定量方法

2025年06月 的作者和标题

[1] arXiv:2506.00053 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 通过无放回采样和随机投影进行特征选择以改进统计学习方法 显示英文标题

标题： Improving statistical learning methods via features selection without replacement sampling and random projection

Sulaiman khan, Muhammad Ahmad, Fida Ullah, Carlos Aguilar Ibañez, José Eduardo Valdez Rodriguez

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG) ; 应用 (stat.AP) ; 机器学习 (stat.ML)

[2] arXiv:2506.00168 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 一种针对基于代理模型的新颖敏感性分析方法对体内肿瘤球体模拟进行分层 显示英文标题

标题： A novel sensitivity analysis method for agent-based models stratifies in-silico tumor spheroid simulations

Edward H. Rohr, John T. Nardini

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 细胞行为 (q-bio.CB) ; 机器学习 (stat.ML)

[3] arXiv:2506.00223 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 提升药物发现：基于自动编码器的潜在空间增强用于改进分子溶解度预测的LatMixSol方法 显示英文标题

标题： Enhancing Drug Discovery: Autoencoder-Based Latent Space Augmentation for Improved Molecular Solubility Prediction using LatMixSol

Mohammad Saleh Hasankhani

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[4] arXiv:2506.00593 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 看妈妈，没有实验数据！从模拟中学习评分蛋白质-配体相互作用 显示英文标题

标题： Look mom, no experimental data! Learning to score protein-ligand interactions from simulations

Michael Brocidiacono, James Wellnitz, Konstantin I. Popov, Alexander Tropsha

评论： 15页，3个图

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[5] arXiv:2506.00730 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 用更少获得更多的：迁移学习提高了外围可穿戴设备的睡眠阶段解码准确性 显示英文标题

标题： Getting More from Less: Transfer Learning Improves Sleep Stage Decoding Accuracy in Peripheral Wearable Devices

William G Coon, Diego Luna, Akshita Panagrahi, Matthew Reid, Mattson Ogg

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 神经与认知 (q-bio.NC)

[6] arXiv:2506.01137 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 针对预测转甲状腺素蛋白（TTR）转录激活因子和人多巴胺D1受体拮抗剂的计算方法的比较分析 显示英文标题

标题： Comparative analysis of computational approaches for predicting Transthyretin (TTR) transcription activators and human dopamine D1 receptor antagonists

Mariya L. Ivanova, Nicola Russo, Gueorgui Mihaylov, Konstantin Nikolic

评论： 27页，25张表格，9幅图

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[7] arXiv:2506.02076 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于多事件生存分析的肌萎缩侧索硬化症功能下降有意义的预测 显示英文标题

标题： A meaningful prediction of functional decline in amyotrophic lateral sclerosis based on multi-event survival analysis

Christian Marius Lillelund, Sanjay Kalra, Russell Greiner

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 机器学习 (stat.ML)

[8] arXiv:2506.03199 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 量子认知机器学习用于预测染色体不稳定性 显示英文标题

标题： Quantum Cognition Machine Learning for Forecasting Chromosomal Instability

Giuseppe Di Caro, Vahagn Kirakosyan, Alexander G. Abanov, Jerome R. Busemeyer, Luca Candelori, Nadine Hartmann, Ernest T. Lam, Kharen Musaelian, Ryan Samson, Harold Steinacker, Dario Villani, Martin T. Wells, Richard J. Wenstrup, Mengjia Xu

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 量子物理 (quant-ph)

[9] arXiv:2506.03209 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 预测老年SICU患者术后卒中：使用MIMIC数据的可解释机器学习模型 显示英文标题

标题： Predicting Postoperative Stroke in Elderly SICU Patients: An Interpretable Machine Learning Model Using MIMIC Data

Tinghuan Li, Shuheng Chen, Junyi Fan, Elham Pishgar, Kamiar Alaei, Greg Placencia, Maryam Pishgar

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[10] arXiv:2506.03237 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： UniSite：用于端到端配体结合位点检测的第一个跨结构数据集和学习框架 显示英文标题

标题： UniSite: The First Cross-Structure Dataset and Learning Framework for End-to-End Ligand Binding Site Detection

Jigang Fan, Quanlin Wu, Shengjie Luo, Liwei Wang

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[11] arXiv:2506.04235 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 抗体结合亲和力成熟与设计的基准 显示英文标题

