定量生物学 > 定量方法
[提交于 2025年9月3日
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标题: ALBATROSS:基于随机子采样的廉价过滤几何方法
标题: ALBATROSS: Cheap Filtration Based Geometry via Stochastic Sub-Sampling
摘要: 拓扑数据分析(TDA)检测生物数据中的几何结构。 然而,许多TDA算法内存需求高,在大规模数据集上不实用。 在这里,我们介绍一种统计协议,减少了TDA的内存需求,并使拥有适度计算资源的科学家能够使用。 我们通过两个经验数据集验证该协议,表明它以更低的内存需求复制了之前的发现。 最后,我们通过在高空间分辨率下映射人类皮层的功能相关性拓扑结构,展示了该协议的强大功能,这是在没有这种新方法之前无法实现的。
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