定量生物学 > 定量方法
[提交于 2011年7月13日
]
标题: 选择的分支扩散模型:从中性Wright-Fisher情形到包括突变的情形
标题: A branching diffusion model of selection: from the neutral Wright-Fisher case to the one including mutations
摘要: 我们考虑单位区间上的扩散过程 x_{t}。 Doob变换技术包括选择 x_{t}路径的过程。 变换后过程的分布是粒子分支扩散系统的分布,每个粒子像一个新的过程 tilde{x}_{t}一样扩散,在 x_{t}的基础上叠加一个额外的漂移。 tilde{x}_{t}粒子在某些空间依赖速率 lambda 下发生灭绝和/或分支。 对于这个变换后的过程,在分支扩散的类别中,问题在于粒子系统是次临界、临界还是超临界。 在前两种情况下,以概率一发生灭绝。 我们将这些想法应用于种群遗传学中出现的扩散过程。 在这个设置中,过程 x_{t}是一个 Wright-Fisher (WF) 扩散过程,可能是中性的或带有突变。 我们研究一种特定的 Doob 变换,该变换基于通常适应度参数 sigma 的指数函数。 我们考虑这可能是引入选择或适应度在两种 WF 类扩散中的另一种方式,从而引出分支扩散模型的概念。 对于这种适应度的 Doob 变换模型,通常的选择漂移 sigma x(1-x) 应该叠加到 x_{t}的漂移上,以形成 tilde{x}_{t},这是可以二元分支的过程。 在第一个中性情况下,存在分支事件产生新粒子与边界吸收杀死粒子之间的权衡。 在我们的假设下,分支扩散过程最终在有限时间内以指数尾部全局灭绝。 在第二种有突变的情况下,存在移除系统中一些粒子的杀死事件与边界反射中粒子存活之间的权衡。 这种分支扩散过程也最终在非常长的有限时间内全局灭绝,具有幂律尾部。 我们的方法依赖于 x_{t}和 tilde{x}_{t}的转移概率核的谱展开。
当前浏览上下文:
q-bio.QM
切换浏览方式为:
文献和引用工具
与本文相关的代码,数据和媒体
alphaXiv (什么是 alphaXiv?)
CatalyzeX 代码查找器 (什么是 CatalyzeX?)
DagsHub (什么是 DagsHub?)
Gotit.pub (什么是 GotitPub?)
Hugging Face (什么是 Huggingface?)
带有代码的论文 (什么是带有代码的论文?)
ScienceCast (什么是 ScienceCast?)
演示
推荐器和搜索工具
arXivLabs:与社区合作伙伴的实验项目
arXivLabs 是一个框架,允许合作伙伴直接在我们的网站上开发和分享新的 arXiv 特性。
与 arXivLabs 合作的个人和组织都接受了我们的价值观,即开放、社区、卓越和用户数据隐私。arXiv 承诺这些价值观,并且只与遵守这些价值观的合作伙伴合作。
有一个为 arXiv 社区增加价值的项目想法吗? 了解更多关于 arXivLabs 的信息.