标题： Benchmark for Antibody Binding Affinity Maturation and Design

Xinyan Zhao, Yi-Ching Tang, Akshita Singh, Victor J Cantu, KwanHo An, Junseok Lee, Adam E Stogsdill, Ashwin Kumar Ramesh, Zhiqiang An, Xiaoqian Jiang, Yejin Kim

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 计算工程、金融与科学 (cs.CE) ; 机器学习 (cs.LG) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[12] arXiv:2506.04515 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 潜在空间假设：迈向通用医学表示学习 显示英文标题

标题： The Latent Space Hypothesis: Toward Universal Medical Representation Learning

Salil Patel

评论： 51页，12幅图。一篇立场论文探讨了潜在空间假设——即不同的医学数据可以被表示在反映基本生物过程的共享潜在空间中的命题。论文讨论了理论基础，回顾了支持证据，并考虑了对医学AI和表征学习的潜在影响。

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[13] arXiv:2506.05769 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 连接组脑指纹识别：术语、测量方法及目标属性 显示英文标题

标题： Connectome brain fingerprinting: terminology, measures, and target properties

Matteo Fraschini, Matteo Demuru, Daniele Marinazzo, Luca Didaci

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 神经与认知 (q-bio.NC)

[14] arXiv:2506.05992 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 具有移动灭绝阈值的癌症模型再现了真实的癌症数据 显示英文标题

标题： Cancer model with moving extinction threshold reproduces real cancer data

Frank Bastian, Hassan Alkhayuon, Kieran Mulchrone, Micheal O'Riordain, Sebastian Wieczorek

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 动力系统 (math.DS)

[15] arXiv:2506.06413 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 抗体消耗驱动的动态竞争：从急性免疫反应过渡到感染后遗症的系统假设 显示英文标题

标题： Antibody Consumption-Driven Dynamic Competition: A Systems Hypothesis for the Transition from Acute Immune Response to Post-Infection Sequelae

Shi Qiru

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[16] arXiv:2506.07793 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 用于连续小波分析的新软件能够在便携式计算机上对脑电图进行实时分析 显示英文标题

标题： Novel software for continuous wavelet analysis enable EEG real-time analysis on portable computers

Shoichiro Nakanishi

评论： 17页，4幅图，2张表格

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[17] arXiv:2506.08059 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： CaliciBoost：用于Caco-2渗透性预测的分子表示性能驱动评估 显示英文标题

标题： CaliciBoost: Performance-Driven Evaluation of Molecular Representations for Caco-2 Permeability Prediction

Huong Van Le, Weibin Ren, Junhong Kim, Yukyung Yun, Young Bin Park, Young Jun Kim, Bok Kyung Han, Inho Choi, Jong IL Park, Hwi-Yeol Yun, Jae-Mun Choi

评论： 49页，11幅图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[18] arXiv:2506.08954 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： Protriever：用于适应性预测的端到端可微蛋白质同源性搜索 显示英文标题

标题： Protriever: End-to-End Differentiable Protein Homology Search for Fitness Prediction

Ruben Weitzman, Peter Mørch Groth, Lood Van Niekerk, Aoi Otani, Yarin Gal, Debora Marks, Pascal Notin

评论： 已被ICML 2025接受

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[19] arXiv:2506.09053 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 定位复杂系统中隐藏因素的协同作用：以静息态脑网络和HeLa基因表达谱为例 显示英文标题

标题： Localizing synergies of hidden factors across complex systems: resting brain networks and HeLa gene expression profile as case studies

Marlis Ontivero-Ortega, Gorana Mijatovic, Luca Faes, Daniele Marinazzo, Sebastiano Stramaglia

评论： 11页，3幅图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 数据分析、统计与概率 (physics.data-an)

[20] arXiv:2506.09063 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 通过分层高斯混合和部分发现重构异质生物分子 显示英文标题

标题： Reconstructing Heterogeneous Biomolecules via Hierarchical Gaussian Mixtures and Part Discovery

Shayan Shekarforoush, David B. Lindell, Marcus A. Brubaker, David J. Fleet

评论： 21页，14幅图，项目主页：https://shekshaa.github.io/CryoSPIRE

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 计算机视觉与模式识别 (cs.CV) ; 机器学习 (cs.LG) ; 图像与视频处理 (eess.IV)

[21] arXiv:2506.09097 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 使用签名系数检测极少量血液样本中的恶性动态 显示英文标题

标题： Detecting malignant dynamics on very few blood sample using signature coefficients

