定量生物学 > 定量方法
[提交于 2025年1月2日
(v1)
,最后修订 2025年6月16日 (此版本, v4)]
标题: 一个系统化的计算框架用于生物领域数学模型的实际可辨识性分析
标题: A Systematic Computational Framework for Practical Identifiability Analysis in Mathematical Models Arising from Biology
摘要: 实际可辨识性是在基于数据的数学系统建模中的一个关键问题。 本文提出了一种新颖的实际可辨识性分析框架,用于评估生物系统数学模型中的参数可辨识性。 从严格定义实际可辨识性的数学定义出发,我们证明了它与Fisher信息矩阵可逆性之间的等价性。 我们的框架建立了实际可辨识性和坐标可辨识性之间的关系,并引入了一种新度量,相比轮廓似然法能简化且加速参数可辨识性的评估。 此外,我们提出了新的正则化项来处理非可辨识参数,从而实现不确定性量化并提升模型可靠性。 为了指导实验设计,我们提供了一种最优数据收集算法,确保所有模型参数都能达到实际可辨识性。 Hill函数、神经网络以及动态生物模型的应用展示了所提出的计算框架在揭示关键生物学过程和识别关键可观测变量方面的可行性和效率。
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