定量生物学

2021年08月 的作者和标题

[26] arXiv:2108.01974 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 扭曲DNA在热浴中的熔化过程 显示英文标题

标题： Melting process of twisted DNA in a thermal bath

O. Farzadian, T. Oikonomou, M. Moradkhani

评论： 10页；9图

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 软凝聚态物理 (cond-mat.soft) ; 统计力学 (cond-mat.stat-mech)

[27] arXiv:2108.01982 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 乙型肝炎病毒感感染的年龄结构模型突显了不同治疗策略的潜力 显示英文标题

标题： An age-structured model of hepatitis B viral infection highlights the potential of different therapeutic strategies

Farzad Fatehi, Richard J. Bingham, Eric C. Dykeman, Peter G. Stockley, Reidun Twarock

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[28] arXiv:2108.02060 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： CellProfiler Analyst 3.0：图像分析的可访问数据探索和机器学习 显示英文标题

标题： CellProfiler Analyst 3.0: Accessible data exploration and machine learning for image analysis

David R. Stirling, Anne E. Carpenter, Beth A. Cimini

评论： 5页，1图

期刊参考： 生物信息学，2021；btab634

主题： 定量方法 (q-bio.QM)

[29] arXiv:2108.02066 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 快速频率调制根据听众期望在人类皮层下听觉通路中编码 显示英文标题

标题： Fast frequency modulation is encoded according to the listener expectations in the human subcortical auditory pathway

Alejandro Tabas, Stefan Kiebel, Michael Marxen, Katharina von Kriegstein

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[30] arXiv:2108.02249 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 年龄结构多阶段细胞周期表示的等价框架 显示英文标题

标题： An equivalence framework for an age-structured multi-stage representation of the cell cycle

Joshua C. Kynaston, Chris Guiver, Christian A. Yates

评论： 作者接受版本

期刊参考： 物理评论E 105, 064411 (2022)

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 统计力学 (cond-mat.stat-mech) ; 定量方法 (q-bio.QM)

[31] arXiv:2108.02315 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 僵尸的起源：一种建模方法 显示英文标题

标题： On the origin of zombies: a modeling approach

Alisha Kumari, Elijah Reece, Kursad Tosun, Scott Greenhalgh

主题： 种群与进化 (q-bio.PE)

[32] arXiv:2108.02354 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 人工智能与诊断和治疗放射性药物发展的未来：计算机智能分子设计 显示英文标题

标题： Artificial intelligence and the future of diagnostic and therapeutic radiopharmaceutical development: in Silico smart molecular design

Bahar Ataeinia, Pedram Heidari

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 组织与器官 (q-bio.TO)

[33] arXiv:2108.02545 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 信息处理递归神经网络中的动力学相和共振现象 显示英文标题

标题： Dynamical Phases and Resonance Phenomena in Information-Processing Recurrent Neural Networks

Claus Metzner, Patrick Krauss

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 混沌动力学 (nlin.CD) ; 生物物理 (physics.bio-ph)

[34] arXiv:2108.02570 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 使用机器学习预测轻度创伤性脑损伤后综合征的结果 显示英文标题

标题： Predicting Post-Concussion Syndrome Outcomes with Machine Learning

Minhong Kim

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[35] arXiv:2108.02678 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 一种全球核酸观测站用于生物防御和行星健康 显示英文标题

标题： A Global Nucleic Acid Observatory for Biodefense and Planetary Health

The Nucleic Acid Observatory Consortium

主题： 基因组学 (q-bio.GN) ; 种群与进化 (q-bio.PE) ; 定量方法 (q-bio.QM)

[36] arXiv:2108.02706 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 结构确定 显示英文标题

标题： Structure determination

Halima Mouhib, Bas Stringer, Hugo van Ingen, Jose Gavaldá-García, Katharina Waury, Sanne Abeln, K. Anton Feenstra

评论： 本章是《蛋白质结构生物信息学导论》一书的一部分。前言 arxiv:1801.09442 中包含了所有（已发表）章节的链接

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[37] arXiv:2108.02742 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 一种用于von Willebrand因子展开的连续体模型 显示英文标题

标题： A continuum model for the unfolding of von Willebrand Factor

Mansur Zhussupbekov, Rodrigo Mendez Rojano, Wei-Tao Wu, Mehrdad Massoudi, James F. Antaki

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 生物物理 (physics.bio-ph) ; 流体动力学 (physics.flu-dyn)

[38] arXiv:2108.02810 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 限制对细菌种群扩散的影响 显示英文标题