Rémi Vaucher, Stéphane Chrétien

评论： 审阅中

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 机器学习 (stat.ML)

[22] arXiv:2506.09374 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 遗传还是产生的？ 当蛋白质计数受细胞分裂历史影响时推断蛋白质产生动力学 显示英文标题

标题： Inherited or produced? Inferring protein production kinetics when protein counts are shaped by a cell's division history

Pedro Pessoa, Juan Andres Martinez, Vincent Vandenbroucke, Frank Delvigne, Steve Pressé

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 数据分析、统计与概率 (physics.data-an) ; 应用 (stat.AP) ; 机器学习 (stat.ML)

[23] arXiv:2506.09442 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 几何降阶建模（GROM）及其在胶淋巴功能建模中的应用 显示英文标题

标题： Geometry Reduced Order Modeling (GROM) with application to modeling of glymphatic function

Andreas Solheim, Geir Ringstand, Per Kristian Eide, Kent-Andre Mardal

评论： 21页，8幅图

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[24] arXiv:2506.09604 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于图像的生物光散斑对比分析用于快速抗菌 susceptibility 测试 显示英文标题

标题： Image-Based Biospeckle Contrast Analysis for Rapid Antimicrobial Susceptibility Testing

M.A. Gameiro, R.F. Pinto, N.V. Lopes

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[25] arXiv:2506.09751 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 新冠疫情下基于数据驱动的IRCU患者流量建模 显示英文标题

标题： Data-Driven Modeling of IRCU Patient Flow in the COVID-19 Pandemic

Ana Carmen Navas-Ortega, José Antonio Sánchez-Martínez, Paula García-Flores, Concepción Morales-García, Rene Fabregas

评论： 新冠疫情期间中间呼吸护理病房（IRCU）患者流动动力学的临床结局分析与数据驱动建模。主论文：20页，7个图。补充材料：14页，5个图。投稿至PLOS ONE。

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[26] arXiv:2506.10031 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： scSSL-Bench：单细胞数据自监督学习基准测试 显示英文标题

标题： scSSL-Bench: Benchmarking Self-Supervised Learning for Single-Cell Data

Olga Ovcharenko, Florian Barkmann, Philip Toma, Imant Daunhawer, Julia Vogt, Sebastian Schelter, Valentina Boeva

评论： 录用于ICML 2025（亮点论文）

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[27] arXiv:2506.10040 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 使用三尺度数学模型评估间日疟原虫森林疟疾的干预措施 显示英文标题

标题： Evaluating interventions for Plasmodium vivax forest malaria using a three-scale mathematical model

Shoshana Elgart, Mark B. Flegg, Jennifer A. Flegg

评论： 40页，8幅图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 动力系统 (math.DS) ; 种群与进化 (q-bio.PE)

[28] arXiv:2506.10134 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： FAPS：蛋白质结构组学分析的快速平台 显示英文标题

标题： FAPS: A Fast Platform for Protein Structureomics Analysis

Lucas Wilken, Nihjum Paul, Troy Timmerman, Sara A. Tolba, Amara Arshad, Di Wu, Wenjie Xia, Bakhtiyor Rasulev, Rick Jansen, Dali Sun

评论： 16页，5个图

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[29] arXiv:2506.10271 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 使用进化不可能序列评估基因组语言模型中的DNA功能理解 显示英文标题

标题： Evaluating DNA function understanding in genomic language models using evolutionarily implausible sequences

Shiyu Jiang, Xuyin Liu, Zitong Jerry Wang

评论： 19页，5图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 基因组学 (q-bio.GN)

[30] arXiv:2506.10879 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 一种类似于 Goemans-Williamson 的算法用于识别临床试验中的亚组 显示英文标题

标题： A Goemans-Williamson type algorithm for identifying subcohorts in clinical trials

Pratik Worah

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[31] arXiv:2506.11311 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 实际参数可辨识性和模型区分性的最优实验设计 显示英文标题

标题： Optimal experiment design for practical parameter identifiability and model discrimination

Yue Liu (1 and 2), Philip K. Maini (1), Ruth E. Baker (1) ((1) University of Oxford, (2) Purdue University)

评论： 投稿至《数学生物科学》

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[32] arXiv:2506.12209 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 核形成反馈可以驱动神经突中偏斜微管极性的建立和维持 显示英文标题

标题： Nucleation feedback can drive establishment and maintenance of biased microtubule polarity in neurites

