定量生物学

2021年08月 的作者和标题

[1] arXiv:2108.00047 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 动态环境中的决策制定预测演变 显示英文标题

标题： The evolution of forecasting for decision making in dynamic environments

Andrew R. Tilman, Vítor V. Vasconcelos, Erol Akçay, Joshua B. Plotkin

评论： 修订的稿件；结果不变

期刊参考： 集体智能 2:4 (2023) 1-14

主题： 种群与进化 (q-bio.PE)

[2] arXiv:2108.00296 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 颈动脉狭窄严重程度的深度预测学习 显示英文标题

标题： Deep Predictive Learning of Carotid Stenosis Severity

Yiqun Diao, Oliver Zhao, Priya Kothapalli, Peter Monteleone, Chandrajit Bajaj

评论： 15页，10图，2表

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[3] arXiv:2108.00310 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 大脑认知中复杂功能皮层模式的观察 显示英文标题

标题： Observation of complex functional cortical patterns in brain cognition

Jasleen Gund, R.K. Brojen Singh

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[4] arXiv:2108.00371 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 猴脑皮层功能连接在丙泊酚诱导麻醉开始时的动力学变化 显示英文标题

标题： Macaque's Cortical Functional Connectivity Dynamics at the Onset of Propofol-Induced Anesthesia

Eduardo C. Padovani

评论： 20页，5图

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[5] arXiv:2108.00466 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 神经解剖网络揭示了人类认知能力的本体论的哪些方面？ 显示英文标题

标题： What do neuroanatomical networks reveal about the ontology of human cognitive abilities?

Daniel Kristanto, Xinyang Liu, Werner Sommer, Andrea Hildebrandt, Changsong Zhou

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[6] arXiv:2108.00532 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 胚胎发育中的自组织：神话与现实 显示英文标题

标题： Self-organization in embryonic development: myth and reality

Stuart A. Newman

主题： 组织与器官 (q-bio.TO)

[7] arXiv:2108.00536 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于全一次性无线贴片传感器的实时心电间隔监测 显示英文标题

标题： Real-Time ECG Interval Monitoring Using a Fully Disposable Wireless Patch Sensor

Gabriel Nallathambi, Paurakh Rajbhandary, Thang Tran, Olivier Colliou

评论： 发表于2021年IEEE第17届可穿戴和植入式体感网络会议（BSN）

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 信号处理 (eess.SP) ; 生物物理 (physics.bio-ph)

[8] arXiv:2108.00537 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 在自由生活条件下，口腔温度与可吞咽核心温度药丸的有效性和可靠性 显示英文标题

标题： Validity and reliability of oral temperature compared to ingestible core temperature pill in free-living conditions

Paurakh Rajbhandary, Gabriel Nallathambi

评论： 7页

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 生物物理 (physics.bio-ph)

[9] arXiv:2108.00777 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： CPSC：用于高效预测可靠性量化和数据增强的收缩中心共形预测，一种在电子鼻的替代草药分类中的案例 显示英文标题

标题： CPSC: Conformal prediction with shrunken centroids for efficient prediction reliability quantification and data augmentation, a case in alternative herbal medicine classification with electronic nose

Li Liu, Xianghao Zhan, Xikai Yang, Xiaoqing Guan, Rumeng Wu, Zhan Wang, Zhiyuan Luo, You Wang, Guang Li

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[10] arXiv:2108.00813 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： CirCor DigiScope数据集：从杂音检测到杂音分类 显示英文标题

标题： The CirCor DigiScope Dataset: From Murmur Detection to Murmur Classification

Jorge Oliveira, Francesco Renna, Paulo Dias Costa, Marcelo Nogueira, Cristina Oliveira, Carlos Ferreira, Alipio Jorge, Sandra Mattos, Thamine Hatem, Thiago Tavares, Andoni Elola, Ali Bahrami Rad, Reza Sameni, Gari D Clifford, Miguel T. Coimbra

评论： 12页，6张表格，8幅图，在《IEEE生物医学与健康信息学杂志》

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[11] arXiv:2108.00837 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 发现秀丽线虫中的稀疏控制策略 显示英文标题

标题： Discovering sparse control strategies in C. elegans

Edward D. Lee, Xiaowen Chen, Bryan C. Daniels

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[12] arXiv:2108.00904 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 如何形态计算塑造具身代理人的整合信息 显示英文标题

标题： How Morphological Computation shapes Integrated Information in Embodied Agents

Carlotta Langer, Nihat Ay

期刊参考： 前额叶心理学 12:716433 (2021)

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 信息论 (cs.IT)

[13] arXiv:2108.00905 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 前庭传入神经元中的尖峰时间规律性：离子电流如何影响感觉编码机制 显示英文标题

标题： Spike timing regularity in vestibular afferent neurons: How ionic currents influence sensory encoding mechanisms

Selina Baeza Loya

评论： 6页，1图

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[14] arXiv:2108.00950 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： ANDOR 以及更进一步：动态可切换逻辑门作为生化调控网络中灵活信息处理的模块 显示英文标题

