等变Transformer框架用于蛋白质结构表示 显示英文标题

标题： An Energy-Adaptive Elastic Equivariant Transformer Framework for Protein Structure Representation

Zhongyue Zhang, Runze Ma, Yanjie Huang, Shuangjia Zheng

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[20] arXiv:2503.17007 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： RiboFlow：通过协同流匹配的条件从头开始RNA共同设计 显示英文标题

标题： RiboFlow: Conditional De Novo RNA Co-Design via Synergistic Flow Matching

Runze Ma, Zhongyue Zhang, Zichen Wang, Chenqing Hua, Jiahua Rao, Zhuomin Zhou, Shuangjia Zheng

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[21] arXiv:2503.17368 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 非规范交联干扰进化蛋白质结构模型 显示英文标题

标题： Non-Canonical Crosslinks Confound Evolutionary Protein Structure Models

Romain Lacombe

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 人工智能 (cs.AI)

[22] arXiv:2503.19273 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： mRNA 折叠算法用于结构和密码子优化 显示英文标题

标题： mRNA Folding Algorithms for Structure and Codon Optimization

Max Ward, Mary Richardson, Mihir Metkar

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 定量方法 (q-bio.QM)

[23] arXiv:2503.19821 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： IgCraft：一种用于抗体发现和工程的通用序列生成框架 显示英文标题

标题： IgCraft: A versatile sequence generation framework for antibody discovery and engineering

Matthew Greenig, Haowen Zhao, Vladimir Radenkovic, Aubin Ramon, Pietro Sormanni

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 定量方法 (q-bio.QM)

[24] arXiv:2503.20513 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于主子流形的聚类和多尺度RNA校正方法 显示英文标题

标题： A Principal Submanifold-based Approach for Clustering and Multiscale RNA Correction

Menghao Wu, Zhigang Yao

评论： 28页，15图

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 定量方法 (q-bio.QM) ; 应用 (stat.AP)

[25] arXiv:2503.20977 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 几何组合学能否改进RNA分支预测？ 显示英文标题

标题： Can geometric combinatorics improve RNA branching predictions?

Svetlana Poznanović, Owen Cardwell, Christine Heitsch

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[26] arXiv:2503.21017 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 一价两份：将大型语言模型整合以学习生物物理相互作用 显示英文标题

标题： Two for the Price of One: Integrating Large Language Models to Learn Biophysical Interactions

Joseph D. Clark, Tanner J. Dean, Diwakar Shukla

评论： 27页，5图

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 定量方法 (q-bio.QM)

[27] arXiv:2503.21233 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： Ermiaosan通过EP4-cAMP-CREB信号通路调节树突状细胞功能 显示英文标题

标题： Regulation of Dendritic Cell Function by Ermiaosan via the EP4-cAMP-CREB Signaling Pathway

Jie-Min Ding, Liu Min, Wang Jin, Si-Meng Cheng, Xiang-Wen Meng, Xiao-Yi Jia, Wang Ning

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 分子网络 (q-bio.MN)

[28] arXiv:2503.21681 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： RNA 3D 结构-功能建模的综合基准 显示英文标题

标题： A Comprehensive Benchmark for RNA 3D Structure-Function Modeling

Luis Wyss, Vincent Mallet, Wissam Karroucha, Karsten Borgwardt, Carlos Oliver

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 机器学习 (stat.ML)

[29] arXiv:2503.21788 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： PharMolixFM：分子建模和生成的全原子基础模型 显示英文标题

标题： PharMolixFM: All-Atom Foundation Models for Molecular Modeling and Generation

Yizhen Luo, Jiashuo Wang, Siqi Fan, Zaiqing Nie

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 机器学习 (cs.LG)

[30] arXiv:2503.22164 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： PharmAgents：构建一个虚拟制药公司的大语言模型代理 显示英文标题

标题： PharmAgents: Building a Virtual Pharma with Large Language Model Agents

Bowen Gao, Yanwen Huang, Yiqiao Liu, Wenxuan Xie, Wei-Ying Ma, Ya-Qin Zhang, Yanyan Lan

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 人工智能 (cs.AI)

[31] arXiv:2503.23341 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： GPx4通过疏水锚定结合到过氧化膜上 显示英文标题

标题： GPx4 is bound to peroxidized membranes by a hydrophobic anchor

Qingyang Hu, Hantian You, Kenan Li, Luhua Lai, Chen Song

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[32] arXiv:2503.23550 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 用分子指纹解决药物-药物相互作用预测中的模型过复杂性问题 显示英文标题

