定量生物学 > 定量方法
[提交于 2025年10月1日
]
标题: 在之前基础模型未解决的具有挑战性的肾脏病理病例上评估新的AI细胞基础模型
标题: Evaluating New AI Cell Foundation Models on Challenging Kidney Pathology Cases Unaddressed by Previous Foundation Models
摘要: 准确的细胞核分割对于肾脏病理学中的下游任务至关重要,但由于肾组织的形态多样性和成像变异性,这仍然是一个主要挑战。 尽管我们之前的工作已经评估了该领域早期生成的AI细胞基础模型,但最近的细胞基础模型的有效性仍不明确。 在本研究中,我们在一个人机交互评分框架内,使用一组多样化的大规模肾脏图像块,对先进的AI细胞基础模型(2025年)进行了基准测试,包括CellViT++变体和Cellpose-SAM,与三个在2024年之前开发的广泛使用的细胞基础模型进行比较。 我们进一步进行了基于融合的集成评估和模型一致性分析,以评估不同模型的分割能力。 我们的结果表明,CellViT++ [Virchow] 在经过筛选的2,091个具有挑战性的样本集上,有40.3%的预测被评为“良好”,其表现优于所有先前模型。 此外,我们的融合模型实现了62.2%的“良好”预测,并且只有0.4%的“差”,显著减少了分割错误。 值得注意的是,融合模型(2025年)成功解决了我们之前研究中未解决的大部分具有挑战性的情况。 这些发现展示了AI细胞基础模型在肾脏病理学中的潜力,并提供了一个经过筛选的具有挑战性的样本数据集,以支持未来针对肾脏的模型优化。
文献和引用工具
与本文相关的代码,数据和媒体
alphaXiv (什么是 alphaXiv?)
CatalyzeX 代码查找器 (什么是 CatalyzeX?)
DagsHub (什么是 DagsHub?)
Gotit.pub (什么是 GotitPub?)
Hugging Face (什么是 Huggingface?)
带有代码的论文 (什么是带有代码的论文?)
ScienceCast (什么是 ScienceCast?)
演示
推荐器和搜索工具
arXivLabs:与社区合作伙伴的实验项目
arXivLabs 是一个框架,允许合作伙伴直接在我们的网站上开发和分享新的 arXiv 特性。
与 arXivLabs 合作的个人和组织都接受了我们的价值观,即开放、社区、卓越和用户数据隐私。arXiv 承诺这些价值观,并且只与遵守这些价值观的合作伙伴合作。
有一个为 arXiv 社区增加价值的项目想法吗? 了解更多关于 arXivLabs 的信息.