Hannah G. Scanlon, Gibarni Mahata, Anna C. Nelson, Scott A. McKinley, Melissa M. Rolls, Maria-Veronica Ciocanel

评论： 37页，10图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 亚细胞过程 (q-bio.SC)

[33] arXiv:2506.12277 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 评估机器学习模型从随机临床试验数据（具有事件发生时间结局）中测量个体化治疗效果 显示英文标题

标题： Evaluation of machine-learning models to measure individualized treatment effects from randomized clinical trial data with time-to-event outcomes

Elvire Roblin, Paul-Henry Cournède, Stefan Michiels

评论： 19页，6幅图

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[34] arXiv:2506.12567 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 最大葡萄糖变化速度显著区分糖尿病前期与糖尿病 显示英文标题

标题： Maximal Speed of Glucose Change Significantly Distinguishes Prediabetes from Diabetes

Dandan Wang, Xiaoyan Chen, Jingxiang Lin, Teng Zhang, Lianyi Huang, Dongliang Leng, Xiaohua Douglas Zhang, Gang Li

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[35] arXiv:2506.13830 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 用于从序列中直接解码结合热点的 Seq2Bind 网络服务器：使用微调蛋白质语言模型 显示英文标题

标题： Seq2Bind Webserver for Decoding Binding Hotspots directly from Sequences using Fine-Tuned Protein Language Models

Xiang Ma, Supantha Dey, Vaishnavey SR, Casey Zelinski, Qi Li, Ratul Chowdhury

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[36] arXiv:2506.13835 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于 EEG 和 EMG 的异构电极配置的无声语音解码系统 显示英文标题

标题： A Silent Speech Decoding System from EEG and EMG with Heterogenous Electrode Configurations

Masakazu Inoue, Motoshige Sato, Kenichi Tomeoka, Nathania Nah, Eri Hatakeyama, Kai Arulkumaran, Ilya Horiguchi, Shuntaro Sasai

评论： 已被Interspeech 2025接受为展示论文。5页，4幅图，2张表格。

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 神经与认知 (q-bio.NC)

[37] arXiv:2506.13843 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： BlastDiffusion：一种生成合成胚胎图像的潜在扩散模型，用于解决体外受精中的数据稀缺问题 显示英文标题

标题： BlastDiffusion: A Latent Diffusion Model for Generating Synthetic Embryo Images to Address Data Scarcity in In Vitro Fertilization

Alejandro Golfe, Natalia P. García-de-la-puente, Adrián Colomer, Valery Naranjo

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[38] arXiv:2506.14014 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 超越黑箱：增强在神经数据上训练的Transformer的可解释性 显示英文标题

标题： Beyond Black Boxes: Enhancing Interpretability of Transformers Trained on Neural Data

Laurence Freeman, Philip Shamash, Vinam Arora, Caswell Barry, Tiago Branco, Eva Dyer

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[39] arXiv:2506.14021 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 一个包含11,000例的脑转移纵向磁共振影像开放获取数据集 显示英文标题

标题： An 11,000-Study Open-Access Dataset of Longitudinal Magnetic Resonance Images of Brain Metastases

Saahil Chadha, David Weiss, Anastasia Janas, Divya Ramakrishnan, Thomas Hager, Klara Osenberg, Klara Willms, Joshua Zhu, Veronica Chiang, Spyridon Bakas, Nazanin Maleki, Durga V. Sritharan, Sven Schoenherr, Malte Westerhoff, Matthew Zawalich, Melissa Davis, Ajay Malhotra, Khaled Bousabarah, Cornelius Deuschl, MingDe Lin, Sanjay Aneja, Mariam S. Aboian

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[40] arXiv:2506.14052 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 通过靶向β淀粉样蛋白聚集抑制阿尔茨海默病 显示英文标题

标题： Inhibiting Alzheimer's Disease by Targeting Aggregation of Beta-Amyloid

Ananya Joshi, George Khoury, Christodoulas Floudas

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[41] arXiv:2506.14120 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 利用迁移学习和用户特定更新快速训练BCI解码器 显示英文标题

标题： Leveraging Transfer Learning and User-Specific Updates for Rapid Training of BCI Decoders

Ziheng Chen, Po T. Wang, Mina Ibrahim, Shivali Baveja, Rong Mu, An H. Do, Zoran Nenadic

