分子网络

2019年11月 的作者和标题

[1] arXiv:1911.00356 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 零膨胀负二项分布模型的运动学基础用于单细胞RNA测序数据 显示英文标题

标题： Kinetic foundation of the zero-inflated negative binomial model for single-cell RNA sequencing data

Chen Jia

评论： 19页，5图

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 生物物理 (physics.bio-ph) ; 定量方法 (q-bio.QM) ; 应用 (stat.AP)

[2] arXiv:1911.03032 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 非稳态调控回路中的耗散 显示英文标题

标题： Dissipation in non-steady state regulatory circuits

P. Szymańska-Rożek, D. Villamaina, J. Miȩkisz, A.M. Walczak

主题： 分子网络 (q-bio.MN)

[3] arXiv:1911.03517 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： N端结构域增强象鲨糖皮质激素和盐皮质激素受体的激活 显示英文标题

标题： N-terminal domain Increases Activation of Elephant Shark Glucocorticoid and Mineralocorticoid Receptors

Yoshinao Katsu, Islam MD Shariful, Xiaozhi Lin, Wataru Takagi, Hiroshi Urushitani, Satomi Kohno, Susumu Hyodo, Michael E. Baker

评论： 17页，6图

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[4] arXiv:1911.04046 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 系统生物学中的网络推断：最新进展、挑战与应用 显示英文标题

标题： Network Inference in Systems Biology: Recent Developments, Challenges, and Applications

Michael M. Saint-Antoine, Abhyudai Singh

主题： 分子网络 (q-bio.MN)

[5] arXiv:1911.04895 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 植物中的通信：多动作电位和机械敏感信号与实验的比较 显示英文标题

标题： Communication in Plants: Comparison of Multiple Action Potential and Mechanosensitive Signals with Experiments

Hamdan Awan, Kareem Zeid, Raviraj S. Adve, Nigel Wallbridge, Carrol Plummer, Andrew W. Eckford

评论： 12页，15图，已接受发表于IEEE纳米生物学汇刊

期刊参考： IEEE 期刊《纳米生物学》2019

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 信息论 (cs.IT) ; 神经与认知 (q-bio.NC)

[6] arXiv:1911.05259 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 生物相关化学空间的加权网络分析 显示英文标题

标题： Weighted Network Analysis of Biologically Relevant Chemical Spaces

Mariko I. Ito, Takaaki Ohnishi

评论： 12页，4图

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 物理与社会 (physics.soc-ph) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[7] arXiv:1911.05895 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 多效性在配体交叉对话存在的情况下实现了特定和准确的信号传递 显示英文标题

标题： Pleiotropy enables specific and accurate signaling in the presence of ligand cross talk

Duncan Kirby, Jeremy Rothschild, Matthew Smart, Anton Zilman

期刊参考： 物理评论E 103, 042401 (2021)

主题： 分子网络 (q-bio.MN)

[8] arXiv:1911.06659 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 大规模生成模型中细胞分化程序的调查揭示了再生是发育的副现象 显示英文标题

标题： Large-Scale Survey of Cell-Differentiation Programs in a Generative Model Reveals Regeneration as an Epiphenomenon of Development

Somya Mani, Tsvi Tlusty

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 生物物理 (physics.bio-ph) ; 种群与进化 (q-bio.PE)

[9] arXiv:1911.10133 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 使用SANA对齐网络的入门指南，SANA是模拟退火网络对齐器 显示英文标题

标题： An introductory guide to aligning networks using SANA, the Simulated Annealing Network Aligner

Wayne B. Hayes

期刊参考： 在蛋白质-蛋白质相互作用网络中，第263-284页。人文出版社，纽约，纽约，2020年

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[10] arXiv:1911.10252 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 生物调控网络是最小挫折的 显示英文标题

标题： Biological Regulatory Networks are Minimally Frustrated

Shubham Tripathi, David A. Kessler, Herbert Levine

评论： 5页，4图

期刊参考： 物理评论快报 125, 088101 (2020)

主题： 分子网络 (q-bio.MN)

[11] arXiv:1911.10316 (交叉列表自 q-bio.MN) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 深度图嵌入用于优先排序协同抗癌药物组合 显示英文标题

标题： Deep graph embedding for prioritizing synergistic anticancer drug combinations

Peiran Jiang, Shujun Huang, Zhenyuan Fu, Zexuan Sun, Ted M. Lakowski, Pingzhao Hu

主题： 分子网络 (q-bio.MN)

[12] arXiv:1911.00978 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 解析求解单分子反应系统的化学主方程：Doi-Peliti路径积分视角 显示英文标题

标题： Solving the chemical master equation for monomolecular reaction systems analytically: a Doi-Peliti path integral view

John J. Vastola

评论： 61页

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 分子网络 (q-bio.MN)

[13] arXiv:1911.02175 (交叉列表自 stat.ML) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 将马尔可夫过程与结构因果建模相结合，可在复杂系统中进行反事实推断 显示英文标题

标题： Integrating Markov processes with structural causal modeling enables counterfactual inference in complex systems

Robert Osazuwa Ness, Kaushal Paneri, Olga Vitek

评论： 被接收至第三十三届神经信息处理系统大会（2019）

主题： 机器学习 (stat.ML) ; 机器学习 (cs.LG) ; 分子网络 (q-bio.MN) ; 应用 (stat.AP)

[14] arXiv:1911.04673 (交叉列表自 physics.bio-ph) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 动能校对与热力学不确定性的极限 显示英文标题

标题： Kinetic Proofreading and the Limits of Thermodynamic Uncertainty

William D. Piñeros, Tsvi Tlusty

评论： 正文：9页，6图。2表；无补充信息

期刊参考： 物理评论E 101, 022415 (2020)

主题： 生物物理 (physics.bio-ph) ; 分子网络 (q-bio.MN)

[15] arXiv:1911.05732 (交叉列表自 eess.SY) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 单稳态和振荡生物分子电路的抗对称积分反馈鲁棒控制 显示英文标题

标题： Antithetic integral feedback for the robust control of monostable and oscillatory biomolecular circuits

Noah Olsman, Fulvio Forni

评论： 7页，7图

主题： 系统与控制 (eess.SY) ; 分子网络 (q-bio.MN)

[16] arXiv:1911.06684 (交叉列表自 q-bio.SC) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 合成生物学的新方法：由光供能和控制的非生物细胞器和人工细胞 显示英文标题

标题： New Approaches in Synthetic Biology: Abiotic Organelles and Artificial Cells Powered and Controlled by Light

Günther Knör

主题： 亚细胞过程 (q-bio.SC) ; 生物大分子 (q-bio.BM) ; 分子网络 (q-bio.MN) ; 组织与器官 (q-bio.TO)

[17] arXiv:1911.07125 (交叉列表自 cs.AI) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 人工智能在推进精准医学中的机会 显示英文标题

标题： Opportunities for artificial intelligence in advancing precision medicine

Fabian V. Filipp

主题： 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG) ; 生物大分子 (q-bio.BM) ; 基因组学 (q-bio.GN) ; 分子网络 (q-bio.MN)

[18] arXiv:1911.09959 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 蛋白质-蛋白质相互作用网络的对齐 显示英文标题

标题： Alignment of Protein-Protein Interaction Networks

Sarra Ghanjeti

评论： 57页，法语，9张图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 分子网络 (q-bio.MN)