定量生物学 > 定量方法
[提交于 2025年1月7日
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标题: 一种在混合模型中构建环境矩阵的框架
标题: A Framework for Building Enviromics Matrices in Mixed Models
摘要: 本研究介绍了一个构建环境组学矩阵的框架,用于混合模型中整合遗传和环境数据,以提高植物育种中的表型预测。 环境组学利用多种数据源,如气候和土壤,来表征基因型-环境(GxE)互作。 该方法在设计矩阵中采用块对角结构,以纳入不同试验中来自遗传和环境表型协变量的随机效应。 协方差结构通过遗传关系矩阵和表示环境表型效应的身份矩阵的Kronecker乘积进行建模,捕捉遗传和环境变异。 这种双重表示方法能够在不同环境中更准确地预测作物表现,改进育种计划中的选择策略。 该框架与现有的混合模型软件(包括rrBLUP和BGLR)兼容,并可扩展用于更复杂的互作。 通过结合遗传关系和环境影响,这种方法为推进GxE研究和加速改良作物品种的开发提供了一个强大的工具。
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