标题： ANDOR and beyond: dynamically switchable logic gates as modules for flexible information processing in biochemical regulatory networks

Mohammadreza Bahadorian, Carl D. Modes

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 适应性与自组织系统 (nlin.AO) ; 生物物理 (physics.bio-ph)

[15] arXiv:2108.00994 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 流行病模型中的极端爆发动力学 显示英文标题

标题： Extreme outbreak dynamics in epidemic models

Jason Hindes, Michael Assaf, Ira B. Schwartz

评论： 8页，3图；将发表于《物理评论快报》（2022）

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 物理与社会 (physics.soc-ph)

[16] arXiv:2108.01198 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 传染病爆发的随机性及其对最优干预措施的影响 显示英文标题

标题： Stochasticity of infectious outbreaks and consequences for optimal interventions

Roberto Morán-Tovar, Henning Gruell, Florian Klein, Michael Lässig

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 物理与社会 (physics.soc-ph)

[17] arXiv:2108.01210 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于神经数据变压器的神经种群活动表示学习 显示英文标题

标题： Representation learning for neural population activity with Neural Data Transformers

Joel Ye, Chethan Pandarinath

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 机器学习 (cs.LG)

[18] arXiv:2108.01229 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 认真对待认知：认知的广义物理学 显示英文标题

标题： Taking Cognition Seriously: A generalised physics of cognition

Sophie Alyx Taylor, Son Cao Tran, Dan V. Nicolau Jr

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 人工智能 (cs.AI) ; 范畴论 (math.CT) ; 生物物理 (physics.bio-ph)

[19] arXiv:2108.01304 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 空间分辨转录组学数据分析的软件包和算法比较分析 显示英文标题

标题： Comparative Analysis of Packages and Algorithms for the Analysis of Spatially Resolved Transcriptomics Data

Natalie Charitakis (1), Mirana Ramialison (1,2,3), Hieu T. Nim (1,2,3) ((1), Murdoch Children's Research Institute, Parkville, Australia, (2) Australian Regenerative Medicine Institute, Monash University, Clayton, Australia, (3) Systems Biology Institute, Clayton, Australia)

评论： 32页，图3

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 基因组学 (q-bio.GN)

[20] arXiv:2108.01514 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于一步法、无需洗涤的纳米颗粒聚集体的磁粒子光谱（MPS）生物检测方法，用于液相中SARS-CoV-2刺突蛋白和核衣壳蛋白的检测 显示英文标题

标题： One-step, Wash-free, Nanoparticle Clustering-based Magnetic Particle Spectroscopy (MPS) Bioassay Method for Detection of SARS-CoV-2 Spike and Nucleocapsid Proteins in Liquid Phase

Kai Wu, Vinit Kumar Chugh, Venkatramana D. Krishna, Arturo di Girolamo, Yongqiang Andrew Wang, Renata Saha, Shuang Liang, Maxim C-J Cheeran, Jian-Ping Wang

评论： 35页，14图

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 生物物理 (physics.bio-ph)

[21] arXiv:2108.01563 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 蛋白质氨基酸集合中的一种新型镜像对称性 显示英文标题

标题： A new type of mirror symmetry in the set of protein amino acids

Miloje M. Rakocevic

评论： 16页，6张表格，4幅图，2个展示和2个调查

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[22] arXiv:2108.01620 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 具有非竞争性转录调控结构的随机基因转录 显示英文标题

标题： Stochastic gene transcription with non-competitive transcription regulatory architecture

Amit Kumar Das

评论： 文章经过大幅修改，增加了新的段落、公式、图表和附录，共29页，63幅图，2张表

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 软凝聚态物理 (cond-mat.soft) ; 统计力学 (cond-mat.stat-mech) ; 生物物理 (physics.bio-ph)

[23] arXiv:2108.01765 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于基因组序列使用对数行列式距离识别物种网络拓扑的可辨识性 显示英文标题

标题： Identifiability of species network topologies from genomic sequences using the logDet distance

Elizabeth S. Allman, Hector Baños, John A. Rhodes

评论： 25页

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 统计理论 (math.ST)

[24] arXiv:2108.01927 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 深度马尔可夫状态建模的进展：粗粒化和实验数据约束 显示英文标题

标题： Progress in deep Markov State Modeling: Coarse graining and experimental data restraints

Andreas Mardt, Frank Noé

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 计算物理 (physics.comp-ph)

[25] arXiv:2108.01973 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 利用病毒复制和组装机制的治疗干扰粒子表现出有前景的性能：一项建模研究 显示英文标题

标题： Therapeutic Interfering Particles Exploiting Viral Replication and Assembly Mechanisms Show Promising Performance: A Modelling Study

Farzad Fatehi, Richard J. Bingham, Pierre-Philippe Dechant, Peter G. Stockley, Reidun Twarock

评论： 经小修改后接受发表于《Scientific Reports》的版本

期刊参考： 科学报告，11，23847（2021）

主题： 定量方法 (q-bio.QM)