标题： Addressing Model Overcomplexity in Drug-Drug Interaction Prediction With Molecular Fingerprints

Manel Gil-Sorribes, Alexis Molina

评论： 被ICLR 2025的GEM研讨会接收

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[33] arXiv:2503.00638 (交叉列表自 cs.CR) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： POSERS：使用随机DNA序列的隐写术驱动分子标记 显示英文标题

标题： POSERS: Steganography-Driven Molecular Tagging Using Randomized DNA Sequences

Ali Tafazoli Yazdi, Peter Nejjar, Lena Hochrein

主题： 密码学与安全 (cs.CR) ; 概率 (math.PR) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[34] arXiv:2503.02981 (交叉列表自 q-bio.TO) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 碘缺乏建模 显示英文标题

标题： Modeling Iodine Deficiency

Paul Fong, Albert Li, Zoe Meadows, Rati Pillai, Chelsea Proutt, Alex Schneider

评论： 46页，8图，

主题： 组织与器官 (q-bio.TO) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[35] arXiv:2503.03246 (交叉列表自 physics.chem-ph) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于时间依赖DFT的Rhodoblastus acidophilus光合复合体B800部分细菌叶绿素a光学性质的研究 显示英文标题

标题： Time-dependent DFT-based study of bacteriochlorophyll a optical properties within the B800 part of Rhodoblastus acidophilus light-harvesting complex

Evgenia A. Kovaleva, Lyudmila V. Begunovich, Maxim M. Korshunov

主题： 化学物理 (physics.chem-ph) ; 光学 (physics.optics) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[36] arXiv:2503.04362 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于结构的药物发现的一般化跨领域分子学习框架 显示英文标题

标题： A Generalist Cross-Domain Molecular Learning Framework for Structure-Based Drug Discovery

Yiheng Zhu, Mingyang Li, Junlong Liu, Kun Fu, Jiansheng Wu, Qiuyi Li, Mingze Yin, Jieping Ye, Jian Wu, Zheng Wang

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 人工智能 (cs.AI) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[37] arXiv:2503.04659 (交叉列表自 cond-mat.soft) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 使用双链接触图预测杂聚物相分离 显示英文标题

标题： Predicting Heteropolymer Phase Separation Using Two-Chain Contact Maps

Jessica Jin, Wesley Oliver, Michael A. Webb, William M. Jacobs

主题： 软凝聚态物理 (cond-mat.soft) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[38] arXiv:2503.07181 (交叉列表自 physics.chem-ph) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于VTX的大分子系统交互式可视化：以最小全细胞模型为例 显示英文标题

标题： Interactive visualization of large molecular systems with VTX: example with a minimal whole-cell model

Maxime Maria, Valentin Guillaume, Simon Guionniere, Nicolas Dacquay, Cyprien Plateau Holleville, Vincent Larroque, Jean Larde, Yassine Naimi, Jean Philip Piquemal, Guillaume Levieux, Nathalie Lagarde, Stephane Merillou, Matthieu Montes

评论： 查看Marrink23细胞模型的自由飞行导航与VTX：https://youtu.be/zMrAFuqxL3Y

主题： 化学物理 (physics.chem-ph) ; 生物物理 (physics.bio-ph) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[39] arXiv:2503.08674 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 理解与缓解机器学习力场的分布偏移 显示英文标题

标题： Understanding and Mitigating Distribution Shifts For Machine Learning Force Fields

Tobias Kreiman, Aditi S. Krishnapriyan

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 材料科学 (cond-mat.mtrl-sci) ; 化学物理 (physics.chem-ph) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[40] arXiv:2503.09199 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： GENEOnet：支持可解释性和可信度的统计分析 显示英文标题

标题： GENEOnet: Statistical analysis supporting explainability and trustworthiness

Giovanni Bocchi, Patrizio Frosini, Alessandra Micheletti, Alessandro Pedretti, Carmen Gratteri, Filippo Lunghini, Andrea Rosario Beccari, Carmine Talarico

期刊参考： 统计学 0（2025），1-26

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 人工智能 (cs.AI) ; 生物大分子 (q-bio.BM) ; 应用 (stat.AP)

[41] arXiv:2503.10655 (交叉列表自 cs.CL) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 语言建模技术用于分析人类遗传变异的影响 显示英文标题

标题： Language modelling techniques for analysing the impact of human genetic variation