标题： Influence of confinement on the spreading of bacterial populations

Daniel B. Amchin, Jenna A. Ott, Tapomoy Bhattacharjee, Sujit S. Datta

期刊参考： PLOS 计算生物学，18，e1010063（2022）

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 软凝聚态物理 (cond-mat.soft) ; 模式形成与孤子 (nlin.PS) ; 生物物理 (physics.bio-ph) ; 细胞行为 (q-bio.CB)

[39] arXiv:2108.03129 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 使用蒙特卡罗算术在神经影像学中准确模拟操作系统更新 显示英文标题

标题： Accurate simulation of operating system updates in neuroimaging using Monte-Carlo arithmetic

Ali Salari (1), Yohan Chatelain (1), Gregory Kiar (2), Tristan Glatard (1) ((1) Department of Computer Science and Software Engineering, Concordia University, Montréal, QC, Canada, (2) Center for the Developing Brain, Child Mind Institute, New York, NY, USA)

评论： 10页，4个图，19条参考文献

主题： 神经与认知 (q-bio.NC) ; 图像与视频处理 (eess.IV)

[40] arXiv:2108.03387 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 大脑中的系统性结构 显示英文标题

标题： The Structure of Systematicity in the Brain

Randall C. O'Reilly, Charan Ranganath, Jacob L. Russin

评论： 10页，2张图，提交至《当前心理科学方向》

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[41] arXiv:2108.03465 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于k-mer的SARS-CoV-2变异体识别方法 显示英文标题

标题： A k-mer Based Approach for SARS-CoV-2 Variant Identification

Sarwan Ali, Bikram Sahoo, Naimat Ullah, Alexander Zelikovskiy, Murray Patterson, Imdadullah Khan

评论： 已接受发表于“国际生物信息研究与应用研讨会（ISBRA），2021”

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[42] arXiv:2108.03515 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 改进minimap2比对准确性的新策略 显示英文标题

标题： New strategies to improve minimap2 alignment accuracy

Heng Li

主题： 基因组学 (q-bio.GN)

[43] arXiv:2108.03518 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 神经元活动的空间可表示性 显示英文标题

标题： Spatial representability of neuronal activity

D. Akhtiamov, A. G. Cohn, Y. Dabaghian

评论： 12页，5图

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[44] arXiv:2108.03532 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 学习方向：一种离散几何模型 显示英文标题

标题： Learning Orientations: a Discrete Geometry Model

Y. Dabaghian

评论： 17页，5图

主题： 神经与认知 (q-bio.NC)

[45] arXiv:2108.04008 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 缓慢扩张者通过在微生物菌落中形成凹陷前沿进行入侵 显示英文标题

标题： Slow expanders invade by forming dented fronts in microbial colonies

Hyunseok Lee, Jeff Gore, Kirill S. Korolev

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 软凝聚态物理 (cond-mat.soft)

[46] arXiv:2108.04077 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 半群的Cayley图在化学中的原子跟踪应用 显示英文标题

标题： Cayley Graphs of Semigroups Applied to Atom Tracking in Chemistry

Nikolai Nøjgaard, Walter Fontana, Marc Hellmuth, Daniel Merkle

主题： 分子网络 (q-bio.MN) ; 离散数学 (cs.DM)

[47] arXiv:2108.04090 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基因型与表型相互作用在生物量高粱中的分类与可视化 显示英文标题

标题： Classification and Visualization of Genotype x Phenotype Interactions in Biomass Sorghum

Abby Stylianou, Robert Pless, Nadia Shakoor, Todd Mockler

评论： 国际计算机视觉植物表型和农业问题研讨会（CVPPA）

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[48] arXiv:2108.04174 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 使用临床数据进行阿尔茨海默病痴呆进展建模的机器学习：系统文献综述 显示英文标题

标题： Machine learning for modeling the progression of Alzheimer disease dementia using clinical data: a systematic literature review

Sayantan Kumar, Inez Oh, Suzanne Schindler, Albert M Lai, Philip R O Payne, Aditi Gupta

评论： 10页，4图，3表

期刊参考： JAMIA Open，第4卷，第3期，2021年7月，ooab052

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)

[49] arXiv:2108.04176 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于外部知识的低同源蛋白质二级结构预测的自适应逐残差轮廓融合 显示英文标题

标题： Adaptive Residue-wise Profile Fusion for Low Homologous Protein SecondaryStructure Prediction Using External Knowledge

Qin Wang, Jun Wei, Boyuan Wang, Zhen Li1, Sheng Wang, Shuguang Cu

评论： 被IJCAI-21接受

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[50] arXiv:2108.04240 [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 基于卷积神经网络的流感血凝素蛋白序列分类 显示英文标题

标题： Classification of Influenza Hemagglutinin Protein Sequences using Convolutional Neural Networks

Charalambos Chrysostomou, Floris Alexandrou, Mihalis A. Nicolaou, Huseyin Seker

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 机器学习 (cs.LG)