定量生物学 > 基因组学
[提交于 2025年6月27日
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标题: 五基因表达公式准确检测肝细胞癌肿瘤
标题: Five-Gene Expression Formula Accurately Detects Hepatocellular Carcinoma Tumors
摘要: 肝细胞癌(HCC)是全球癌症相关死亡的主要原因之一。 几种诊断方法,如成像技术以及 血清甲胎蛋白(AFP)检测,已被用于HCC的检测;然而,它们的有效性仅限于疾病的后期阶段。 相比之下,活检样本的转录组分析在早期检测中显示出前景。 虽然机器学习技术已被应用于转录组数据进行癌症检测,但由于跨不同数据集的泛化能力差、缺乏可解释性以及计算复杂度高等挑战,其临床应用仍然有限。 为了解决这些限制,我们开发了一种新的HCC检测预测公式,使用了Kolmogorov-Arnold网络(KAN)。 该公式基于五个基因的表达水平:VIPR1、CYP1A2、FCN3、ECM1和LIFR。 该公式来源于GSE25097数据集,为HCC识别提供了一种简单、可解释、高效且易于获取的方法。 它在GSE25097测试集上实现了99%的准确率,并在六个额外的独立数据集上表现出稳健的性能,在所有情况下准确率均超过90%。 这些发现突显了这五个基因在HCC检测中的关键作用,作为生物标志物,为未来的研究和临床应用提供了基础,以改进HCC的诊断方法。
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