Megha Hegde, Jean-Christophe Nebel, Farzana Rahman

主题： 计算与语言 (cs.CL) ; 人工智能 (cs.AI) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[42] arXiv:2503.11747 (交叉列表自 physics.bio-ph) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 量子生物学的物理原理 显示英文标题

标题： Physical Principles of Quantum Biology

Nathan S. Babcock, Brandy N. Babcock

评论： 技术专著，161页，1754篇引用

主题： 生物物理 (physics.bio-ph) ; 生物大分子 (q-bio.BM) ; 细胞行为 (q-bio.CB) ; 亚细胞过程 (q-bio.SC) ; 组织与器官 (q-bio.TO) ; 量子物理 (quant-ph)

[43] arXiv:2503.13329 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： PERC：一套用于冷冻电镜数据整理的软件工具，应用于模拟、建模和机器学习 显示英文标题

标题： PERC: a suite of software tools for the curation of cryoEM data with application to simulation, modelling and machine learning

Beatriz Costa-Gomes, Joel Greer, Nikolai Juraschko, James Parkhurst, Jola Mirecka, Marjan Famili, Camila Rangel-Smith, Oliver Strickson, Alan Lowe, Mark Basham, Tom Burnley

评论： 22页，4图

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 计算工程、金融与科学 (cs.CE) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[44] arXiv:2503.14442 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 用于1型糖尿病患者葡萄糖预测的可解释神经网络的因果结构诱导 显示英文标题

标题： Inducing Causal Structure for Interpretable Neural Networks Applied to Glucose Prediction for T1DM Patients

Ana Esponera (1), Giovanni Cinà (1 and 2) ((1) Medical Informatics Department from Amsterdam University Medical Center The Netherlands (2) Institute for Logic Language and Computation from University of Amsterdam The Netherlands)

评论： 27页，10页，将发表在《机器学习研究会议论文集》（PMLR）上，将在CLeaR 2025会议上进行展示

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[45] arXiv:2503.14706 (交叉列表自 eess.SY) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 通过化学福克-普朗克方程控制多模态生物分子系统的峰尖度 显示英文标题

标题： Controlling Peak Sharpness in Multimodal Biomolecular Systems via the Chemical Fokker-Planck Equation

Taishi Kotsuka, Enoch Yeung

主题： 系统与控制 (eess.SY) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[46] arXiv:2503.14956 (交叉列表自 nlin.CD) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 来自不可预测混沌的机器学习预测 显示英文标题

标题： Machine learning predictions from unpredictable chaos

Jian Jiang, Long Chen, Lu ke, Bozheng Dou, Yueying Zhu, Yazhou Shi, Huahai Qiu, Bengong Zhang, Tianshou Zhou, Guo-Wei Wei

主题： 混沌动力学 (nlin.CD) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[47] arXiv:2503.15064 (交叉列表自 physics.bio-ph) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 连续时间随机游走模型用于解旋酶的扩散运动 显示英文标题

标题： Continuous-time random walk model for the diffusive motion of helicases

V. Rodriguez-Franco, M.M. Spiering, F. Ritort, M. Mañosas

评论： 16页，5图，

主题： 生物物理 (physics.bio-ph) ; 软凝聚态物理 (cond-mat.soft) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[48] arXiv:2503.16278 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 通过自回归建模的统一跨尺度3D生成与理解 显示英文标题

标题： Unified Cross-Scale 3D Generation and Understanding via Autoregressive Modeling

Shuqi Lu, Haowei Lin, Lin Yao, Zhifeng Gao, Xiaohong Ji, Yitao Liang, Weinan E, Linfeng Zhang, Guolin Ke

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 材料科学 (cond-mat.mtrl-sci) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[49] arXiv:2503.16563 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： Chem42：一种面向目标的配体生成化学语言模型家族 显示英文标题

标题： Chem42: a Family of chemical Language Models for Target-aware Ligand Generation

Aahan Singh, Engin Tekin, Maryam Nadeem, Nancy A. ElNaker, Mohammad Amaan Sayeed, Natalia Vassilieva, Boulbaba Ben Amor

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 人工智能 (cs.AI) ; 计算与语言 (cs.CL) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[50] arXiv:2503.16659 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 蛋白质表示学习进展：方法、应用和未来方向 显示英文标题

标题： Advances in Protein Representation Learning: Methods, Applications, and Future Directions

Viet Thanh Duy Nguyen, Truong-Son Hy

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 生物大分子 (q-bio.BM)