评论： 6页会议论文预印本

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[42] arXiv:2506.14853 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： DisProtEdit：探索多属性蛋白质编辑的解耦表示 显示英文标题

标题： DisProtEdit: Exploring Disentangled Representations for Multi-Attribute Protein Editing

Max Ku, Sun Sun, Hongyu Guo, Wenhu Chen

评论： 接受到ICMLW（GenBio）2025和ICMLW（FM4LS）2025录用通知

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[43] arXiv:2506.15728 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 智能手机集成的RPA-CRISPR-Cas12a检测系统结合微针采样用于马铃薯晚疫病早期现场诊断 显示英文标题

标题： Smartphone-integrated RPA-CRISPR-Cas12a Detection System with Microneedle Sampling for Point-of-Care Diagnosis of Potato Late Blight in Early Stage

Jiangnan Zhao (1 and 2), Hanbo Xu (1 and 2), Cifu Xu (1 and 2), Wenlong Yin (1 and 2), Laixin Luo (3), Gang Liu (1 and 2), Yan Wang (1 and 2) ((1) Key Laboratory of Smart Agriculture Systems, Ministry of Education, China Agricultural University, Beijing, PR China, (2) Key Laboratory of Agricultural Information Acquisition Technology, Ministry of Agriculture and Rural Affairs of China, China Agricultural University, Beijing, PR China, (3) Department of Plant Pathology, China Agricultural University, Beijing Key Laboratory of Seed Disease Testing and Control, Beijing, PR China)

评论： 32页，7幅图，1张表格

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 计算机视觉与模式识别 (cs.CV) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

[44] arXiv:2506.15855 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于相关突变类型概率的贝叶斯非负矩阵分解用于突变特征 显示英文标题

标题： Bayesian Non-Negative Matrix Factorization with Correlated Mutation Type Probabilities for Mutational Signatures

Iris Lang, Jenna Landy, Giovanni Parmigiani

评论： 23页，10张图，（+参考文献和补充材料）

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 方法论 (stat.ME)

[45] arXiv:2506.15957 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 通过双报告系统量化信息流及其在细菌趋化中的应用 显示英文标题

标题： Quantification of Information Flow by Dual Reporter System and Its Application to Bacterial Chemotaxis

Kento Nakamura, Hajime Fukuoka, Akihiko Ishijima, Tetsuya J. Kobayashi

评论： 5页，2图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 细胞行为 (q-bio.CB)

[46] arXiv:2506.16091 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 几何深度学习助力蛋白质工程 机遇与挑战 显示英文标题

标题： Geometric deep learning assists protein engineering. Opportunities and Challenges

Julián García-Vinuesa, Jorge Rojas, Nicole Soto-García, Nicolás Martínez, Diego Alvarez-Saravia, Roberto Uribe-Paredes, Mehdi D. Davari, Carlos Conca, Juan A. Asenjo, David Medina-Ortiz

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[47] arXiv:2506.16359 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： SHREC：一种用于利用大型语言模型推进下一代计算表型分析的框架 显示英文标题

标题： SHREC: A Framework for Advancing Next-Generation Computational Phenotyping with Large Language Models

Sarah Pungitore, Shashank Yadav, Molly Douglas, Jarrod Mosier, Vignesh Subbian

评论： 提交至 PLOS 数字健康

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[48] arXiv:2506.16921 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： EHCube4P：通过超立方图卷积神经网络学习表型模式以估算蛋白质适合度函数 显示英文标题

标题： EHCube4P: Learning Epistatic Patterns Through Hypercube Graph Convolution Neural Network for Protein Fitness Function Estimation

Muhammad Daud, Philippe Charton, Cedric Damour, Jingbo Wang, Frederic Cadet

评论： 12页，4幅图，1张表

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[49] arXiv:2506.18198 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 单细胞蛋白质组学技术：探索原理的工具 显示英文标题

标题： Single-Cell Proteomic Technologies: Tools in the quest for principles

Nikolai Slavov

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 生物大分子 (q-bio.BM) ; 分子网络 (q-bio.MN)

[50] arXiv:2506.18314 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： BrainSymphony：一种基于Transformer的fMRI时间序列与结构连接融合方法 显示英文标题

标题： BrainSymphony: A Transformer-Driven Fusion of fMRI Time Series and Structural Connectivity

Moein Khajehnejad, Forough Habibollahi, Adeel Razi

评论： 21页，8图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG) ; 神经与认知 (q-bio.NC)